🧬 biologie

An ingestible bioelectronic capsule for in vivo DNA monitoring in the gastrointestinal tract

Deze studie presenteert een in te slikbare bio-elektronische capsule met een ingebed papiergebaseerd CRISPR/Cas-systeem dat de niet-invasieve, realtime detectie van specifieke DNA-sequenties, zoals die van *Salmonella* en *Helicobacter pylori*, direct binnen het maag-darmkanaal mogelijk maakt om de beperkingen van traditionele ex vivo diagnostische methoden te overwinnen.

Hanjie Wang, Guijie Bai, Xin Huang, Xinran Li, Yinli Bao, Hui Liu, Hongxiang Li, Leilei Wang, Xinyue Cao, Maoxing Yang (…)2026-11-13
🧬 biologie

APAmiRank integrates alternative polyadenylation isoform usage into microRNA target prioritization

Het artikel introduceert APAmiRank, een command-line framework dat alternatieve polyadenylatie-isoformgebruik integreert om de prioritering van microRNA-doelwitten te verbeteren, waarbij wordt aangetoond dat het rekening houden met de blootstelling van 3′UTR-isoformen voorspellende waarde toevoegt aan doelwitrangschikkingen over meerdere experimentele validatiedatasets.

Deren Demirel Yavuz, Irem Durmaz Sahin2026-11-13
🧬 biologie

Cellular contractility-guided osteovascular organoids coordinate metabolic reprogramming and lactate shuttling

Deze studie toont aan dat het kalibreren van cellulaire contractiliteit via de poriestructuur van hydrogels de rijping van functionele osteovasculaire organoïden aanstuurt door metabole herprogrammering te coördineren en efficiënte lactaatshuttling van endotheelcellen naar mesenchymale stamcellen mogelijk te maken, waardoor botvorming en neovascularisatie worden verbeterd.

Longwei Lv, Zhanqi Wang, Zhuqing Wan, Dongdong Huang, Yicheng Yang, Jundan Yi, Xiaoqiang Bai, YangKun Liu, Mingchu Zhao (…)2026-11-13
🧬 biologie

CdMEC-A: An Automated Python Framework for Spatial Mobilome Profiling and Antimicrobial Resistance Risk Stratification in Clostridioides difficile

CdMEC-A is een open-source, high-throughput Python-framework dat de ruimtelijke profilering van antimicrobiële resistentiegenen en mobiele genetische elementen in *Clostridioides difficile* automatiseert om risico's op horizontale genoverdracht te kwantificeren en het mobilisatiepotentieel te stratificeren in actiegerichte niveaus.

Reema Singh2026-11-13
🧬 biologie

An Optimal Control Framework for Adaptive Virtual Reality Interventions in Substance Use Rehabilitation

Dit artikel stelt een optimaal regelkader voor met behulp van een Adaptive-Perturbed-Corrective-Relapse (APCR) compartimentaal model en het principe van Pontryagin om adaptieve Virtual Reality-interventies voor verslavingsrehabilitatie te optimaliseren, waarbij een reductie van 33,26% in gesimuleerd terugvalrisico wordt aangetoond vergeleken met passieve baselines.

Charlotte Cheng, Padmanabhan Seshaiyer2026-11-13
🧬 biologie

Bionomics of Adult Anopheles pseudopunctipennis females (Diptera: Culicidae) in the Historically Malaria- Endemic Focus of Batopilas, Chihuahua, Northwest Mexico

Deze studie karakteriseert de seizoensgebonden abundantie, nachtelijke gastheerzoekende activiteit en pariteit-afgeleide overleving van *Anopheles pseudopunctipennis* in Batopilas, Mexico, waarbij significante seizoensgebonden fluctuaties in populatiedichtheid en bijttijden worden onthuld, samen met een consistent hoog aandeel oudere vrouwtjes, waardoor essentiële basisgegevens worden verstrekt voor malaria-surveillance in Noord-Mexico.

Rodolfo González-Peña, Stephanie Viridiana Laredo-Tiscareño, Erick de Jesús De Luna-Santillana, Jaime R. Adame-Gallegos (…)2026-11-13
🧬 biologie

GraPhiT-RBP: Graph Transformers and Residue-Level Cross-Attention for Interpretable RNA–Protein Binding Prediction

GraphIT-RBP is een uiterst efficiënt en interpreteerbaar graph transformer-framework dat residue-niveau cross-attention gebruikt om nauwkeurig RNA-eiwitbinding te voorspellen en mechanistische determinanten te identificeren, waarbij het bestaande methoden overtreft in zowel nauwkeurigheid als generalisatie over diverse cellijnen heen.

Walter Moss, Abdelraouf Dapour, Tuqa Ibrahim2026-11-13
🧬 biologie

SR-18292 Alters Oocyte Competence and Ovarian Transcriptomic Dynamics in Female Mice

Deze studie toont aan dat het remmen van PGC-1α met SR-18292 bij vrouwelijke muizen de estruscyclus verstoort en de oöcytcompetentie verslechtert ondanks een toename in de ovulatoire output, een fenotype dat gekoppeld is aan specifieke veranderingen in de ovariële metabole en mitochondriale transcriptomische paden.

Mandanda N. Mthethwa, Giovanny Angelita, Yovita Permata Budi, En-Tzu Chang, Chien Huang, Chih-Hsien Chiu, Yi-Fan Jiang2026-11-13
🧬 biologie

Resident bacteria and niche chemistry gatekeep host-specific colonization by commensal fungi

Deze studie onthult dat de gastheer-specifieke kolonisatie van het maagdarmkanaal van de muis door de commensale schimmel *Kazachstania pintolopesii* wordt gereguleerd door gastrische *Lactobacillus*-soorten, die een H₂O₂- en lage pH-afhankelijke antimicrobiële omgeving produceren die selectief schimmelstammen elimineert die onvoldoende mechanismen voor verdediging tegen oxidatieve stress bezitten.

Shipra Vaishnava, Geongoo Han, Casidhe Hughes, Alicia Xu2026-11-13
🧬 biologie

Beyond First Order Kinetics: Sensitivity, Identifiability and the Limits of An Extended Quadratic Version for Petroleum Hydrocarbon Bioremediation: Local, Global and Profile-Likelihood Analysis

Deze studie evalueert de sensitiviteit en identificeerbaarheid van het Hindrance-Modified First-Order Kinetic Model (HM-FOKM) voor de bioremediatie van aardolie koolwaterstoffen, waarbij wordt onthuld dat hoewel de toegevoegde parameter aanzienlijke collineariteit en identificeerbaarheidsuitdagingen introduceert—met name voor de hinderterm—het een structureel eenvoudige en betrouwbare uitbreiding blijft van klassieke kinetiek, mits monitoringsontwerpen rekening houden met deze beperkingen en de algebraïsche eigenschappen van het model gebruiken om de haalbaarheid van tijd-tot-verwijdering-metrieken te bepalen.

Yusuf Momoh2026-11-13