579 papers
De microbiologie is de fascinerende wereld van het onzichtbare leven, waar we de microscopische organismen bestuderen die overal om ons heen aanwezig zijn. Van bacteriën en virussen tot schimmels en protozoa, deze kleine levensvormen spelen een cruciale rol in onze gezondheid, het milieu en zelfs de productie van voedsel. Op Gist.Science maken we de nieuwste inzichten uit dit dynamische veld toegankelijk voor iedereen, zonder dat je een doctoraat nodig hebt om de complexiteit te doorgronden.
Elke nieuwe preprint die op bioRxiv verschijnt binnen de microbiologie, wordt door ons team direct verwerkt. Wij bieden voor elk artikel zowel een begrijpelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische uitleg, zodat je zelf kunt kiezen hoe diep je wilt duiken in de wetenschap. Hieronder vind je de meest recente onderzoeken uit de microbiologie, direct uit de bron van bioRxiv.
Deze studie presenteert een belangrijke uitbreiding van de fylum Omnitrophota door middel van 229 hoogwaardige genomen, waarbij een dominante klasse (Gorgyraeia) wordt onthuld met een gastheer-afhankelijke episymbiotische levenswijze en een ongekende capaciteit voor extreem lange, membraanverankerde eiwitten.
Deze studie toont aan dat uit natuurlijke producten afgeleide efflux-remmers, in het bijzonder lyoniresinol, synergetisch de bedaquilinegevoeligheid in drug-resistente *Mycobacterium tuberculosis*-mutanten kunnen herstellen door efflux-gemedieerde resistentiemechanismen te overwinnen.
Deze studie toont aan dat endogene A-naar-I RNA-editing in *Vibrio alginolyticus* de quorum-sensing synthase CqsA hercodeert door tyrosine te vervangen door cysteïne, waardoor genexpressie wordt gemoduleerd en efficiënte door het type VI-secretiesysteem bemiddelde interbacteriële killing mogelijk wordt gemaakt.
Deze studie toont aan dat de twee cardiolipine-synthases, ClsA en ClsB, in de darmcommensale *Bacteroides fragilis* niet-redundante functies uitvoeren die de lipidensamenstelling, celmorfologie en stressresistentie tegen membraanverstorende agentia op onderscheidende wijze vormgeven zonder de basale ionenhomeostase te verstoren.
Deze studie onthult dat virale lysis van catechine-afbrekende bacteriën in methaan-onderdrukte veenmicrokosmen een "virale shunt" triggert die metabolische intermediairen herverdeelt naar diverse fenol-afbrekende taxa, waardoor waterstofconsumptie en methaanonderdrukking worden in stand gehouden, terwijl tegelijkertijd de cruciale rol van virussen in strategieën voor microbioom-engineering wordt benadrukt.
Deze studie onthult dat de antibacteriële activiteit van N-acetylcysteïne tegen *Staphylococcus aureus* strikt pH-afhankelijk is en wordt gedreven door verzuring in plaats van door het molecuul zelf, terwijl pH-neutraal NAC nog steeds het bacteriële metabolisme significant verandert zonder de groei te remmen.
Dit artikel presenteert een gestructureerde evaluatiewerkwijze voor het selecteren van deep learning segmentatiemodellen in low- en ultralow-dose cryo-EM, waarbij wordt aangetoond dat hoewel hoge prestatie-indicatoren geen betrouwbare kwantitatieve resultaten garanderen, YOLOv11 en SAM3 elk duidelijke voordelen bieden voor respectievelijk de getrouwheid van membraansegmentatie en de robuustheid bij ultralow-dose.
Deze studie breidt de bekende diversiteit van Kolmioviridae uit door acht nieuwe lineages in diverse gewervelden te identificeren en toont door middel van een uitgebreide fylogenetische analyse aan dat meerdere afzonderlijke kolmiovirus-lineages gedurende honderden miljoenen jaren gelijktijdig hebben gecirculeerd tijdens de evolutie van gewervelden, waarbij de specifieke associatie tussen hepatitis deltavirus en hepatitis B-virus een recente ontwikkeling is.
Deze studie valideert het mungboonmodel voor het vergelijken van de virulentie van *Pseudomonas aeruginosa* door de gedeelde en onderscheidende transcriptionele responsen tijdens infectie te karakteriseren en door aan te tonen dat klinische cystic fibrosis-isolaten uit latere infectiestadia een hogere virulentie en onderscheidende genomische profielen vertonen vergeleken met isolaten uit een vroeg stadium.
Deze studie identificeert Ninj1 als een centrale effector van door Mycobacterium tuberculosis geïnduceerde macrofaagnecrose, waarbij wordt onthuld dat het bacteriële ESX-1-secretiesysteem NINJ1-oligomerisatie en plasma membraanruptuur triggert via een uniek pad dat onafhankelijk is van canonieke gereguleerde celdoodmechanismen.