⚗️ Category

biochemistry

338 papers

Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.

Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.

⚗️ biochemistry

Interplay of stability and dynamics in the optimization of a highly proficient de novo enzyme

Deze studie onthult dat het optimaliseren van een hoogwaardig de novo enzym vereist dat een evenwicht wordt gevonden tussen globale ruggengraatstabiliteit en gelokaliseerde actieve-plaatsdynamiek, wat wordt bereikt door een combinatie van nauwkeurig computationeel ontwerp en gerichte evolutie om katalytische residuen uit te lijnen, de overgangstoestand te stabiliseren en substraatbinding af te stemmen.

Bhattacharya, S., Adornato, G. M., Chen, Y., Huang, X., Mouloud, W. E. Y., Jo, H., Volkov, A. N., Korendovych, I. V., Ya (…)2026-09-10
⚗️ biochemistry

A hydrogenase-like activity associated with mitochondrial Complex I under hypoxia in vascular plants

Deze studie identificeert een mitochondriaal Complex I-geassocieerde hydrogenase-achtige activiteit in vaatplanten onder hypoxie, waarbij een model wordt voorgesteld waarin een specifieke Complex I-assemblatietoestand (CI*) NADH consumeert om waterstof te evolueren, waardoor het dient als een redox-uitlaat die NAD+ regenereert en potentieel de accumulatie van reactieve zuurstofcomponenten dempt.

zhang, x., zhang, z., zhang, x., liu, m., Li, y., zhao, p., xie, f., ma, x.2026-09-10
⚗️ biochemistry

A pseudohelicase-centered complex couples assembly-dependent RNA cleavage to poly(UG)ylation

Deze studie onthult dat het CPUG-complex in *C. elegans* RNA-interferentie coördineert door gebruik te maken van de pseudohelicase MUT 15 om een autoinhiberende RDE 8-nucleasemodule te assembleren en te activeren voor RNA-splitsing, terwijl deze activiteit tegelijkertijd wordt gekoppeld aan poly(UG)ylering door MUT 2 om directionele verwerking te waarborgen en herhaalde splitsing te voorkomen.

Busetto, V., Brehm, M., Sgromo, A., Mager, M., Pshanichnaya, L., Becker, E. C. A., Ketting, R. F., Ameres, S. L., Falk (…)2026-09-08
⚗️ biochemistry

Redox Control of S-sulfocysteine Formation in Adenosine Phosphosulfate Reductase

Deze studie onthult dat in de adenosine 5'-fosfosulfaatreductase van *Pseudomonas aeruginosa*, de redoxstatus van de [4Fe-4S]-cluster de katalytische efficiëntie reguleert door de conformatie van het actieve centrum en de nucleofiele aanval van C256 te moduleren, een mechanisme dat gevalideerd is via multiscale moleculaire simulaties die overeenstemmen met experimentele kinetiek.

Ymeraj, M., Ramos-Guzman, C. A., Hanzevacki, M., Elisi, G. M., Bottegoni, G., Mulholland, A. J.2026-09-08
⚗️ biochemistry

Conformational gating of product release sets the catalytic ceiling of a bioluminescent reporter

Door de conformationele gating van productvrijgave te identificeren als de primaire flessenhals die de katalytische efficiëntie van Renilla-luciferase beperkt, vestigt deze studie een mechanistisch kader voor het ontwerpen van de volgende generatie bioluminescente reporters met verbeterde stabiliteit en signaadduur.

Toul, M., Horackova, J., Schenkmayerova, A., Planas-Iglesias, J., Landolt, T., Sucharitakul, J., Janin, Y., Prakinee, K. (…)2026-09-07
⚗️ biochemistry

A High-Throughput Assay to Identify Specific Nascent Chain Inhibitors

Dit artikel presenteert een robuuste, goedkope, hoogdoorvoedsassay die gebruikmaakt van een menselijk in vitro transcriptie/translatiesysteem om kleine moleculen te screenen die specifiek onbehandelbare eiwitten in hun nascente ketenvorm remmen, waarbij de gevoeligheid en statistische kwaliteit van het platform succesvol zijn gevalideerd ondanks het niet identificeren van selectieve remmers in initiële screens van de KRAS A146T- en ApoC3-doelwitten.

Fischer, P. D., Hiller, S.2026-09-06
⚗️ biochemistry

From genome to function: Identification and characterization of bifunctional pyrophosphate-fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase from Candidatus Liberibacter asiaticus

Deze studie valideert biochemisch dat de bifunctionele pyrofosfaat-fructose-6-fosfaat 1-fosfotransferase (PFP) van *Candidatus* Liberibacter asiaticus zowel de conversie van fructose-6-fosfaat als van sedoheptulose-7-fosfaat katalyseert, waardoor de glycolyse en de pentosefosfaatroute in dit pathogeen met een verstoord centraal koolstofmetabolisme worden overbrugd.

KP, S., Arun, E., Rathore, K., Gubyad, M., Ghosh, D. K., Sharma, A. K., Singla, J.2026-09-04
⚗️ biochemistry

Targeting Dengue Virus NS3 Helicase: Biochemical and Computational Evaluation of Catechins from Camellia sinensis as Potential Therapeutic Leads

Deze studie toont aan dat gegalloyleerde catechinen uit *Camellia sinensis*, met name EGCG en ECG, fungeren als krachtige remmers van het Denguevirus NS3-helicase via een specifiek bindingsmechanisme aan een amfipatische RNA-bindingspocket, zoals gevalideerd door zowel biochemische assays als computationele moleculaire dynamica-simulaties.

Wojciechowski, M. K., Goyzueta-Mamani, L. D., Chavez-Fumagalli, M. A., D'Antonio, E. L.2026-09-03
⚗️ biochemistry

Hierarchical cysteine oxidation controls reversible amyloid formation in an ankyrin repeat protein

Deze studie onthult dat de zebrafish-kinase-remmer drP18 een hiërarchische, reversibele redoxschakelaar ondergaat waarbij het regulatoire cysteïne C50 de oxidatieafhankelijke vorming en assemblage van functionele amyloïdefibrillen via het executor-cysteïne C128 controleert, waardoor de biologische activiteit van het eiwit in reactie op specifieke oxidanten wordt gemoduleerd.

Sethi, A., Darroch, H., Magon, N. J., Greene, G., Connor, K. M. O., Botha, A. D., Gray, S. G., Cordovez, P. d., Coldicot (…)2026-09-03
⚗️ biochemistry

High-Throughput Screening Identifies Small-Molecule Inhibitors of the Tau-LRP1 Interaction

Deze studie vestigt een kwantitatief screeningskader om kleine molecuul-remmers te identificeren die de LRP1-gemedieerde cellulaire opname van tau verstoren, waarmee deze interactie wordt gevalideerd als een aanvatbaar doelwit voor de behandeling van tauopathieën zoals de ziekte van Alzheimer.

Wang, C., Ma, C.-T., Crotty, C., Zeng, F.-Y., Bobkov, A., Covel, J. A., Keane Rivera, E., Sergienko, E., Kosik, K. S., O (…)2026-09-02