609 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit onderzoek toont aan dat het integreren van conformatiedynamiek in computergestuurde proteïneherontwerp essentieel is voor het succesvol herprogrammeren van calmoduline om de regulatie van de Ryr2-kanaal te verbeteren, aangezien een puur op affiniteit gebaseerde aanpak de functionele integriteit en fysiologische controle kan verstoren.
Deze studie introduceert een nieuwe, ratiometrische methode voor het kwantificeren van opgeloste zuurstof in microplaten voor biochemische assays, waarbij gebruik wordt gemaakt van palladiumporfyrine-gebaseerde fotoluminescentie en een eenvoudige immobilisatieprotocollen om zuurstofverbruik en -productie in diverse biologische en enzymatische processen te monitoren.
Dit onderzoek toont aan dat de ionische sterkte de conformatie van de marginaal gedesorganiseerde transcriptiefactor Phd reguleert, waarbij een toename van de zoutconcentratie een overgang bewerkstelligt van een volledig gedesorganiseerde toestand naar een gedeeltelijk geordende monomeer en vervolgens een gestructureerde dimeer, waardoor Phd fungeert als een conformationele regelaar.
Dit artikel beschrijft een robuust workflow voor cryo-elektronentomografie die geoptimaliseerde protocollen combineert voor de isolatie, vitrificatie, FIB-milling en 3D-segmentatie van menselijke mitochondriën om hun moleculaire structuur en functie in verschillende condities in kaart te brengen.
Deze studie gebruikt QM/MM-stringmethode-simulaties om aan te tonen dat de hydrolyse van strigolactonen door de receptor DWARF14 verloopt via een canoniek acylsubstitutiepad en dat de activerende covalente modificatie een dynamisch ensemble van interconverserende toestanden vormt in plaats van een enkel statisch product.
Dit artikel introduceert ioNERDSS, een gebruiksvriendelijke Python-pakket dat statische macromoleculaire structuren omzet in grofkorrelige modellen voor het simuleren van zelfassemblage-trajecten via de NERDSS-software, waarbij thermodynamische en kinetische factoren worden geanalyseerd om complexe structuren zoals virale capsiden te bestuderen.
Dit onderzoek onthult dat intrinsiek ongeordende transactivatiedomeinen van transcriptiefactoren en arginine-glycine-rijke regio's van RNA-bindende eiwitten via elektrostatische complementariteit interageren, en biedt een kwantitatief raamwerk voor het voorspellen en prioriteren van deze cruciale koppelingen die genexpressie op transcripioneel en post-transcriptioneel niveau coördineren.
Deze studie toont aan dat het hart als een topologisch materiaal functioneert, waarbij de coherente chirale organisatie van myocardvezels en topologische defecten de efficiëntie van de torsiereactie bepalen, ongeacht de systemische linker-rechter oriëntatie.
Dit onderzoek onthult dat asymmetrische hydratatie en een protonschakeling tussen twee aspartaatresiduen, gekoppeld aan plugverwijdering en conformatieveranderingen, de rotatie van de Campylobacter jejuni-flagellaire motor aandrijven.
Deze studie toont aan dat, hoewel zowel monomeren als fibrilzaadjes van α-synucleïne in Tau-condensaten worden opgenomen, alleen de zaadjes een snelle overgang van vloeibaar naar vast veroorzaken door een bijna honderdvoudige toename in viscositeit, wat een cruciaal mechanisme suggereert voor de vorming van pathologische aggregaten bij neurodegeneratieve ziekten.