Distinct virus-specific regulation of RNA synthesis across genome segments by thogotovirus polymerases: insights from Oz virus and Dhori virus

Dit onderzoek toont aan dat thogotovirussen zoals Oz-virus en Dhori-virus verschillend reageren op variaties in de distale duplex van hun promotorsequenties, waarbij Oz-virus de RNA-synthese reguleert op basis van specifieke basenparen op posities 5'12/3'11, terwijl Dhori-virus hier niet door beïnvloed wordt.

Rakib, T. M., Mashimo, R., Akter, L. + 4 more2026-04-01🦠 microbiology

Contrasting population structures coexist in a strain-resolved estuarine microbiome

Dit onderzoek, dat een mijlpaal markeert in een tien jaar durende zoektocht naar complete *Pelagibacter*-genomen, onthult met behulp van Nanopore-sequencing en de *myloasm*-assembler dat er binnen één estuarien monster gelijktijdig fundamenteel verschillende evolutionaire strategieën bestaan, variërend van een hoge diversiteit aan *Pelagibacter*-stammen tot een bijna monotypische *HIMB114*-populatie.

Lui, L. M., Nielsen, T.2026-03-31🦠 microbiology

A Machine Learning Framework for Serogroup Classification of pathogenic species of Leptospira Based on rfb Locus Profiles

Deze studie presenteert een machine learning-framework dat de serologische classificatie van pathogene Leptospira-soorten nauwkeurig voorspelt op basis van rfb-locus profielen, waardoor complexe en arbeidsintensieve traditionele tests worden vervangen door een schaalbaar en reproduceerbaar alternatief voor epidemiologisch toezicht en vaccinontwikkeling.

de Carvalo Ferreira Filho, E., Melo Arruda, P., Cabral Afonso Ferreira, L. + 2 more2026-03-30🦠 microbiology

ONETest PathoGenome: A Multi-Cohort Evaluation of an Optimized NGS Assay for Detection of Lower Respiratory Pathogens in Bronchoalveolar Lavage

Dit onderzoek toont aan dat de geautomatiseerde hybrid-capture metagenomische assay ONETest PathoGenome, met een turnaround tijd van minder dan 24 uur, een hoge specificiteit en verbeterde detectie van longpathogenen in bronchoalveolaire lavage biedt in vergelijking met conventionele kweekmethoden.

Massoumi Alamouti, S., Nguyen, H. D., Daneshpajouh, H. + 9 more2026-03-30🦠 microbiology