🧬 Category

genomics

398 papers

Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.

Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.

Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.

🧬 genomica

A divergent mutational and clonal landscape in aged HSCs is not linked to aging-associated clonal hematopoiesis

Door een strikte gezamenlijke variantfiltratiestrategie toe te passen op single-cell RNA-sequencingdata, onthult deze studie dat verouderde hematopoëtische stamcellen gestructureerde clonale genealogieën en transcriptionele divergentie vertonen die gekoppeld zijn aan veroudering en DNA-schade, waarmee deze mutationele landschappen onderscheiden worden van verouderingsgeassocieerde clonale hematopoëse.

Carolina Florian, M., Amoah, A., Nattamai, K. J., Soller, K., Vollmer, A., Hoenicka, M., Liebold, A., Bauer, K., Mallm (…)2026-01-26
🧬 genomica

Spatially-resolved molecular sex differences at single cell resolution in the adult human ventromedial and arcuate hypothalamus

Deze studie presenteert de eerste ruimtelijk opgeloste single-cell atlas van de volwassen menselijke ventromediale en arcuate hypothalamus, die specifieke geslachts-differentieel tot expressie gebrachte genen in specifieke neuronale populaties onthult die geslacht-gebiaste fysiologie koppelen aan de mechanistische basis van neurodevelopmentale en neuropsychiatrische stoornissen.

Mulvey, B., Wang, Y., Divecha, H. R., Bach, S. V., Montgomery, K. D., Cinquemani, S., Chandra, A., Du, Y., Miller, R. A. (…)2026-01-25
🧬 genomica

Integration of an anellovirus genome in the SKNO-1 acute myeloid leukemia cell line

Deze studie identificeert en karakteriseert een stabiel geïntegreerd *Alphatorquevirus hominis* 29-genoom binnen de rDNA-locus van de SKNO-1 acute myeloïde leukemie cellijn, waarmee wordt aangetoond dat het virus wordt onderhouden, getranscribeerd en gereguleerd door specifieke gastheer-transcriptiefactoren, waardoor een uniek model wordt geboden om anelloviruspersistentie en hematopoëtische tropisme te onderzoeken.

Cui, N., Goya, S., Piliper, E. A., Greninger, A. L.2026-01-23
🧬 genomica

Integration of human and mouse single-cell transcriptomes of the developing cerebellum nominates cells-of-origin for Group 3 and 4 medulloblastoma

Door single-cell transcriptomen van de ontwikkelende menselijke en muiscerebellum te integreren, identificeert deze studie een menselijk verrijkte unipolaire borstelcel-subpopulatie (UBC 1), aangestuurd door SOX4 en SOX11, die dient als de waarschijnlijke cellulaire oorsprong voor een aanzienlijk deel van de groep 3 en 4 medulloblastomen, wat de noodzaak van mensspecifieke modellen benadrukt voor het begrijpen van deze tumoren.

Cheong, I., Lau, L., Pai, S.2026-01-22
🧬 genomica

NEMO: Improved and accurate models for identification of 6mA using Nanopore sequencing

Het artikel introduceert NEMO, een motiefgestuurde modelleringsbenadering die de nauwkeurigheid van het detecteren van 6-methyladenine (6mA) uit ruwe Nanopore-sequencingdata aanzienlijk verbetert, wat hoogresolutie epigenetische analyse mogelijk maakt in zowel nieuwe als bestaande datasets.

Kulkarni, O., Zaveri, L., Singh, N. K., Mathew, R. J., Ara, S., Garde, S., Reddy, M., Tallapaka, K. B., Sowpati, D. T.2026-01-21
🧬 genomica

Spatial Decoding of Tertiary Lymphoid Structure Maturation in Non-Small Cell Lung Cancer Using Deep Neural Networks

Deze studie ontwikkelt een deep learning-framework dat multimodale ruimtelijke omics en whole-slide imaging integreert om de rijping van tertiaire lymfoïde structuren in niet-kleincellige longkanker te ontcijferen, waarbij twee onderscheidende ruimtelijke ecosystemen met tegengestelde prognostische implicaties worden onthuld.

Chen, B., Foo, C., Andersson, A., Kayser, B. D., Yang, Y., Missarova, A., Kulkarni, P., Huetter, J.-C., Chatterjee, S. (…)2026-01-20
🧬 genomica

UnionLoops: a workflow for calling chromatin loops across related Hi-C datasets with improved specificity, precision, and sensitivity

Het artikel introduceert UnionLoops, een computationele workflow die de reproduceerbaarheid, specificiteit en sensitiviteit van chromatinelusdetectie over meerdere gerelateerde Hi-C-datasets verbetert door informatie te integreren om gedeelde interacties te onderscheiden van samplespecifieke ruis, waardoor meer betrouwbare vergelijkende biologische analyses mogelijk worden.

Liu, J., Gibcus, J. H., Dekker, J.2026-01-20