285 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Deze studie toont aan dat de ureum-gradiënt nanoDSF-methode de thermische stabiliteit van kinetisch stabiele hyperthermofiele eiwitten, zoals Pfu DNA-polymerase, betrouwbaar kan bepalen door de kinetische barrières voor ontvouwing te overwinnen die onder native omstandigheden metingen onmogelijk maken.
Dit onderzoek toont aan dat machine learning-modellen ionisatie-afhankelijke verdeling, gekwantificeerd via logD, identificeren als de bepalende factor voor de partitionering van kleine moleculen in biomoleculaire condensaten, waarbij tweedimensionale fysisch-chemische eigenschappen voldoende zijn om dit gedrag te voorspellen.
Deze studie karakteriseert twaalf ferredoxine-isoformen in *Synechocystis* sp. PCC 6803 door middel van spectroscopie, elektrochemie en expressieprofielanalyse, waardoor een onderscheid wordt gemaakt tussen kernferredoxines voor fotosynthetische elektronentransfer en gespecialiseerde varianten die bijdragen aan de handhaving van de rodeo-homeostase onder wisselende omgevingsomstandigheden.
Deze studie introduceert een nieuwe, gevoelige semi-kwantitatieve HPLC-MS/MS-methode voor het uitgebreide profileren van isoprenoïde chinonen in complexe biologische monsters, wat inzicht biedt in bacteriële gemeenschapsverschuivingen in afvalwater en nieuwe mogelijkheden biedt voor microbiële ecologie en milieubio-monitoring.
Dit onderzoek onthult dat dihydroxy-enonetype eiwitgebonden ceramiden, die ontstaan door hydrolyse van epoxy-enonetype ceramiden, de dominante vorm in de menselijke hoornlaag vormen en een fundamenteel verschil met muizenhuid vertegenwoordigen, waarbij het enzym EPHX3 een sleutelrol speelt in deze omzetting.
Deze systematische review concludeert dat de huidige bewijsbasis structureel ontoereikend is om NMN en NR betrouwbaar met elkaar te vergelijken voor metabole uitkomsten vanwege fundamentele verschillen in dosering, populatie en meetmethodieken, waardoor toekomstige studies gestandaardiseerde protocollen vereisen.
Dit onderzoek gebruikt tijdopgeloste cryo-EM om te tonen dat de binding van acetyl-CoA aan isocitraatlyase 2 uit *Mycobacterium tuberculosis* via een conformatie-selectiemodel leidt tot asymmetrische, half-site activiteit door de evenwichtsverschuiving naar een actieve toestand.
Moleculaire dynamica-simulaties tonen aan dat anionisch SDS de structuur van het cationische Trp-cage-eiwit destabiliseert door hydrofobe interacties, terwijl cationisch CTAB bij hoge concentraties juist bescherming biedt tegen thermische denaturatie door elektrostatische afstoting en het vormen van een gestructureerde hydrofobe omgeving.
Dit onderzoek identificeert voor het eerst acht kleine moleculen die de essentiële ClpC/ClpP-protease van *Staphylococcus aureus* chemisch kunnen activeren door te binden aan specifieke regulatoire sites in het N-terminale domein, wat een nieuwe weg opent voor de ontwikkeling van antibacteriële geneesmiddelen.
NPannotator is een geautomatiseerde, genomisch en chemisch geconstrueerde pipeline die de katalytische volgorde van type I polyketidesynthase-domeinen en de substraatspecificiteit van acyltransferase-domeinen infereert door synthetisch gegenereerde polyketide-ruggengraten te vergelijken met doelwit-natuurproducten, waardoor een aanzienlijke stap wordt gezet in het ontcijferen van de relatie tussen genoomarchitectuur en chemische structuur.