High Resolution Multi-Pass Astral Analyzer Quantification Enables Highly Multiplexed 35-Plex Tandem Mass Tag Proteomics

Dit artikel beschrijft een nieuwe TMT HR-modus op het Orbitrap Astral Zoom-massaspectrometer die door middel van een multi-pass-beweging de resolutie aanzienlijk verhoogt, waardoor nauwkeurige 35-plex TMT-proteomische analyses mogelijk worden met een diepgang die vergelijkbaar is met de gouden standaard Orbitrap MS3-methode.

Stewart, H., Shuken, S. R., Rathje, C. + 24 more2026-02-26⚗️ biochemistry

Systems Analysis of Carboxylate Transport and Oxidation Pathways in Cardiac Mitochondria

Dit onderzoek combineert experimenten en computationele modellering om de interacties tussen substraattransport, TCA-cycluskinetiek en oxidatieve fosforylering in cardiale mitochondriën te analyseren, waarbij nieuwe inzichten worden verkregen in de regulatie van pyruvaatdehydrogenase en de rol van ROS-geactiveerde uncoupling bij succinaat-gedreven respiratie.

Collins, N. L., Dasika, S., Van den Bergh, F. + 2 more2026-02-26⚗️ biochemistry

Breaking Barriers: Transitioning from X-ray Crystallography to Cryo-EM for Structural Studies

Dit artikel beschrijft de overgang van een laboratorium van röntgenkristallografie naar cryo-elektronenmicroscopie voor het bestuderen van het chromatine-regulerende eiwit ATAD2B, waarbij praktische inzichten worden geboden over het overwinnen van uitdagingen bij sample-preparatie, data-verwerking en modelbouw voor nieuwe gebruikers.

Zafar, H., Malone, K. L., Singh, A. K. + 2 more2026-02-25⚗️ biochemistry

Resurrecting Full-length Ancestral Schizorhodopsins and Heliorhodopsins with Structure-guided, Indel-aware Sequence Reconstruction

Dit artikel beschrijft de succesvolle reconstructie en experimentele validatie van volledige, stabiele voorouderlijke schizorhodopsines en heliorhodopsines door een structuregeleide, indel-bewuste methode toe te passen die ambiguïteiten in uitlijningen oplost en zo de evolutie van extra-membraanstructuren naast de 7TM-kern direct testbaar maakt.

Ishikawa, H., Mizutani, Y.2026-02-24⚗️ biochemistry

Change in topological linking number during Xer recombination at the plasmid pSC101 psi site

Dit artikel toont aan dat de XerC/XerD-recombinatie op het psi-locus van plasmide pSC101 gepaard gaat met een toename van de topologische koppelingsgetal met +4, wat resulteert in de vorming van een specifiek catenaan en een reactiemechanisme ondersteunt waarbij antiparallel uitgelijnde sites via een Holliday-junctie-intermediair vier negatieve supercoils omzetten in koppelingsknooppunten.

Provan, J. I., Tomatcheva, A. O., Sherratt, D. J. + 1 more2026-02-24⚗️ biochemistry