375 papers
Deze studie karakteriseert twaalf ferredoxine-isoformen in *Synechocystis* sp. PCC 6803 door middel van spectroscopie, elektrochemie en expressieprofielanalyse, waardoor een onderscheid wordt gemaakt tussen kernferredoxines voor fotosynthetische elektronentransfer en gespecialiseerde varianten die bijdragen aan de handhaving van de rodeo-homeostase onder wisselende omgevingsomstandigheden.
Deze studie presenteert een methode om infectieuze prionen te genereren die specifiek gemodificeerd kunnen worden met click-chemie door tryptofaan 99 te vervangen door p-azido-L-fenylalanine, waardoor de biochemische en biologische basis van prioninfectiviteit directer bestudeerd kan worden.
Deze studie introduceert een nieuwe, gevoelige semi-kwantitatieve HPLC-MS/MS-methode voor het uitgebreide profileren van isoprenoïde chinonen in complexe biologische monsters, wat inzicht biedt in bacteriële gemeenschapsverschuivingen in afvalwater en nieuwe mogelijkheden biedt voor microbiële ecologie en milieubio-monitoring.
Dit onderzoek onthult dat het mitotische spindelregulerende eiwit Mud homotypische condensaten vormt die een vloeibaar-vast fase-overgang ondergaan door oligomerisatie, een proces dat door fosforylering wordt omgekeerd en dat ook bij andere spindeleiwitten voorkomt.
Dit onderzoek onthult dat dihydroxy-enonetype eiwitgebonden ceramiden, die ontstaan door hydrolyse van epoxy-enonetype ceramiden, de dominante vorm in de menselijke hoornlaag vormen en een fundamenteel verschil met muizenhuid vertegenwoordigen, waarbij het enzym EPHX3 een sleutelrol speelt in deze omzetting.
Dit onderzoek onthult de structurele dynamiek en het werkingsmechanisme van het *Staphylococcus aureus* QacA-effluxpomp, waarbij kristalstructuren in verschillende conformaties en functionele studies inzicht geven in hoe dit transporterproteïne een breed scala aan geneesmiddelen herkent en uitslijt via proton-gekoppelde conformatieveranderingen, wat een fundament vormt voor het ontwikkelen van nieuwe remmers tegen bacteriële multiresistentie.
Dit onderzoek onthult dat het responsregulatordomein van BqsR in *Pseudomonas aeruginosa* direct ijzer (Fe2+) bindt via een histidine-rijk motief om de transcriptie van het Fe2+-transportgen *feo* te reguleren, een tot nu toe ongekend mechanisme dat een potentieel therapeutisch doelwit biedt voor de bestrijding van ziekenhuisinfecties.
Dit artikel beschrijft een gedetailleerd protocol voor het gebruik van de Spitrobot-crystalplunger om enzymatische reactie-intermediaten in milliseconden te vangen via cryo-trapping, waardoor structurele inzichten mogelijk worden op conventionele synchrotronstralenbronnen zonder de complexiteit van kamertemperatuur-tijdopgeloste kristallografie.
Dit onderzoek toont aan dat scyllo-inositol, een inositol-isomeer met een slecht begrepen biologische functie, in mammale cellen wordt opgenomen en wordt ingebouwd in fosfatidylinositolen, wat wordt aangetoond met behulp van een nieuw ontwikkelde [13C6]-gelabelde tracer.
Deze systematische review concludeert dat de huidige bewijsbasis structureel ontoereikend is om NMN en NR betrouwbaar met elkaar te vergelijken voor metabole uitkomsten vanwege fundamentele verschillen in dosering, populatie en meetmethodieken, waardoor toekomstige studies gestandaardiseerde protocollen vereisen.
Dit onderzoek beschrijft voor het eerst de steady-state kinetiek van de endopeptidase-activiteit van het *Candida albicans*-eiwit Gpi8 en onthult dat Mn²⁺ de enzymatische activiteit verhoogt door de binding van het substraat te verbeteren en de eiwitstructuur te stabiliseren, waardoor een flexibele lus de katalytische cysteïne in staat stelt het cleavagepunt te positioneren.
Deze studie presenteert een ultrasensitieve en selectieve biosensor op basis van conische SiO2-nanoporen die, na covalente immobilisatie van antilichamen, harttype-vetzuren-bindend proteïne (H-FABP) kan detecteren tot in het attomolaire bereik met een detectiegrens van ongeveer 0,4 aM, terwijl het systeem bovendien herbruikbaar is.
Dit onderzoek gebruikt tijdopgeloste cryo-EM om te tonen dat de binding van acetyl-CoA aan isocitraatlyase 2 uit *Mycobacterium tuberculosis* via een conformatie-selectiemodel leidt tot asymmetrische, half-site activiteit door de evenwichtsverschuiving naar een actieve toestand.
Moleculaire dynamica-simulaties tonen aan dat anionisch SDS de structuur van het cationische Trp-cage-eiwit destabiliseert door hydrofobe interacties, terwijl cationisch CTAB bij hoge concentraties juist bescherming biedt tegen thermische denaturatie door elektrostatische afstoting en het vormen van een gestructureerde hydrofobe omgeving.
Deze studie toont aan dat het invriezen van RhoGEF-enzymen onvoorspelbare en aanzienlijke gevolgen heeft voor hun activiteit en data-variabiliteit, zelfs wanneer hun thermostabiliteit en globale structuur grotendeels behouden blijven, wat aangeeft dat er geen universele cryoprotectant bestaat en dat invriezen per eiwit zorgvuldig moet worden gekarakteriseerd.
Dit onderzoek identificeert voor het eerst acht kleine moleculen die de essentiële ClpC/ClpP-protease van *Staphylococcus aureus* chemisch kunnen activeren door te binden aan specifieke regulatoire sites in het N-terminale domein, wat een nieuwe weg opent voor de ontwikkeling van antibacteriële geneesmiddelen.
NPannotator is een geautomatiseerde, genomisch en chemisch geconstrueerde pipeline die de katalytische volgorde van type I polyketidesynthase-domeinen en de substraatspecificiteit van acyltransferase-domeinen infereert door synthetisch gegenereerde polyketide-ruggengraten te vergelijken met doelwit-natuurproducten, waardoor een aanzienlijke stap wordt gezet in het ontcijferen van de relatie tussen genoomarchitectuur en chemische structuur.
Dit onderzoek onthult de moleculaire basis en hiërarchische bindingsdeterminanten waarmee het CIA-doelwitcomplex cytosolische ijzer-zwavel eiwitten selectief herkent via hun C-terminale TCR-motief, waarbij een aromatische pocket en hydrofobe groef op het Cia2-eiwit een cruciale rol spelen.
Deze studie toont aan dat endogene nucleofiele metabolieten zoals taurine, spermidine en ethanolamine reageren met reactieve acyl-species om koolstofstress te neutraliseren, waardoor abnormale eiwitacylering wordt voorkomen en de levensduur kan worden verlengd.
Dit onderzoek toont aan dat faseafscheiding van het eiwit TDP-43 zijn interactiepartnerproteïnen en de regulatie van alternatieve splicing beïnvloedt, waardoor het direct en indirect de RNA- en eiwithomeostase controleert.