609 papers
Biologie en natuurkunde vloeien in dit vakgebied samen om het complexe leven onder de microscoop te ontrafelen. Van hoe moleculen bewegen tot de krachtlijnen in een cel, hier wordt de fysica van het leven verkend zonder onnodig jargon. Het is een wereld waar de wetten van de natuurkunde worden toegepast om biologische mysteries op te lossen.
Op Gist.Science vinden we elke nieuwe preprint uit deze categorie direct op bioRxiv. Onze team verwerkt deze publicaties zodat u zowel een heldere samenvatting in gewone taal als een diepgaande technische analyse krijgt. Dit maakt de meest recente inzichten toegankelijk voor iedereen, ongeacht uw achtergrond.
Hieronder vindt u de nieuwste artikelen over biofysica, zorgvuldig geselecteerd en samengevat voor u.
Dit artikel toont aan dat RGB-camera's een kosteneffectief en eenvoudig alternatief bieden voor meerkleurige super-resolutiemicroscopie, waarbij statistische fluorofore-discriminatie tot zes kleurstoffen met hoge precisie mogelijk maakt.
Deze studie toont aan dat zebrafischembryo's tijdens de epibolie uitzonderlijk robuust zijn tegen mechanische verstoringen, waarbij foto-ablatie weliswaar de celstroming tijdelijk kan beïnvloeden, maar de uiteindelijke positie van de toekomstige lichaamsas niet kan heroriënteren, wat wijst op een sterke controle door factoren die niet-mechanisch van aard zijn.
De auteurs presenteren een gestabiliseerde multiphoton-microscopie-techniek met FREVR die een precisie van minder dan 20 nanometer mogelijk maakt om de dynamische interactie tussen GPCR's en arrestine-2 in levende cellen kwantitatief te volgen zonder dat er gemiddelden over meerdere cellen nodig zijn.
Deze studie introduceert de AlphaFold Latent Flooding (AFLF)-methode, een heuristische importance sampling-techniek die zonder voorafgaande kennis of uitgebreide fysische modellering functioneel relevante conformationele ensembles van eiwitten genereert door het latent space van AlphaFold te verkennen.
Dit artikel introduceert CGAgentX, een autonoom multi-agent framework dat gespecialiseerde LLM-agenten coördineert om automatisch en iteratief overdraagbare grofkorrelige (CG) modellen te ontwikkelen die experimentele en atomaire eigenschappen met hoge nauwkeurigheid reproduceren.
In dit onderzoek wordt aangetoond dat moleculaire dynamica-simulaties, gekoppeld aan experimentele ssNMR-restricties, de cruciale structurele motieven en het membraan-gemedieerde gedrag van Aβ42-dimers tijdens de fibrillatie van Alzheimer's ziekte succesvol in kaart brengen.
Deze studie toont aan dat de pathogene Rac2-mutaties D57N en E62K, ondanks hun nabijheid, fundamenteel verschillende mechanismen gebruiken om de conformatiedynamiek en signaaloverdracht te verstoren, waarbij D57N de GTPase in een permanent inactieve toestand vastzet terwijl E62K een constitutief actieve toestand veroorzaakt die de GAP-gemedieerde hydrolyse blokkeert.
De auteurs ontwikkelen een multiscale CG-KMC-simulatiemethode die aantoont dat HIV-1-capsidruptie tijdens reverse transcriptie wordt gedreven door specifieke capsid-DNA-interacties en niet door eenvoudige uitwendige druk, wat leidt tot breukpaden die overeenkomen met cryo-ET-beelden.
Dit artikel introduceert een geometrisch oppervlak PDE-model dat de translocatie van cellen door geconfindeerde ruimtes simuleert, waarbij de celmembraan en kernhuls als evoluerende energievlakken worden gemodelleerd om experimentele resultaten te valideren en de cruciale rol van oppervlaktespanning en geometrie in migratie-efficiëntie te benadrukken.
Dit onderzoek onthult hoe Complex I langafstands-energietransductie realiseert via een redox-geïnduceerd koppelingsnetwerk dat een protonenstroom activeert langs een geconserveerd kanaal, waarbij een centrale mechanische schakel (Tyr156^H) de conformatieveranderingen reguleert.