816 papers
Dit onderzoek, dat een mijlpaal markeert in een tien jaar durende zoektocht naar complete *Pelagibacter*-genomen, onthult met behulp van Nanopore-sequencing en de *myloasm*-assembler dat er binnen één estuarien monster gelijktijdig fundamenteel verschillende evolutionaire strategieën bestaan, variërend van een hoge diversiteit aan *Pelagibacter*-stammen tot een bijna monotypische *HIMB114*-populatie.
Dit onderzoek onthult dat de ultrasnelle zwemcapaciteit van *Actinoplanes missouriensis*-zoosporen wordt aangedreven door een unieke, voorwaartse bundel flagellen die het lichaam omsluiten en synchroon roteren, wat een nieuw locomotieprincipe biedt dat de snelheidslimieten van bacteriën bepaalt.
Dit artikel beschrijft de ontdekking en taxonomische karakterisering van een nieuwe bacteriesoort, *Gardnerella fastidiominuta*, geïsoleerd uit het vrouwelijke urinewegmicrobioom, die wordt onderscheiden van bestaande soorten op basis van genomische, fylogenetische en fenotypische kenmerken.
Deze studie introduceert PInc, een op replicatie gerichte classificatieframework dat een grote fylogenie van bacteriële plasmiden reconstrueert op basis van geconserveerde winged-helix-domeinen, waardoor de evolutionaire diversiteit en verspreiding van plasmiden onafhankelijk van gastheerbias in kaart wordt gebracht.
Het onderzoek toont aan dat 5-methyl-3'-dUTP een veelbelovende SARS-CoV-2-remmer is die zowel de virale RNA-polymerase effectief blokkeert als resistentie biedt tegen de virale correctielees-enzymen, dankzij een nucleobase-methylatie die de enzymatische excisie verstoort.
Deze studie presenteert een geoptimaliseerde ddPCR-assay die, in vergelijking met biologische activiteitstests, nauwkeurigere en reproduceerbaarder kwantificatie van bacteriofaag-virale vectoren mogelijk maakt door zowel de zuiverheid als de potentie te meten via unieke DNA-barcode-doelen.
Dit onderzoek onthult via structurele modellering en experimentele validatie dat de interactie tussen de motor-ATPases PilT en PilU, met name via het C-terminale deel van PilU, essentieel is voor gecoördineerde en krachtige retractie van type IV pili in diverse bacteriesoorten.
Dit onderzoek toont aan dat de stapsgewijze evolutie van multiresistente plasmiden wordt gedreven door synergetische interacties tussen integronen, IS26 en ISCR-elementen, wat leidt tot een nieuw '3I'-kader voor het voorspellen en bewaken van de verspreiding van antibioticaresistentie.
Dit onderzoek toont aan dat biochar de worteluitwas en het rhizosfeermicrobioom van tarwe herschikt, waardoor een gunstige microbiële gemeenschap ontstaat die de plantengroei bevordert en de emissie van broeikasgassen zoals N2O en methaan vermindert.
Deze studie presenteert een machine learning-framework dat de serologische classificatie van pathogene Leptospira-soorten nauwkeurig voorspelt op basis van rfb-locus profielen, waardoor complexe en arbeidsintensieve traditionele tests worden vervangen door een schaalbaar en reproduceerbaar alternatief voor epidemiologisch toezicht en vaccinontwikkeling.
Dit onderzoek concludeert dat 5-6 weken oude vrouwelijke BALB/cJRJ-muizen het meest geschikte diermodel zijn voor de evaluatie van chronische *Mycobacterium abscessus*-infecties, aangezien dit ras een duurzamere infectie vertoont met minder variabiliteit dan C57BL/6NCrl en zonder significante invloed van geslacht of leeftijd.
Deze studie presenteert een set van 25 orthogonale constitutieve promotoren met variërende sterktes, die in diverse cyanobacteriestammen zijn gekarakteriseerd om genetische engineering voor biotechnologische toepassingen te faciliteren.
Dit onderzoek toont aan dat de geautomatiseerde hybrid-capture metagenomische assay ONETest PathoGenome, met een turnaround tijd van minder dan 24 uur, een hoge specificiteit en verbeterde detectie van longpathogenen in bronchoalveolaire lavage biedt in vergelijking met conventionele kweekmethoden.
Deze studie identificeert Zuid-Afrikaanse *Lactobacillus crispatus*-stammen als de meest veelbelovende kandidaten voor een op maat gemaakte biotherapeutische behandeling ter verbetering van het vaginale microbioom en ter vermindering van het HIV-risico bij vrouwen in deze regio.
Dit onderzoek onthult de kristalstructuur van de flagelline van *E. coli* Nissle 1917 en toont aan dat de unieke hypervariabele regio en de daaruit voortvloeiende buitenste domeinen essentieel zijn voor de bacteriële motiliteit in specifieke omgevingen, maar geen invloed hebben op de herkenning door het immuunsysteem via TLR5.
Deze studie toont aan dat de cellulaire helicase DDX3X de replicatie van het Zika-virus in menselijke microglia-cellen reguleert door zowel de eiwitsynthese te bevorderen als de RNA-synthese te remmen, waardoor het een veelbelovend doelwit voor farmacologische ingrepen wordt.
Dit onderzoek toont aan dat darmcommensale bacteriën de groei en virulentie van *Clostridium perfringens*, met name via de modulatie van het gastheer-gerichte {theta}-toxine, kunnen remmen door substraatconcurrentie, wat de microbiome-modulatie als effectieve strategie ter preventie van infecties onderstreept.
Deze studie toont aan dat specifieke samenstellingen van de menselijke darmmicrobiota de competitieve fitness van antibiotica-resistente *Klebsiella pneumoniae*-stammen kunnen beïnvloeden door selectie voor mutaties in het GlyR-regulatorgen, wat leidt tot een voordeel in de strijd om koolhydraten zoals glycerol.
Dit onderzoek presenteert LPhTXdNS1, een veilige en effectieve levend verzwakte vaccinatiekandidaat die bij muizen bescherming biedt tegen de nieuwe, hoogpathogene H5N1-stam die recent in de VS uitbrak bij rundvee en mensen.
Dit artikel beschrijft de eerste geïsoleerde chrysophyten-infecterende reusavirus, ChrysoHV, dat een unieke morfoloogische structuur bezit en opvallend drie rhodopsines codeert, waaronder een proteorhodopsine-achtig eiwit, wat wijst op horizontale genoverdracht tussen mariene bacteriën en virussen.