375 papers
Deze studie onthult via cryo-EM de structurele basis voor de remming van het helicase-primasecomplex van humaan herpesvirus 1 door amenamevir en pritelivir, die het complex in een inactieve conformatie vastzetten en zo een raamwerk bieden voor de ontwikkeling van nieuwe antivirale middelen.
In deze studie wordt de ontdekking van flavophos, een fosfonaat-antimicrobiële verbinding geproduceerd door *Burkholderia* die lumazinesynthase inhibeert, beschreven, waarbij de biosynthetische route en het unieke enzymatische mechanisme van het betrokken DUF849-enzym worden opgehelderd.
Dit onderzoek toont aan dat de dynamische interactie van het Chi-subunit met zowel SSB als de YoaA-helicase, los van de DNA-polymerase III-holo-enzymcomplex, essentieel is voor AZT-tolerantie en dat het vastkoppelen van Chi aan Psi via een fusie-eiwit deze regulatie verstoort.
SpecReBoot is een statistisch framework dat de betrouwbaarheid van moleculaire netwerken op basis van massaspectra verbetert door bootstrap-resampling toe te passen, waardoor onbetrouwbare verbindingen worden verwijderd en verborgen chemische relaties worden onthuld, zoals geïllustreerd door de ontdekking van een nieuw macrolacton-structuur.
Dit onderzoek toont aan dat plasmalogenen niet essentieel zijn voor de integriteit van het netvlies en vruchtbaarheid bij muizen, aangezien muizen met een selectief plasmalogen-tekort (Peds1-knockout) ondanks een volledig afwezig vinyl-ether-verbinding geen cataracten of onvruchtbaarheid vertonen, wat suggereert dat plasmanyl-lipiden deze ernstige symptomen van totale etherlipiden-tekorten kunnen compenseren.
Deze studie identificeert voor het eerst een diverse set van menselijke en muizen-eiwitten die specifiek de symmetrie van 5-formylcytosine (fC) in DNA herkennen of juist negeren, wat nieuwe inzichten biedt in de rol van deze epigenetische modificatie in chromatineregulatie.
Dit onderzoek onthult hoe TFAM-gemedieerde DNA-buiging een stimulerende interactie tussen PolRMT en het upstream-regulatorische gebied mogelijk maakt, terwijl de afwezigheid van TFAM een auto-inhiberende interactie via de tether-helix activeert die de specificiteit van mitochondriale transcriptie waarborgt.
Deze studie onthult via cryo-EM en mutagenese dat een nieuw allosterisch bindingspunt nabij helix 8 van de receptor GPR84, dat wordt gemoduleerd door PSB-16671, Gi-biased signaaloverdracht en verbeterde fagocytose van kankercellen mogelijk maakt door een specifieke conformatiestabilisatie die β-arrestine-recruiting voorkomt.
Deze studie introduceert een nanobody-gebaseerde immunoprecipitatie gekoppeld aan native massaspectrometrie om endogene eiwitcomplexen in menselijk en muizenhersenweefsel te analyseren, waarbij een toename van mGluR2/3-heterodimeren in de orbitofrontale cortex bij depressie en suïcide wordt ontdekt, wat een directe moleculaire link tussen receptororganisatie en gedrag aangeeft.
Dit onderzoek toont aan dat fosforylering van UBE2J1 op serine S184 de replicatie van het Vesiculaire Stomatitis Virus en de vorming van celsyncytia bevordert, waarbij niet-ER-gelocaliseerde vormen van het eiwit de grootste fusie-activiteit vertonen.
Dit onderzoek toont aan dat het cytoplasmatische eiwit TCF25 de stabiliteit van GPRASP2 reguleert en een functionele interactie aangaat met membraangeassocieerde componenten, wat nieuwe inzichten biedt in zijn rol bij proteostase en ziekte.
De studie onthult dat het BrxC-eiwit uit het BREX-faagbeveiligingssysteem via ATP-gereguleerde zelfassociatie en competitieve complexvorming met BrxB en PglZ de balans tussen gastheer-methylering en faag-restrictie reguleert.
Deze studie toont aan dat de ureum-gradiënt nanoDSF-methode de thermische stabiliteit van kinetisch stabiele hyperthermofiele eiwitten, zoals Pfu DNA-polymerase, betrouwbaar kan bepalen door de kinetische barrières voor ontvouwing te overwinnen die onder native omstandigheden metingen onmogelijk maken.
Deze studie presenteert een enzymatische ligatiestrategie waarbij korte, chemisch gemodificeerde DNA-oligonucleotiden als signaalversterkers aan RNA worden gekoppeld, waardoor de ionisatie-efficiëntie en LC-MS/MS-gevoeligheid voor RNA-oligonucleotiden aanzienlijk worden verbeterd.
De studie valideert dat drie sterk gemuteerde, in E. coli geproduceerde menselijke serumalbumine-varianten hun native structuur behouden en vergelijkbare functionele eigenschappen vertonen, zoals FcRn-gemedieerde recycling en ligandbinding, waardoor ze veelbelovende, dier-vrije alternatieven vormen voor therapeutische toepassingen.
Deze studie toont aan dat het atypische peroxiredoxine RvPrxL uit de tardigrade *Ramazzottius varieornatus* zijn klassieke enzymatische functie heeft verloren en is neofunctionaliseerd tot een nucleïnezuur-bindend eiwit dat via een unieke 20-mer structuur en een specifiek N-terminaal domein in de kern wordt gelokaliseerd.
Dit artikel onthult dat de prokaryotische ligase PafA een breed scala aan substraatproteïnen herkent voor afbraak door het pup-proteasoomsysteem via een dynamisch ensemble van structuren dat geometrische compatibiliteit mogelijk maakt in plaats van specifieke sequentie-interacties.
HyperLab is een door HITS ontwikkeld, gebruiksvriendelijk AI-platform dat de drugontdekking versnelt door geavanceerde methoden zoals Hyper Binding en Hyper Screening te combineren met een intuïtieve interface, waardoor onderzoekers zonder specialistische kennis binnen 24 uur experimenteel gevalideerde, potentiele geneesmiddelen kunnen identificeren en optimaliseren.
Dit onderzoek toont aan dat monoubiquitineren van H2A.Z een centrale rol speelt in de globale transcriptiesilencing door associatie met diverse repressieve chromatinetoestanden, waaronder gemethyleerde CpG-eilanden en homopurine/homopyrimidine-sequenties.
Dit onderzoek toont aan dat machine learning-modellen ionisatie-afhankelijke verdeling, gekwantificeerd via logD, identificeren als de bepalende factor voor de partitionering van kleine moleculen in biomoleculaire condensaten, waarbij tweedimensionale fysisch-chemische eigenschappen voldoende zijn om dit gedrag te voorspellen.