338 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Door de hydrofobe pocket van arylmalonaatdecarboxylase (AMDase) te engineeren, hebben onderzoekers succesvol het substraatspectrum uitgebreid om (R)-enantiomeren van sterisch gehinderde alfa-aryl- en alfa-alkenylcarbonzuren te synthetiseren met uitzonderlijke enantiopuurheid.
Deze studie toont aan dat de chemische aard van covalente warheads in BTK-remmers, specifiek 2-butynamide versus acrylamide, de conformationele dynamiek en signaalefficiëntie van het eiwit actief moduleert in plaats van slechts als inert bevestigingsgroep te fungeren, waardoor de prestaties van de remmer en potentiële resistentiemechanismen worden beïnvloed.
Deze studie toont aan dat evolutionair geconserveerde amyloïdaggregatie in de PACAP-peptidefamilie strikt wordt gereguleerd door heparine-gevoelige lysine/arginine-gatekeeperresiduen, die fungeren als conditionele schakelaars om functionele fibrilvorming in secretorische granula mogelijk te maken ondanks aanzienlijke sequentiedivergentie ten opzichte van de glucagonfamilie.
Deze studie toont aan dat S-glutathionylering van ARHGEF7 op het C312-residu de binding aan en activatie van Rac1 versterkt, waardoor kankercel-migratie en -invasie worden aangedreven via de Rac1-PAK1-LIMK1/MEK1-signaleringsas als reactie op oxidatieve stress en EGF.
Deze studie toont aan dat purinenucleotiden fungeren als endogene metabole lijm die het enzym PPAT aan zijn remmer NUDT5 vastzet om de purinebiosynthese te reguleren via voedselwaarneming, een mechanisme dat thiopurinechemotherapeutica met verhoogde potentie benutten door unieke oriëntaties aan te nemen binnen aanpasbare bindingszakken.
Deze studie toont aan dat de beschikbaarheid van methionine, en niet de abundantie van S-adenosylmethionine (SAM), fungeert als het primaire metabole signaal dat de accumulatie van MAT2A in de kern en de daaropvolgende chromatinhermodellering activeert om stressrespons- en aangeboren immuunpaden tijdens voedseltekort aan te drijven.
Deze studie toont aan dat co-sedimentatie met het adapterproteïne NUB1L een hoogwaardige MAS NMR-structurele analyse mogelijk maakt van het wild-type, intrinsiek ongeordende FAT10 N-domein, en onthult dat dit een vage complex vormt dat identiek is aan zijn gestabiliseerde variant, terwijl de N-terminus wordt gepositioneerd voor proteasomale degradatie.
Met behulp van de novo-ontwerp van eiwitten creëerden onderzoekers een integrine-onafhankelijke Tie2-agonist die bevestigt dat integrine-interactie niet vereist is voor receptoractivatie maar essentieel is voor het verlengen van de signaalduur, terwijl tegelijkertijd een krachtige therapeutische werkzaamheid wordt aangetoond in een muismodel van acuut respiratoir distresssyndroom.
De auteurs ontwikkelden HYlight2, een verbeterde genetisch gecodeerde sensor voor fructose-1,6-bisfosfaat die aanzienlijk verhoogde gevoeligheid biedt en in vivo beeldvorming van glycolytische flux in diverse weefsels en organismen mogelijk maakt, waaronder neuronen, pancreatische eilandjes en de lever.
De G23S-mutatie in β-glucosidase B van *Paenibacillus polymyxa*, voorspeld via Foldit-modellering en de Design to Data-database, verhoogt de katalytische efficiëntie en de maximale reactiesnelheid met respectievelijk ongeveer twee- en veertienvoud, met slechts een minimaal verlies aan thermische stabiliteit.