1235 papers
Bio-informatica is de fascinerende brug tussen biologie en datawetenschap. In dit veld helpen onderzoekers computers om enorme hoeveelheden biologische informatie te ontcijferen, van het decoderen van ons DNA tot het begrijpen hoe virussen muteren. Het is de motor achter veel moderne doorbraken in de gezondheidszorg en de ecologie, waarbij complexe patronen in levende systemen worden vertaald naar bruikbare inzichten.
Op Gist.Science maken we de nieuwste ontdekkingen in dit vakgebied toegankelijk voor iedereen. Wij verwerken elke nieuwe preprint die wordt gepubliceerd op bioRxiv, de belangrijkste bron voor nog niet-peer-reviewed onderzoek in de levenswetenschappen. Voor elk document bieden we zowel een duidelijke, alledaagse uitleg als een gedetailleerde technische samenvatting, zodat u snel de kern begrijpt zonder vast te lopen in jargon.
Hieronder vindt u de meest recente bijdragen uit de wereld van bio-informatica, zorgvuldig samengevat voor u.
Dit artikel introduceert MISSTE, een modulair multischaal-simulatiekader dat intracellulaire logica, agent-based modeling en PDE-velden integreert om de mechanismen van weefselecosystemen te ontrafelen en geoptimaliseerde strategieën voor CAR-T-therapieën in solide tumoren te ontwikkelen.
ProteomeScan is een open-source toolkit die cloud-gebaseerde high-performance computing gebruikt om proteoom-brede moleculaire docking uit te voeren voor het snel en nauwkeurig valideren van eiwitdoelen en het ontdekken van nieuwe interacties tussen medicijnachtige moleculen en eiwitten.
In dit artikel wordt scDIVIDE, een raamwerk op basis van neurale stochastische differentiaalvergelijkingen, voorgesteld om continue cel-dynamica en delingsnelheden te infereren uit tijdreeks scRNA-seq-data door de koppeling tussen geboortecellen en diffusie te benutten om celdelingsgeassocieerde ruis te kwantificeren.
MICRON is een open-source, segmentatievrij hulpmiddel dat op multiple-instance learning is gebaseerd en dat nauwkeurige prognostische en diagnostische voorspellingen mogelijk maakt door outcome-gerelateerde ruimtelijke immuunmicro-omgevingen in ruimtelijke eiwitbeeldvormingsdata te identificeren, zoals geïllustreerd door de ontdekking van cruciale cel-celcommunicatiepatronen die de overleving bij hersenkanker beïnvloeden.
Dit artikel introduceert DigitalBrain, een geïntegreerde atlas en foundation-model dat 16,35 miljoen transcriptomen van het menselijk brein harmoniseert om een schaaloverschrijdend biologisch model te creëren dat nieuwe inzichten biedt in de hiërarchische organisatie en celtype-specifieke verouderingsmechanismen.
Dit artikel introduceert FlyPredictome, een open database met een structureel atlas van 1,5 miljoen voorspelde eiwit-eiwitinteracties in *Drosophila*, die experimentele data valideert en een gedetailleerd netwerk van interacties en bindingsoppervlakken biedt voor verdere functionele studies.
Het R-pakket trackDJ biedt een gebruiksvriendelijke en reproduceerbare oplossing voor het genereren van publicatiekwaliteit grafieken van epigenomische data, waardoor de kloof wordt gedicht tussen interactieve genomische browsers en programmeerbare visualisatietools.
LinkLlama is een fijnafgestemd Meta Llama 3-model dat natuurlijke taal gebruikt om chemisch haalbare en geometrisch accurate linkers te genereren voor fragment-based drug discovery, waarbij het de succesratio van bruikbare ontwerpen aanzienlijk verhoogt ten opzichte van bestaande methoden.
Dit artikel presenteert de 2026-update van DIOPT, een geïntegreerd ortholoogvoorspellingstool dat door uitbreiding van ondersteunde soorten, geavanceerde algoritmen en een gespecialiseerde versie voor geleedpotigen, een robuust hulpmiddel blijft voor functioneel genomisch onderzoek.
Dit artikel introduceert DeepUMQA-Global, een diep-leringsframework dat de nauwkeurigheid van eiwitstructuurmodellen schat met een ongeëvenaarde prestatie die de zelfevaluatie van AlphaFold3 overtreft en de beste consensusmethoden evenaart, terwijl het bovendien effectief onderscheid maakt tussen alternatieve conformatiestaten.