338 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Deze studie identificeert nieuwe taxaan-deacetylasen (T13dA1, T13dA2 en T79dA) die het biosynthetische pad van paclitaxel opnieuw afbakenen als een complex netwerk, waardoor de succesvolle reconstructie van een hoge opbrengst aan baccatine III-productie in *Nicotiana benthamiana* mogelijk wordt via geïntegreerde 18- en 19-genenpaden.
Deze studie toont aan dat de fosfatase PPM1B gebruikmaakt van een trinucleair metaalcentrum, waarbij een derde metaalion (M3) het substraat direct coördineert en de vertrekkende groep stabiliseert om hydrolyse te drijven, wat een convergente chemische strategie met PPP-fosfatases vertegenwoordigt die een onderscheidende katalytische architectuur hanteert.
Deze studie toont aan dat door AI ontworpen synthetische eiwitminibinders (C6-DPC) signaalbarrières kunnen overwinnen om efficiënte, functionele menselijke myogene reprogramming mogelijk te maken door gelijktijdig pro-myogene FGFR-paden te activeren en anti-myogene ALK1/TGFBR2- en inflammatoire gp130-signalen te onderdrukken, waardoor hoogkrachtige spierweefsels uit fibroblasten worden gegenereerd.
In deze studie is een nieuw chemisch geïnduceerd dimerisatiesysteem ontwikkeld, bestaande uit een *de novo* ontworpen macrocyclisch peptide en een bijbehorend eiwit-homodimeer, waarmee cellulaire processen zoals genexpressie en luciferase-reconstitutie nauwkeurig kunnen worden gecontroleerd.
Deze studie karakteriseert het MprF-homoloog LpiA uit *Agrobacterium fabrum* door middel van cryo-EM-analyse, waarbij een dimere structuur wordt aangetoond en de rol van specifieke zwavel-aromatische motieven bij substraatbinding wordt gesuggereerd.
De studie toont aan dat de duur van de toxiciteit van IAPP voor bètacellen lineair samenhangt met de lengte van de lag-fase van amyloïdvorming, wat bevestigt dat tijdelijke pre-fibrillaire intermediairen en niet de rijpe fibrillen de celstoornis veroorzaken.
Deze studie introduceert de fluorescente niet-canonische aminozuur 7-HCAA als een gevoelige, site-specifieke sonde om de lokale conformatieveranderingen tijdens de vorming van infectieuze prionen in real-time te monitoren en bevestigt dat deze gemodificeerde prionproteïnen volledig infectieus zijn in muismodellen.
In dit artikel wordt dEVA, een multi-objectief evolutionair algoritme, gepresenteerd voor het succesvolle zero-shot ontwerp van een volledig nieuw bi-zink metallo-enzym met hydrolytische activiteit, waarmee wordt aangetoond dat functionele eiwitten kunnen worden ontworpen zonder afhankelijkheid van natuurlijke templates of evolutionaire informatie.
Dit artikel introduceert een geïntegreerde cryo-electrontomografie-strategie die door het intermitterend wisselen van vergrotingen tijdens dezelfde kantelreeks tegelijkertijd celbrede context en moleculaire details met hoge resolutie in kaart brengt, waardoor de kloof tussen celbiologie en structurele biologie wordt overbrugd.
Dit onderzoek toont aan dat de eukaryote COMMD-eiwitten, die essentieel zijn voor membraanverkeer, evolutionair ontstaan zijn uit bacteriële voorouders in de Myxococcota via genverdubbeling, waarbij ze een vergelijkbare ringvormige structuur behouden.