829 papers
Dit onderzoek toont aan dat bij diverse menselijke bacteriële pathogenen de correlatie tussen mRNA- en proteïneniveaus onder infectie-gerelateerde stresscondities afneemt, wat wijst op een cruciale rol van post-transcriptionele regulatie voor hun aanpassing en overleving.
Deze studie analyseerde 4.505 respiratoire monsters uit de Verenigde Staten (2020-2025) en onthulde dat het Bovine Coronavirus (BCoV) veel voorkomt bij jonge kalveren, vaak samen met andere pathogenen, en dat de geïdentificeerde GIIb-stammen continue evolutionaire veranderingen ondergaan.
Deze studie toont aan dat snelle metagenomische analyses van lucht- en oppervlakte-monsters in ziekenhuizen complexe microbiële gemeenschappen met diverse resistentiegenen en pathogenen onthullen, wat cruciaal is voor het identificeren van transmissieroutes en het verbeteren van de preventie van ziekenhuisinfecties.
Deze studie beschrijft de globale proteomische aanpassingen van de schimmel *Pseudogymnoascus destructans* onder chronische koperstress, waarbij zowel kopertekort als koperovervloed leiden tot significante veranderingen in eiwitniveaus die gerelateerd zijn aan koperopname, oxidatieve stress en mitochondriale functie, en presenteert tevens effectieve antilichamen voor het detecteren van deze stress.
Dit onderzoek toont aan dat in meromictische meren de ontkoppeling tussen abundantie en activiteit van zwavelcyclische bacteriën wordt veroorzaakt door hun specifieke virale infectiestrategieën, waarbij temperatuurvirussen de activiteit van paarse zwavelbacteriën stimuleren terwijl lytische infecties groene zwavelbacteriën beïnvloeden, wat gevolgen heeft voor de interpretatie van geologische biosignaturen.
Dit onderzoek bevestigt voor het eerst de aanwezigheid van de veelvoorkomende schimmelpathogeen *Candida auris* in het Antarctische milieu, waarbij koudeadaptatie, een voorkeur voor nylonbinding en mutator-phenotypes die snelle evolutie en resistentie mogelijk maken, worden onthuld.
Dit onderzoek toont aan dat het *scs*-locus in *Stenotrophomonas maltophilia* een contextafhankelijke rol speelt in hechting en virulentie, waarbij het functioneert als een cruciale regulator die de defecten in andere pilus- en flagellumsystemen compenseert in infectie-omgevingen.
Deze studie toont aan dat de kokerworm *Phoronopsis harmeri* en zijn koker een unieke, minder diverse microbiota herbergen die voornamelijk uit zwavelcyclische bacteriën bestaat en zich duidelijk onderscheidt van de omliggende sedimenten.
Deze studie presenteert een omvangrijk genomisch catalogus van bacteriële en virale genomen uit de zeegrassoort *Zostera marina*, wat nieuwe inzichten biedt in de interacties tussen bacteriën en virussen en hun mogelijke rol in de koolstofcyclus van mariene ecosystemen.
Dit onderzoek presenteert het gedetailleerde genoom van *Colletotrichum* sp. CLE4, een schimmel geïsoleerd uit zeegras, en onthult dat genoomstroomlijning en specifieke aanpassingen mogelijk gerelateerd zijn aan de evolutie van deze schimmel naar een gespecialiseerde, mariene levenswijze.
Deze studie presenteert vijf metagenoom-geassembleerde genomen (MAGs) van eukaryoten, waaronder een novel schimmel in de orde Lobulomycetales, die zijn gerecupereerd uit diepe metagenomische sequencing van de zeegras *Zostera marina* en die nieuwe inzichten bieden in de rol van schimmels en andere micro-eukaryoten in dit mariene ecosysteem.
Dit onderzoek toont aan dat de bacteriële histidinekinase PdtaS van *Mycobacterium tuberculosis* chemisch diverse signalen, zoals koper en stikstofmonoxide, waarneemt door de ligandbinding de dimerisatie van het enzym te remmen, waardoor de constitutieve autofosforylering wordt onderdrukt.
Deze studie integreert bioinformatica en machine learning om potentiële pathogeniciteitseilanden in *Fusobacterium nucleatum* te identificeren en een mechanistisch hypothese te formuleren die ijzerafhankelijke virulentie koppelt aan kankerprogressie via oxidatieve stress en de Hippo-signaalweg.
Dit onderzoek identificeert systematisch de PBP2-subtype SBP-eiwitten als de primaire siderofore-herkenningsfactoren in Gram-positieve bacteriën, onthult hun vaak genomisch ontkoppelde maar gecoördineerd gereguleerde relatie met synthetasegenen, en biedt zo een fundamentele basis voor het reconstrueren van ijzergerelateerde microbiële interactienetwerken.
Deze studie identificeert de atypische Plasmodium-kinase NEK4 als een cruciale regulator die de initiatie van meiose koppelt aan de morfogenese van de zygoten door de verdubbeling van het MTOC en de vorming van microtubuli aan te sturen, wat essentieel is voor de ontwikkeling van de malaria-parasiet.
Dit onderzoek introduceert een dynamiek-gedreven computermethode die, gebaseerd op hoogwaardige tijdsreeksdata van *Pseudomonas aeruginosa*, niet alleen klassieke antibiotica-effecten kwantificeert maar ook nieuwe, op dynamische regimes gebaseerde metrische grootheden definieert om de risico's van onderbehandeling door het negeren van transientie en inoculum-effecten aan te pakken.
Deze grootste tot nu toe uitgevoerde survey van microbiële gemeenschappen in olijven onthult dat de verwerkingsmethode (alkalische behandeling versus natuurlijke fermentatie) de belangrijkste factor is die de bacteriële en schimmeldiversiteit bepaalt, terwijl variabiliteit binnen dezelfde variëteit en producent het onderscheid tussen specifieke Italiaanse PDO-variëteiten bemoeilijkt maar wel waardevolle inzichten biedt voor de ontwikkeling van starterculturen.
Deze studie identificeert en valideert antimicrobiële peptiden uit het menselijke darmmicrobioom die specifiek de biofilm-gerelateerde lectine-eiwitten van *Pseudomonas aeruginosa* targeten, waardoor ze effectief biofilms kunnen verstoren en bacteriële groei kunnen remmen, met daarnaast de ontwikkeling van ultrakorte peptiden met nog sterkere werkzaamheid.
Deze studie analyseert het DNA-viroom van 714 moeder-kindparen in de Lifelines NEXT-cohort om de oorsprong, dynamiek en gezondheidsimplicaties van het darmvirome te ontrafelen, waarbij wordt aangetoond dat de moeder de primaire bron is, dat geboorte- en voedingsmodi de ontwikkeling bepalen, en dat een hogere virale diversiteit geassocieerd is met voedselallergieën.
De auteurs betogen dat de observaties van Hariharan et al. over defecte HIV-genomen geen geldig bewijs vormen voor de therapeutische ondoelmatigheid van interfererende deeltjes, omdat post-hoc observaties geen causale conclusies toelaten, de gerapporteerde R0-waarden intern inconsistent zijn en de bevindingen ook door bestaande mechanismen verklaard kunnen worden.