419 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit artikel biedt een gedetailleerd stappenplan voor het bouwen en karakteriseren van een enkel-objectief oblique plane microscoop (OPM) met commercieel verkrijgbare onderdelen, waarmee onderzoekers snelle, hoogresolutie 3D-fluorescentiebeeldvorming kunnen realiseren zonder de complexe uitlijningseisen van traditionele lichtsheet-microscopie.
Dit onderzoek combineert microsecondenlange moleculaire dynamica-simulaties met vrije-energieperturbatieberekeningen om te demonstreren dat Mg2+-coördinatie en substraatbinding gezamenlijk de inwaarts-gekeerde conformatie van de ABC-transporteur PCAT1 stabiliseren en de nucleotideherkenning via specifieke residuen zoals Lys525 in de Walker A-motief reguleren.
In dit onderzoek worden all-atom moleculaire dynamica-simulaties en free-energy perturbation gebruikt om de absolute bindingsvrijheidsenergie van cAMP aan de CNBD-van HCN-isoformen 1-4 te bepalen, waardoor inzicht wordt verkregen in de verschillen in kanaalsensitiviteit en activatiemechanismen.
Deze studie toont aan dat zelfs minimale sequentieveranderingen in intrinsiek ongeordende mitochondriale lokalisatiepeptiden de lokale structurele voorkeuren en het dynamische conformationele ensemble beïnvloeden, wat suggereert dat dergelijke variaties de targeting-efficiëntie kunnen moduleren.
Dit onderzoek combineert een nieuw experimenteel model met computermodellering om aan te tonen dat ephaptische interacties in het perinexum van cardiomyocyten, naast gap junctions, een cruciale rol spelen bij de elektrische geleiding, waarbij de bijdrage van deze mechanismen afhankelijk is van de natriumconcentratie en gap junction-conductantie.
Dit onderzoek gebruikt all-atom moleculaire dynamica-simulaties van een volledig gelycosyleerd, in een lipidebilayer verankerd HIV-1 Env-trimer om aan te tonen dat hoewel het ectomeer rigide blijft, de intrinsieke flexibiliteit van het MPER en de interacties van het TMD met lipiden en ionen cruciaal zijn voor de conformationele variabiliteit en fusie, wat nieuwe inzichten biedt voor de ontwikkeling van antilichamen en vaccins.
Dit artikel toont aan dat, ondanks gemiddelde correlatiecoëfficiënten, FoldX-energieschattingen een waardevol hulpmiddel zijn voor de interpretatie van genetische varianten doordat een duidelijke lineaire relatie met experimentele resultaten bestaat en door het identificeren van uitschieters en het aggregeren van schattingen uit verschillende structuren de voorspellende nauwkeurigheid kan worden verbeterd.
Dit onderzoek toont aan dat de kwaliteit van sociale informatie en de omgevingsvolatiliteit samen bepalen of collectief foerageren een fragiele strategie is die faalt bij veranderingen, of een flexibele, gediversifieerde aanpak die zich aanpast aan de ecologische context.
Dit onderzoek toont aan dat collectieve ciliaire stromingen in vroege Xenopus-embryo's een robuust vloeistofschild vormen dat pathogenen effectief verwijdert, waarbij deze beschermende functie vooral afhankelijk is van de algemene ciliaire snelheid en minder gevoelig is voor variaties in de ruimtelijke verdeling van de meerciliaire cellen.
G-screen is een schaalbaar, receptor-bewust virtueel screeningkader dat door flexibele liganduitlijning en farmacofore-evaluatie de snelheid van ligand-gebaseerde methoden combineert met de structurele nauwkeurigheid van docking voor het efficiënt filteren van ultra-grote chemische bibliotheken.