🦠 Category

microbiology

727 papers

De microbiologie is de fascinerende wereld van het onzichtbare leven, waar we de microscopische organismen bestuderen die overal om ons heen aanwezig zijn. Van bacteriën en virussen tot schimmels en protozoa, deze kleine levensvormen spelen een cruciale rol in onze gezondheid, het milieu en zelfs de productie van voedsel. Op Gist.Science maken we de nieuwste inzichten uit dit dynamische veld toegankelijk voor iedereen, zonder dat je een doctoraat nodig hebt om de complexiteit te doorgronden.

Elke nieuwe preprint die op bioRxiv verschijnt binnen de microbiologie, wordt door ons team direct verwerkt. Wij bieden voor elk artikel zowel een begrijpelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische uitleg, zodat je zelf kunt kiezen hoe diep je wilt duiken in de wetenschap. Hieronder vind je de meest recente onderzoeken uit de microbiologie, direct uit de bron van bioRxiv.

🦠 microbiologie

Six years of clinical herpes simplex virus genotypic acyclovir resistance testing confirms common resistance mechanisms and identifies novel mutations

Deze retrospectieve studie van zes jaar over het eerste Amerikaanse klinische genotypische HSV-resistentietestprogramma bevestigt dat frameshift-mutaties een primaire drijfveer zijn van acyclovirresistentie, terwijl het 23 nieuwe UL23-varianten identificeert om toekomstige karakterisering en therapeutische besluitvorming te begeleiden.

Crawford, K. H. D., Castor, J., LaTurner, K., Mack, A. R., Pepper, G., Greninger, A. L.2026-06-27
🦠 microbiologie

Isolation and characterisation of novel fruit bat alphaherpesvirus from Rousettus aegyptiacus bats in Coastal Kenya

Deze studie rapporteert de isolatie en gedeeltelijke genomische karakterisering van twee nieuwe, nauw verwante alfaherpesvirusstammen afkomstig van *Rousettus aegyptiacus* fruitvleermuizen in kustkenia, die een fylogenetische nabijheid vertonen met primaten-alfaherpesvirussen en verder onderzoek naar hun zoönotische potentieel rechtvaardigen.

Kisoi, G. K., Bargul, J., Kinyua, J., Langat, S., Koka, H., Lutomiah, J., Eyase, F.2026-06-25
🦠 microbiologie

Spatial Transcriptomic Profiling Reveals Microenvironment-Dependent Immune Signatures in a Lyme Arthritis model

Deze studie maakt gebruik van ruimtelijke transcriptomics om te onthullen dat de gezamenlijke micro-omgeving in een muismodel voor Lyme-artritis onderscheidende, regio-specifieke immuunhandtekeningen en fibroblastfenotypen dicteert die evolueren van pro-inflammatoire toestanden tijdens de piek van de infectie naar resolutie na antibioticumbehandeling.

Gura, K. A., Hostetter, M., Potluri, V., Hill, M., Johnson, S., Zhong, Y., Astley, E., Petnicki-Ocwieja, T., Nookala, S. (…)2026-06-25
🦠 microbiologie

SOS-mediated prophage induction constrains resistance evolution to DNA-damaging antibiotics

Deze studie toont aan dat door SOS gemedieerde profaaginductie fungeert als een evolutionaire flessenhals die de frequentie van resistentiemutaties tegen DNA-beschadigende antibiotica beperkt door gastheren met sterke SOS-responsen te elimineren, waardoor selectie plaatsvindt voor zeldzamere, hoog-effectieve mutaties die het SOS-pad dempen en uiteindelijk leiden tot hogere niveaus van resistentie.

Zamora, A., Pai, S. V., Mears, K., Rossine, F., Owen, S., Baym, M.2026-06-24
🦠 microbiologie

Acquisition of Stickland-metabolizing bacteria during infancy prevents Clostridium botulinum infection

Deze studie onthult dat de verwerving van Stickland-metaboliserende bacteriën, zoals *Clostridioides difficile*, tijdens de rijping van de darm bij zuigelingen resistentie tegen *Clostridium botulinum*-infectie verleent door te concurreren voor gedeelde aminozuurafhankelijke nutritionele niches.

Kobayashi, N., Kodaira, Y., Yang, J., Matsumura, T., Yamaguchi, A., Arai, Y., Takahashi, D., Toriumi, H., Komiyama, S. (…)2026-06-24
🦠 microbiologie

Comprehensive profiling of infant gut virome assembly reveals associations with eczema and wheeze

Door een uitgebreide dual-method profileringstoepassing toe te passen op 1.110 longitudinale monsters uit de Lifelines NEXT-cohort, onthult deze studie dat het dynamische infantiele darmviroom wordt gevormd door gastfactoren en de overgang in de levenscyclus van temperente fagen, met specifieke associaties tussen geïnduceerde temperente fagen en de ontwikkeling van eczeem in het eerste levensjaar.

Garmaeva, S., Kuzub, N., Fernandez-Pato, A., Sheveleva, S., Gelderloos-Arends, J., Kruk, M., Gulyaeva, A., Sinha, T., Sp (…)2026-06-24
🦠 microbiologie

Enhanced Prediction of Gut Microbiome-Related Diseases Using Hybrid Machine Learning Models

Dit artikel stelt twee nieuwe stacking-gebaseerde hybride ensemblemodellen voor (EM1 en EM2) die meerdere machine learning-algoritmen integreren om de nauwkeurigheid en robuustheid van het voorspellen van met het darmmicrobioom gerelateerde ziekten aanzienlijk te verbeteren in vergelijking met traditionele single-algoritme en deep learning-benaderingen.

Marisetti, S. A., Chatterjee, P., Priyakumar, U. D.2026-06-24
🦠 microbiologie

Pathogenesis and host response to a novel Tacaribe virus isolate in experimentally-infected Jamaican fruit bats

Deze studie karakteriseert de pathogenese en de gastheerrespons van Jamaicaanse fruitvleermuizen op een nieuw, wildtype Tacaribe-virusisolaat (DOM2014), wat een niet-fatale, persistente infectie met milde leverziekte en beperkte adaptieve immuniteit onthult, waarmee een biologisch relevanter reservoirmodel wordt vastgesteld dan de historisch gebruikte, op muizen gepasseerde TRVL-11573-stam.

Charley, P., Namesnik, L., Soma, P. S., Reers, A. B., Reasoner, C., Zhan, S., Burke, B., Davalos, L. M., Drexler, J. F. (…)2026-06-22
🦠 microbiologie

13C flux ratio analysis with FRAPPPE reveals differences in metabolic fluxes between gut Bacteroidota and Escherichia coli

Dit artikel introduceert FRAPPPE, een op machine learning gebaseerde workflow die gebruikmaakt van 13C-fluxratioanalyse om duidelijke metabole verschillen in het centrale koolstof- en nucleoside-metabolisme tussen darmbacteroidota en Escherichia coli te onthullen.

Torka, D. B., Bartmanski, B. J., Spiegelhalter, A., Herrera Gomez, I., Barcenas Rodriguez, M. N., Drotleff, B., Zimmerma (…)2026-06-19
🦠 microbiologie

Divergent specificity of PatA, GabT, and IlvE defines the branched transamination of Nε-carboxymethyllysine and its metabolite Nε-carboxymethylcadaverine in Escherichia coli

Deze studie verduidelijkt hoe *Escherichia coli* het dieet-geassocieerde advanced glycation end product Nε-carboxymethyllysine (CML) integreert in het stikstofmetabolisme via een vertakt transaminatienetwerk dat gebruikmaakt van de onderscheidende substraatspecificiteiten van PatA, GabT en IlvE, die CML en zijn gedecarboxyldeerde metaboliet omzetten in nieuwe intermediairen.

Vougioukas, P., Aveta, E. F., Hoffmann, V., Lassak, J. M., Hellwig, M.2026-06-16