🧬 biology

Computational Simulations of Trigger-and-Inhibit Control Rules in Intussusceptive Pillar Morphogenesis

본 연구는 전산유체역학을 활용하여 내삽 기둥 형태 형성(intussusceptive pillar morphogenesis)이 가파른 벽 전단 응력 구배가 기둥 형성을 개시하는 동시에 높은 절대 벽 전단 응력이 이를 억제하는 '트리거 및 억제(trigger-and-inhibit)' 메커니즘에 의해 지배되며, 이로써 전단 응력의 공간적 분포가 미세혈관 재형성의 주요 동인임을 입증한다.

Nenad Filipovic, Akira Tsuda, Jennifer M. Pan, Jae Cho, Hassan A. Khalil, Maximilian Ackermann, Steven J. Mentzer2026-09-18
🧬 biology

Regulatory Evolution of TEM β-lactamases through Large-Scale Genomic Analysis Reveals Promoter Diversity and its Impact on β-lactam Resistance in Escherichia coli

본 연구는 60,000개 이상의 *Escherichia coli* 게놈에 대한 대규모 유전체 분석을 인과 추론 및 구조 모델링과 통합하여, 코딩 서열의 변이를 넘어선 *bla*<sub>TEM</sub> 프로모터 영역의 다양성이 β-락탐 내성 표현형에 유의미한 영향을 미친다는 것을 입증한다.

Srimathy Ramachandran, Snekha Arumugam Chandran, Suma Mohan S.2026-09-18
🧬 biology

spaGFM is a scalable graph foundation model for spatial transcriptomics analyses

이 논문은 무작위 보행(random walks)과 자기지도 학습을 활용하여 공간 전사체 데이터의 견고하고 전이 가능한 표현을 생성함으로써 다양한 생물학적 맥락에 걸친 복잡한 조직 구조와 기능적 결과를 분석할 수 있게 하는 확장 가능한 그래프 파운데이션 모델인 spaGFM을 소개한다.

Juexin Wang, Yu Zhong, Fei He, Xiaojie Jin, Yang Yu, Ricardo Melo Ferreira, Andrew Gunderson, Jordan Krull, Guangyu Wang (…)2026-09-18
🧬 biology

Uncovering Anti-Cancer Potential of Clausena anisata Bioactives via Network Pharmacology-Based Target Prediction, Virtual Screening, Docking, ADMET Analysis, and Molecular Dynamics Simulation

본 연구는 네트워크 약리학과 계산 과학적 접근법을 통합하여, 잠재적인 항암 치료를 위해 EGFR을 표적으로 하는 유망하고 안정적이며 약물 유사성이 높은 리드 화합물로서 *Clausena anisata* 유래의 아니솔락톤(Anisolactone)과 트리파시오올(Triphasiol)을 식별한다.

Priyanka Nath Mazumdar, Kaushik Kalita, Partha Pratim Dutta, Dhrubajyoti Gogoi, Nikhita Nina Bora, Manash Pratim Sarma2026-09-18
🧬 biology

Rethinking aerobic glucose metabolism in Saccharomyces cerevisiae: is glucose completely fermented to ethanol at high concentrations?

이 논문은 고농도 포도당 조건에서 *Saccharomyces cerevisiae*의 유산소 포도당 대사가 직접적인 호흡과 발효를 동시에 수반한다는 전통적인 견해에 이의를 제기하며, 대신 포도당이 초기에 에탄올로 완전히 발효된 후 이후에 에탄올 산화가 일어난다는 가설을 제안하고, 이 가설을 검증하기 위한 정량적 동위원소 추적 실험 설계를 개략적으로 설명한다.

David Barreras Martínez2026-09-18
🧬 biology

An Immuno-informatics Pipeline for Identification of Low-Risk Peptide Immunotherapy Candidates Across the Childhood Food Allergy Triad

본 연구는 낮은 HLA 결합력과 알레르기 유발 가능성을 가진 서열을 계산적으로 우선순위화함으로써 땅콩, 우유 및 달걀 알레르겐 전반에 걸쳐 면역 요법을 위한 23개의 저위험 펩타이드 후보를 성공적으로 식별한 통합 면역 정보학 파이프라인을 제시하며, 기존의 임상 후보 물질들을 통해 이 접근법을 검증하고 실험적 검증의 필요성을 강조한다.

Aditya Narayan, Ruchi Jain, Manish Kumar2026-09-18
🧬 biology

CAST as a Tumor-Specific Suppressor in Colorectal Cancer: Discovery Through Integrative Analysis of Unannotated Isoforms, Proteomics, and Epigenetic Regulation

단일 세포 롱리드 시퀀싱, 단백질체학, 그리고 후성유전학 데이터에 대한 통합적 분석을 통해, 본 연구는 CAST가 프로모터 탈메틸화를 통해 재활성화되고 miR-200 패밀리에 의해 조절되는 대장암 특이적 억제제임을 식별하며, 이는 주석이 달리지 않은 이소형(isoform)으로부터 치료 표적을 발견하기 위한 일반화 가능한 프레임워크를 구축한다.

alireza ebadi, Maryam Hashemi2026-09-18
🧬 biology

Molecular Targeting of UBR2 in Melasma Using Natural Compounds from Scutellaria baicalensis through Integrated Computational Approaches

본 연구는 통합된 계산적 접근 방식을 활용하여 황금(*Scutellaria baicalensis*)으로부터 페룰산(Ferulic acid)과 스컬캡플라본 II(Skullcapflavone II)를 기미 치료의 잠재적 후보로서 UBR2 타겟의 유망하고 안전하며 안정적인 억제제로 식별하였다.

Akhtar Veg, Faria Saleem, Romana Ishrat2026-09-18
🧬 biology

A Computational Cancer GWAS Screen Highlights Structural Variation at the 7q22.1 Locus Near STAG3

본 연구는 숏리드(short-read) 및 롱리드(long-read) 시퀀싱 데이터를 통합한 계산 스크리닝을 통해 암 GWAS 신호와 중첩되는 감수 분열 특이적 유전자 궤적에서 구조적 변이가 유의미하게 농축되어 있음을 보여주며, 특히 숏리드 시퀀싱만으로는 놓쳤을 7q22.1 대장암 감수성 로커스 내 *STAG3* 유전자 인근의 새로운 442 bp 결실을 후보 드라이버로 식별하였다.

Koushik Chowdhury2026-09-18
🧬 biology

The Changing Landscape of Genetic Risk: Age-Related Effects of Polygenic Scores for Suicidal Behaviors

Add Health 코호트를 대상으로 한 이 연구는 자살 생각 및 시도에 대한 다유전자 위험 점수가 청소년기가 아닌 청년기 및 초기 중년기에만 결과와 완만하지만 유의미한 연관성을 보인다는 점을 밝혀냈으며, 이는 성인 데이터를 기반으로 한 현재의 유전적 위험 모델이 발달 단계별 특이적 위험을 포착하지 못할 수 있음을 시사하고 표적 예방 전략을 개선하기 위한 연령 층화 전전체 게놈 연관 분석의 필요성을 강조한다.

Nathan Gillespie, Severine Lannoy, Mallory Stephenson, Robert Kirkpatrick, Zuriel Ceja, Miguel Renteria, Alexis C. Edwar (…)2026-09-17