338 papers
Biochemie vormt de brug tussen de biologie en de chemie, waarbij we kijken naar de moleculaire processen die leven mogelijk maken. Op deze pagina verkennen we de nieuwste inzichten in hoe cellen functioneren, hoe enzymen werken en welke chemische reacties ons DNA sturen. Het is een fascinerend veld dat vaak complexe concepten omvat, maar die we hier proberen toegankelijk te maken voor iedereen.
Elk nieuw preprint dat op bioRxiv verschijnt binnen dit onderwerp, wordt direct verwerkt door Gist.Science. Wij bieden voor elk artikel zowel een duidelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in vakjargon. Hieronder vindt u de meest recente publicaties in biochemie, direct vanuit de bron.
Dit onderzoek onthult dat het ciliaire eiwit INPP5E, dat geassocieerd is met het Joubert-syndroom, via tyrosine- en serine-fosforylering interageert met endocytische en signaalregulerende eiwitten om groeifactorsignalering via PDGF en TGF{beta} op een cilium-afhankelijke manier te moduleren.
In deze studie wordt een computergestuurde strategie gepresenteerd waarbij nieuw ontworpen eiwitbinders het autoregulerende interface tussen de helicase-kern en het dsRBD2-domein van DHX9 blokkeren, waardoor de helicase-activiteit specifiek wordt geïnhibeerd als een potentiële kankertherapie.
Dit artikel lost de controverse rondom de definities van cooperativiteit in PROTACs en moleculaire lijm op door aan te tonen dat de schijnbare negatieve cooperativiteit die wordt waargenomen in "gedeeltelijk ingebedde" modellen feitelijk een entropische straf is door het beperken van de blootgestelde massa van grote liganden, waardoor wordt onthuld dat echte positieve eiwit-eiwitinteractie (PPI) cooperativiteit bestaat zodra deze ligandentropiekosten worden afgetrokken.
Dit artikel introduceert Quantal PCR (quPCR), een nieuwe kalibratorvrije methode die absolute nucleïnezuurkopieaantallen op enkelmoleculair niveau bepaalt door een intrinsieke kwantale eenheid af te leiden uit de thermodynamische en kinetische eigenschappen van het systeem.
Deze studie maakt gebruik van uitgebreide proteomische en glycomische analyses om te onthullen dat infectie met het Influenza A-virus het gastheer-glycoproteoom significant herstructureert door wijdverspreide desialylering te induceren via viraal neuraminidase en de Golgi-glycoproteïneflux te verstoren, terwijl het tegelijkertijd een langdurige unfolded protein response triggert die de oligomannose-glycosylering verhoogt.
Deze studie maakt gebruik van glycoproteomica, cryo-EM en oppervlakteplasmonresonantie om aan te tonen dat de N- en O-gelinkte glycanschilden van alfaherpesvirus gB-eiwitten, in het bijzonder hun sialinezuurgehalte, de binding aan gastheerco-receptoren MAG, PILR en NMHC-IIA differentieel moduleren, waardoor de uiteenlopende tropisme- en infectiviteitspatronen tussen HSV-1, HSV-2 en VZV worden verklaard.
Dit artikel introduceert een iteratief sampling-framework dat coevolutionaire informatie en residu-specifieke frequenties benut om efficiënt diverse, hoogwaardige ensembles van onderscheidende proteïneconformaties te genereren, waarmee bestaande methoden aanzienlijk wordt overtroffen in het karakteriseren van de structurele landschappen van fold-switching proteïnen.
Deze studie toont aan dat dieetcholesterol de systolische bloeddruk verlaagt en renale inflammatie dempt in voor beroerte gevoelige spontaan hypertensieve ratten door het wijzigen van lipidenprofielen en het onderdrukken van de arachidonzuur-prostaglandine E2-as, waardoor het een potentiële mechanistische verklaring biedt voor de eerder geobserveerde levensverlengende effecten in dit model.
Deze studie onthult dat de predatore bacterie *Bdellovibrio bacteriovorus* een uniek dubbel TULIP-eiwit gebruikt, TipA, dat een lipide-sequesterend homodimeer vormt dat structureel wordt geopend door zijn adaptereiwit TipB, wat de eerste voorbeeld is van een door een adapter gemedieerde conformationele verandering in TULIP's.
Deze studie karakteriseert ulacamten als een nieuwe cardiale myosine-remmer met een onderscheidend, afhankelijk van de regulatoire lichte keten werkend mechanisme dat de diastolische functie effectief verbetert en cardiale hypertrofie vermindert in preklinische modellen van hartfalen met behouden ejectiefractie (HFpEF).