511 papers
Genomica is het spannende vakgebied dat zich bezighoudt met het ontrafelen van het complete bouwplan van levensvormen. Door het DNA van organismen in kaart te brengen, kunnen wetenschappers ontdekken hoe eigenschappen worden overgeërfd en hoe ziektes ontstaan. Op Gist.Science maken we deze complexe inzichten toegankelijk voor iedereen, van student tot geïnteresseerde leek, zonder dat je een doctoraat in biologie nodig hebt.
Elke nieuwe preprint in dit domein die verschijnt op bioRxiv wordt door ons direct verwerkt. We bieden niet alleen een heldere samenvatting in gewone taal, maar ook een gedetailleerde technische analyse voor wie dieper wil graven. Zo blijft u altijd op de hoogte van de allerlaatste doorbraken voordat ze officieel gepubliceerd zijn.
Hieronder vindt u de meest recente publicaties binnen dit dynamische onderzoeksgebied.
Dit onderzoek onthult dat polyploïdie in de gist *Saccharomyces cerevisiae* voornamelijk ontstaat via een stapsgewijze route waarbij sporen endoreplicatie ondergaan en vervolgens paren, waardoor triploïde organismen fungeren als cruciale tussenstappen in de evolutie van het genoom.
Dit onderzoek gebruikt een pangenoom van vijf hoogwaardige Simmentalse rinderassemblages, waaronder halfbroers, om recombinatie-evenementen op basispaarniveau te identificeren via structurele varianten en DNA-methylering, wat een waardevolle aanvulling biedt op traditionele SNP-gebaseerde methoden.
Dit onderzoek gebruikt een gesimuleerd model van drie populaties om aan te tonen dat de zuidoost-noordwestelijke gradiënt van Neanderthaler-afstamming in Europa werd gevormd door de richting van de vroege jager-verzamelaars-expansie, de noordelijke grens van het Neanderthaler-gebied en sterke reproductieve isolatie, waarbij de vermenging tussen jager-verzamelaars en neolithische boeren aanzienlijk intensiever was dan die tussen Neanderthalers en moderne mensen.
Dit onderzoek toont aan dat de evolutie en populatiestructuur van de bacteriële bladvlekziekteverwekker Xanthomonas oryzae pv. oryzae in Afrika sterk is gevormd door de overgang van de lokaal gedomesticeerde rijstsoort Oryza glaberrima naar de geïntroduceerde Aziatische rijst Oryza sativa.
Dit onderzoek toont aan dat ultra-geconserveerde CpG-dinucleotiden in het menselijk genoom verrijkt zijn in ontwikkelings- en verouderingsgerichte genen, met name in de hersenen, wat suggereert dat functionele componenten van DNA-methylatie-gerelateerde veroudering nauw verweven zijn met ontwikkelingspaden.
Dit onderzoek stelt een unificerend model op voor de populatiegenetica van aneuploïdieën, waarin wordt aangetoond dat terugkeer naar de normale chromosoomaantallen doorgaans zeldzaam is, maar dat voor specifieke chromosomen een gekoppeld mechanisme van niet-disjunctie en herstel via chromosoombreuk en recombinatie optreedt.
Dit onderzoek toont aan dat donor-specifieke assemblages de detectie van somatische structurele varianten in complexe genoomregio's aanzienlijk verbeteren ten opzichte van lineaire referentiegenomen.
Dit artikel presenteert de eerste transcriptoom-tijdsreeks van het intra-erytrocytische ontwikkelingsstadium van de malaria-parasiet *Plasmodium knowlesi* A1-H.1 in menselijke erytrocyten, waarbij sterke behoud van tijdsgebonden genexpressie met *P. vivax* wordt aangetoond en een interactief webtool wordt ontwikkeld om functioneel onderzoek naar *P. vivax* via dit model te faciliteren.
Dit onderzoek onthult hoe Ovate Family Proteins (OFPs) in de Rosaceae-fruitsoorten perzik en appel, via interacties met brassinosteroïden en microtubuli, de variatie in vruchtvorm van plat tot langwerpig reguleren, wat een nieuwe basis biedt voor veredeling.
Dit onderzoek toont aan dat nanopore-sequencing aanzienlijke genomische en methylatieverschillen, waaronder allelspecifieke veranderingen in kankerdrivergenen en transposabele elementen, blootlegt tussen twee MCF-7 sublijnen, wat de noodzaak onderstreept van nauwkeurige karakterisering van cellijnen voor kankeronderzoek.