⚛️ Category

biophysics

412 papers

Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.

Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.

Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.

⚛️ biophysics

Ligand Binding Kinetics, Thermodynamics, and Gating of Insect Odorant Receptor

Deze studie maakt gebruik van geïntegreerde moleculaire dynamica- en machine learning-benaderingen om de mechanismen van ligandherkenning en gating op atomair niveau in de ancestrale insectengeurreceptor MhOR5 te verhelderen, waarbij onderscheidende bindingsmodi, duale vrijgavepaden en specifieke moleculaire determinanten worden onthuld die de differentiële stabiliteit en kinetiek van eugenol- en DEET-interacties beheersen.

Song, T., Low, M., fu, h., Wang, Y.2026-08-27
⚛️ biophysics

Impact of Axon Model Complexity on Deep Brain Stimulation: A Comparative Analysis of MRG and Cohen Double-Cable Models

Deze studie toont aan dat hoewel zowel het McIntyre-Richardson-Grill (MRG) als het Cohen dubbele kabel-axonmodel effectief de uitkomsten van diepe hersenstimulatie voorspellen, het meer gedetailleerde Cohen-model een grotere prikkelbaarheid, lagere activatiedrempels en een superieure voorspellende nauwkeurigheid vertoont, met name met betrekking tot frequentieafhankelijke responsen.

Bartels, R., Vinke, S., Rijpma, A., Nadimi, M.2026-08-27
⚛️ biophysics

Computational Structural Analysis of POLG Variants R627Q and W748S with Model-Variability Controls

Deze studie toont aan dat computationele structurele vergelijkingen van de POLG-varianten R627Q en W748S met behulp van AlphaFold2 er niet in slagen om mutatiespecifieke effecten te onderscheiden van variabiliteit in de modelselectie, hoewel experimentele structurele mapping suggereert dat deze residuen een lokaal micro-milieu delen waar de mutaties waarschijnlijk specifieke polaire en hydrofobe interacties verstoren in plaats van directe macromoleculaire contacten.

Friedl, A., Manst, D.2026-08-27
⚛️ biophysics

WaterFlow: Prediction of Ordered Water Molecule Positions on Protein Structures

Het artikel introduceert WaterFlow, een op flow-matching gebaseerd model dat bestaande state-of-the-art methoden overtreft in het voorspellen van geordende watermolecuulposities op eiwitstructuren met sub-angstroom nauwkeurigheid, waardoor toepassingen in eiwitontwerp, medicijnontdekking en structurele verfijning worden verbeterd, terwijl het onthult dat de diversiteit van hoogwaardige trainingsdata momenteel verdere prestatiewinsten beperkt.

Srivastava, V., Mai, H., Collins, M., HOLTON, J. M., Wall, M., Wankowicz, S. A.2026-08-27
⚛️ biophysics

Emergence of new function through evolutionary divergence of an intrinsically disordered region

Deze studie toont aan dat de functionele divergentie van de paraloge eiwitten FCHO1 en FCHO2 voortvloeit uit de evolutionaire verwerving van een transiënte helixstructuur binnen een intrinsiek ongeordende regio, die nieuwe zelfassociatie-eigenschappen verleent aan FCHO1 terwijl de gedeelde ancestrale membraanbindende activiteit van beide eiwitten behouden blijft.

Elena-Real, C. A., Körber, A. M., Gatin-Fraudet, B., Kovinko, A., Motzny, K., Saiti, A., Lange, A., Broichhagen, J., Mi (…)2026-08-25
⚛️ biophysics

Geometry of Braided DNA Dictates Supercoiling Partitioning

Door het combineren van technisch vervaardigde DNA-vlechtingssubstraten, hoekige optische valmetingen en Monte Carlo-simulaties, toont deze studie aan dat de geometrische scheiding van DNA-strengen bij de replicatievork bepaalt of het replisoom roteert om supercoiling erachter te partitioneren of stationair blijft om stress ervoor te accumuleren, waardoor een fysisch mechanisme wordt onthuld waarmee DNA-geometrie de replicatiedynamiek en topologische stressbeheersing reguleert.

Hong, Y., Singh, G., Wang, H., Park, S. h., Wang, M. D.2026-08-24
⚛️ biophysics

Enhanced-Sampling Molecular Dynamics Recovers Rare Functional RNA Conformations Across Diverse Structural Contexts

Deze studie toont aan dat temperature replica-exchange molecular dynamics (T-REMD) conventionele en andere enhanced sampling-methoden overtreft in het genereren van experimenteel gevalideerde RNA-conformatie-ensembles, waarbij het succesvol zeldzame functionele substaten herstelt en ligand-screening over diverse structurele contexten verbetert.

Li, D., Ken, M.2026-08-24
⚛️ biophysics

Regulation of the human voltage-gated proton channel by membrane sterols

Deze studie verheldert hoe cholesterol het humane spanningsgestuurde protonkanaal (hHv1) remt door de S4-conformatiedynamiek te veranderen, een mechanisme dat wordt afgezwakt door zijn precursor desmosterol en wordt gemedieerd door specifieke residuen zoals Y141, waardoor de sterolmetabolisme wordt gekoppeld aan de cellulaire pH-homeostase.

Han, S., Duan, R., Applewhite, S., Wang, S., Wang, G., Qian, M., Covey, D. F., Zou, X., Wang, S.2026-08-22
⚛️ biophysics

Visualizing Reaction Pathways via Reciprocal Space Kinetic Decomposition

Dit artikel introduceert een kinetisch decompositiekader in de reciproke ruimte dat zwakke transiënte structurele signalen in tijdsopgeloste seriële kristallografie isoleert door gegevens te scheiden volgens vooraf gedefinieerde kinetische modellen, waardoor de mechanistische interpretatie van ultrasnelle eiwitdynamica wordt verbeterd terwijl de compatibiliteit met standaard structurele verfijningsworkflows behouden blijft.

Grunewald, L., Meszaros, P., Westenhoff, S.2026-08-20