338 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Deze studie identificeert een dringbare redoxschakel op het eiwit SHP1 en ontwikkelt een selectieve covalente agonist die macrofaagontsteking remt door IRAK-signalering te antagoniseren.
Dit artikel beschrijft de overgang van een laboratorium van röntgenkristallografie naar cryo-elektronenmicroscopie voor het bestuderen van het chromatine-regulerende eiwit ATAD2B, waarbij praktische inzichten worden geboden over het overwinnen van uitdagingen bij sample-preparatie, data-verwerking en modelbouw voor nieuwe gebruikers.
Dit artikel beschrijft hoe antagonistische negatieve feedbacklussen verschillende compensatiemodussen (gedelegeerd, geïsoleerd en metastabiel) vertonen die leiden tot zowel homeostase als rheostase, met toepassing op biologische systemen zoals de gewichtsregulatie bij Siberische hamsters en de bloedsuikerhuishouding.
Dit onderzoek onthult via atomaire moleculaire dynamica-simulaties dat RY785 Kv2-kaliumkanalen blokkeert door een semi-geopende poorttoestand te stabiliseren via hydrofobe interacties, terwijl tetraethylammonium (TEA) de ionenstroom direct blokkeert door aan de selectiefilter te binden.
Deze studie toont aan dat lumacaftor de binding van von Willebrand-factor aan plaatjes selectief remt onder geoxideerde, ontstekingsachtige omstandigheden, wat een veelbelovende aanpak biedt voor de ontwikkeling van antitrombotica met een verlaagd bloedingrisico.
Dit artikel toont aan dat de XerC/XerD-recombinatie op het psi-locus van plasmide pSC101 gepaard gaat met een toename van de topologische koppelingsgetal met +4, wat resulteert in de vorming van een specifiek catenaan en een reactiemechanisme ondersteunt waarbij antiparallel uitgelijnde sites via een Holliday-junctie-intermediair vier negatieve supercoils omzetten in koppelingsknooppunten.
Dit onderzoek onthult de structurele basis van natrium-afhankelijke galzuurtransport door leden van de SLC10-familie, waarbij wordt aangetoond dat de afwezigheid van een doorgaand kanaal in ASBT (in tegenstelling tot NTCP) wordt veroorzaakt door een flexibele helix en dat membraanlipiden een cruciale rol spelen bij het transport van hydrofobe galzuren.
Deze studie introduceert RIPUP, een versnelde workflow die alternatieve proteasen en TMT-labeling combineert om de analyse van histon-PTMs van dagen naar uren te reduceren, terwijl tegelijkertijd de dekking en kwantitatieve nauwkeurigheid worden verbeterd, inclusief de detectie van eerder onzichtbare acyleringen.
Deze studie identificeert AltSLC35A4, een microproteïne gecodeerd door een alternatief open leesraam, als een nieuwe regulator die via interactie met het actomyosine-cytoskelet de ruimtelijke organisatie en homeostase van mitochondriaal DNA bewaakt.
Dit artikel beschrijft hoe het toepassen van een enzymkinetisch model dat dimerisatie en ligandbinding integreert, de meest accurate voorspelling biedt van de cellulaire werkzaamheid van MERS-CoV MPro-remmers, ondanks de complexiteit van hun biphasische concentratie-responscurves.