⚛️ Category

biophysics

412 papers

Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.

Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.

Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.

⚛️ biophysics

A Closed-Form Bayesian Model for DNA Replication Reveals Intrinsic Origin Timing and Activation Delays

Dit artikel introduceert een analytisch Bayesiaans raamwerk met een gesloten vorm dat gegevens over de richting van replicatievorken gebruikt om het aantal oorsprongspunten, activatievertragingen en intrinsieke timing in eukaryote DNA-replicatie nauwkeurig af te leiden, waardoor gereguleerde activatiekinetiek in *S. cerevisiae* wordt onthuld zonder de noodzaak van stochastische simulaties.

D'Asaro, D., Ciardo, D., Hyrien, O., Lacroix, L., Le tallec, B., Goldar, A., Audit, B., Arbona, J.-M., Tourancheau, A. (…)2026-06-09
⚛️ biophysics

Do AI Structure Predictors Capture Bound-State Disorder? A Benchmark on Fuzzy Protein Complexes

Deze studie benchmarkt AlphaFold3, AlphaFold2-Multimer, Chai-1 en Boltz-2 op een gecureerde dataset van fuzzy eiwitcomplexen, waarbij wordt onthuld dat, ondanks kleine structurele variaties, alle huidige voorspellers er niet in slagen de conformationele wanorde en het thermodynamische ensemblegedrag van deze systemen accuraat te vangen, zoals blijkt uit uniforme NOE-restraint-schendingen en slechte heliciteitscorrelaties.

Velasquez, J., Ghent, S., Uversky, V. N., Rahman, T.2026-06-08
⚛️ biophysics

A Crossed Laser Phase Plate for CryoEM

Dit artikel rapporteert de succesvolle implementatie van een gekruiste laser faseplaat (xLPP) op een Krios G4-microscoop, waarmee de bekwaamheid wordt aangetoond om stabiele, additieve faseverschuivingen te leveren die hoog-contrast, hoog-resolutie cryo-EM-beeldvorming mogelijk maken van zowel standaard eiwitbenchmarks als dikke biologische cellen.

Yu, Y., Cheng, A., Montabana, E., Paz Soldan, N., Cooper, E. S., Zhang, J. T., Axelrod, J. J., Petrov, P. N., Maisenbach (…)2026-06-05
⚛️ biophysics

Rewiring V-type and K-type enzyme allostery through subunit interface mutations

Deze studie toont aan dat gerichte mutaties op het subunit-interface van het IGPS-enzym rationeel de allosterische regulatie kunnen herprogrammeren door specifieke interfaciale contacten te wijzigen, wat het conformationele ensemble en het dynamische netwerk herstructureert om ofwel constitutief te activeren of de door effectoren geïnduceerde katalyse te verzwakken.

Maschietto, F., Enny, O., Chaudhuri, A., Batista, V. S., Loria, J. P.2026-06-04
⚛️ biophysics

Multidomain Coupling Governs FoxP1 Assembly and Nuclear Compartmentalization

Deze studie onthult dat de assemblage en nucleaire organisatie van de FoxP1-transcriptiefactor worden beheerst door een antagonistische koppeling tussen de leucine-zipper- en Forkhead-domeinen, waarbij dit multidomein-evenwicht de dimerisatie, DNA-binding en de vorming van nucleaire condensaten reguleert, waarbij verstoringen leiden tot ziektegeassocieerde dysregulatie.

Lazaro-Alfaro, A. F., Aviles, J., Peulen, T.-O., Medina, E. A., Heinze, K., Sanabria, H., Hemmen, K.2026-06-04
⚛️ biophysics

Functional Differentiation of Type II and Type I Collagen Articular Models in Synovial Fluid Film Formation and Recombinant Lubricin Retention

Deze studie onthult dat hoewel collageen type II uniek volledige synoviale vloeistoffilms scaffoldt terwijl collageen type I dat niet doet, beide collageentypen recombinant lubricin op vergelijkbare wijze binden en vasthouden, wat cruciale inzichten biedt in de mechanische achteruitgang van osteoarthritische gewrichten en het potentieel van op lubricin gebaseerde therapieën.

Jaramillo Pinto, D. R., Mendoza, N. L., Ahmed, S. T., Wen, Y., Vitkova, L., Witt, S. M., Cutter, K. A., Honey, U., Pasze (…)2026-05-27
⚛️ biophysics

Single-molecule nanophotonic resolution of binding dynamics from apo to fully liganded for a cyclic nucleotide-gated ion channel in cell-derived vesicles

Deze studie maakt gebruik van nanofotonische zero-mode golfgeleiders om de sequentiële bindingsdynamica en intermediaire conformationele toestanden van een cyclisch nucleotide-gated ionkanaal in uit cellen afgeleide vesikels op single-molecule-resolutie te bestuderen, waarmee de concentratiebeperkingen van traditionele diffractie-gelimiteerde microscopie worden overwonnen om cooperatieve bindingsmechanismen bloot te leggen.

Haldar, T., Watson, D., Borghese, C. M., Ahmed, Z., Pena Palomino, P. A., Ressl, S., Brumback, A. C., Goldschen-Ohm, M. (…)2026-05-27
⚛️ biophysics

Modeling Reveals How Direct-Acting Antivirals Redirect HBV Capsid Assembly Pathways to Noninfectious Products

Door een kinetisch Monte Carlo-model uit te breiden om te simuleren hoe capsidassemblagemodulatoren (CAM's) bij voorkeur binden aan specifieke subeenheidinterfaces, verduidelijkt deze studie de thermodynamische en kinetische mechanismen waarmee deze antivirale middelen de capsidassemblage van het hepatitis B-virus omleiden naar niet-infectieuze, misvormde structuren, waardoor de ontwikkeling van HBV-behandelingen en bredere zelfassemblagestrategieën wordt bevorderd.

Frechette, L. B., Pradhan, S., Mohajerani, F., Perez-Segura, C., Hadden-Perilla, J. A., Zlotnick, A., Hagan, M. F.2026-05-26