238 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Deze studie identificeert FG214 uit *Fimbriimonas ginsengisoli* als een novel heme-bindende één-component-schakelaar die via redox-gemedieerde conformatieveranderingen overgaat van monomeer naar homodomeer, waardoor de DNA-binding wordt geactiveerd en het potentieel heeft als biosensor.
In deze studie worden nitrilobacillines, een nieuwe klasse van ribosomaal gesynthetiseerde en post-translationeel gemodificeerde peptiden (RiPP's), geïdentificeerd en gekarakteriseerd, waarbij een unieke biosynthetische route wordt onthuld die leidt tot de vorming van C-terminale nitrilgroepen en stereoselectieve hydroxyleringen, resulterend in een cysteïneprotease-remmer met een warhead die vergelijkbaar is met die van synthetische therapeutica zoals Paxlovid.
Dit onderzoek toont aan dat het modulaire uitwisselen van β-vat-domeinen in α-hemolysine een effectieve strategie is om nieuwe nanoporen te creëren met verbeterde eigenschappen voor het detecteren en onderscheiden van biomoleculen zoals DNA, RNA en eiwitten.
Dit onderzoek combineert farmacologische profilering en genoomediting om paraloog-specifieke doelen voor fosfatidischzuur-generatie tijdens PLC-signalerings te identificeren, waarbij wordt aangetoond dat remming van zowel DGKalpha als PLDs noodzakelijk is voor een effectieve reductie van PA-niveaus.
Deze studie presenteert een vaste-fase synthese-strategie voor fluorogene ProTide-probes die een ultrasensitieve, systematische profilering van carboxypeptidase-activiteit mogelijk maakt en specifieke enzymatische signatures als diagnostische biomarkers voor pancreaskanker in menselijk bloed onthult.
Deze studie beschrijft de ontdekking en karakterisering van een selectieve kleine molecule-inhibitor met een dubbel thio-barbituraat-indool-skelet die het CHIKV nsP3 macrodomein doelwit door middel van een cryptisch bindingspocket, wat een veelbelovende uitgangspunt biedt voor de ontwikkeling van antivirale middelen tegen Chikungunya-virus.
Dit onderzoek onthult de kristalstructuur en bifunctionele enzymatische activiteit van ORF11, een staartspike-lysin van het Minhovirus SHEF14 dat zowel als N-acetylglucosaminidase als D,D-endopeptidase werkt om de celwand van het klinisch relevante pathogeen *Enterococcus faecium* af te breken.
Deze studie toont aan dat lysosomale cysteïne-cathepsines via reverse proteolyse niet alleen eiwitten afbreken, maar ook niet-genomisch geprogrammeerde fusiepeptiden synthetiseren die een rol kunnen spelen in de pathogenese van Type 1-diabetes.
In deze studie wordt voor het eerst een continue in-vitro FRET-assay gepresenteerd die de cholesterolyse-activiteit van de SHhC-domeinen van de werveldieren *Xenopus laevis* en *Danio rerio* kwantificeert, waarbij de hoge stereospecificiteit voor cholesterol, de remmende werking van bepaalde detergentia en de chemische redding van de D46A-mutatie door hyper-nucleofiele sterolen worden aangetoond.
In deze studie wordt aangetoond dat het omleiden van methanol-dissimilatie in *Komagataella phaffii* naar het alcoholdehydrogenase-enzym (Adh2) de koolstofefficiëntie aanzienlijk verbetert, wat leidt tot een hogere biomassa-opbrengst en een verhoogde productie van organische zuren zoals itaconinezuur en melkzuur.