🧬 Category

q-bio

1504 papers

🧬 biology

Fungal diversity in forest's soil: Moderate-term post-thinning effect of a Mediterranean mature Pinus halepensis forest.

Een studie van een mediterraan *Pinus halepensis*-bos in Israël onthult dat hoewel matige uitdunning de totale schimmeldiversiteit licht vermindert, volledige boomverwijdering de bodemkenmerken aanzienlijk verandert en de schimmelgemeenschappen verschuift van symbiotische, door dennen geassocieerde soorten naar saprotrofe en pathogene taxa die typerend zijn voor niet-bosrijke gebieden.

Segula Masaphy, Noam Levi, Limor Zabari, Ezra Orlofsky2026-06-30
🧬 biology

A multi-omics dataset of the developing zebrafish intestine: longitudinal transcriptomic and microbiome profiles in wild-type and IgZ knockout models

Deze studie presenteert een multi-omics dataset die longitudinale transcriptomische en microbiële profielen van wild-type en IgZ-knockout zebravissen integreert om de ontwikkelingsrol van IgZ bij het reguleren van darmimmuniteit en microbiële homeostase te verduidelijken.

Raktakamol Pharrat, Xuyang Zhao, Zhengben Wu, Congran Bei, Yongyao Yu2026-06-30
🧬 biology

Optimization of the 5' untranslated region and codon of the mRNA vaccines

Deze studie toont aan dat het systematisch optimaliseren van de 5'-untranslated regio en het codongebruik van mRNA-vaccins de eiwitexpressieniveaus en stabiliteit significant verbetert, een strategie die is gevalideerd door middel van het succesvolle ontwerp en testen van vaccins tegen het respiratoir syncytieel virus (RSV) F-eiwit.

Qiuji Wang, Xiaorong Peng, Yaqian Zeng, Xindeng Guo, Weineng Meng, Ning Deng2026-06-30
🧬 biology

Integrative single-cell and bulk transcriptomic analysis with Shennong machine learning reveals the landscape of calmodulin associated prognostic genes in breast cancer

Deze studie integreert single-cell en bulk transcriptomische analyses met Shennong machine learning om een acht-genen calmodulin-gerelateerde prognostische signatuur in borstkanker te identificeren, wat de associatie ervan met epitheelceldynamiek, specifieke signaalpaden en potentiële therapeutische doelwitten onthult.

Jian Chen, Wenhui Lai, Can Yang2026-06-30
🧬 biology

Transcriptomic insights into gametogenesis and steroidogenic enzyme gene regulation in Australasian snapper (Chrysophrys auratus) gonads during the reproductive cycle

Deze studie presenteert de eerste transcriptoombrede analyse van de gonaden van de Australische snapper gedurende hun reproductieve cyclus, waarbij geslachts-specifieke genexpressiepatronen in steroidogene enzymen en ontwikkelingsprocessen worden onthuld, terwijl tegelijkertijd de genoomannotatie van de soort wordt verbeterd om toekomstig aquacultuur- en reproductief onderzoek te ondersteunen.

Samuel J. Modern, Matthew J. Wylie, Igor Ruza, Craig Radford, Maren Wellenreuther2026-06-30
🧬 biology

Implication of Aster-mediated transport and endocytosis in intestinal absorption and human bioavailability of fat-soluble vitamins

Deze studie toont aan dat Aster-gemedieerd niet-vesiculair transport en endocytische routes cruciaal zijn voor de intestinale absorptie en menselijke biobeschikbaarheid van de vetoplosbare vitaminen D en E, terwijl vitamine A een Aster-onafhankelijke route gebruikt.

Emmanuelle Reboul, Angélique Berthomé, Donato Vairo, Marine Chotard, Charles Desmarchelier, Mark Zumaraga, Patrick Borel (…)2026-06-30
🧬 biology

Submillimeter postmortem and in vivo diffusion and susceptibility magnetic resonance imaging to characterize cortical micro-and meso-structures

Deze studie toont aan dat submillimeter-resolutie postmortale en in vivo diffusie- en susceptibiliteits-MRI-metrieken een matige correspondentie vertonen in het karakteriseren van menselijke corticale micro- en mesostructuren, wat een uitgebreide anatomische referentie biedt om hoogwaardige postmortale beeldvorming te overbruggen met in vivo neuroimaging-toepassingen.

Yuto Uchida, Hyeong-Geol Shin, Laura Gomez-Isaza, Juan Troncoso, Adnan Bibic, Julianna Gerold, Dongsuk Sung, Yohan Jun (…)2026-06-30
🧬 biology

The influence of Enterocytozoon hepatopenaei infection on lipid and immune pathways in Litopenaeus vannamei

Deze studie maakt gebruik van geïntegreerde transcriptomische en metabolomische analyses om te onthullen dat infectie met *Enterocytozoon hepatopenaei* bij *Litopenaeus vannamei* groeivertraging veroorzaakt door ribosomale suppressie en het lipidenmetabolisme en de immuunsignaalwerking manipuleert, potentieel door het kapen van gastheerbronnen voor membraansynthese voor sporevorming.

Xuan Zhang, Boyao Chen, Changkao Mu, Suming Zhou, Dong Qian, Ping Zhuang, Jiong Chen, Rongrong Ma2026-06-30
🧬 biology

Genomic Characterization of a Multidrug-Resistant Klebsiella quasipneumoniae subsp. similipneumoniae Strain from a Dog Shelter with Prolonged Co-Amoxiclav Use

Deze studie karakteriseert een multidrugresistente *Klebsiella quasipneumoniae* subsp. *similipneumoniae*-stam geïsoleerd uit een Maleisische hondenasiel met een voorgeschiedenis van langdurig gebruik van amoxicilline/clavulaanzuur, waarbij een verschillend microbieel profiel tussen fecale en afvoerwatermonsters wordt onthuld en kritieke tekortkomingen in antimicrobiële stewardship binnen de One Health-context worden benadrukt.

Zhen Yun Siew, Winnie Teh, Isaac Seow, Hong Soon Chin, Siew Tung Wong, Kalaiwaney Muniandy, Nur Amalina Binti Zaharudin (…)2026-06-30
🧬 biology

Long-term exposure to fluoride and tebuconazole alters gill, skin and gut microbiomes in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)

Chronische blootstelling aan milieurelevante concentraties fluoride en tebuconazol verstoort de alfa- en bètadiversiteit, co-occurrence netwerken en taxonomische samenstelling van de kieuw-, huid- en darmmicrobiomen bij regenboogforel, wat leidt tot een verrijking van pathogene en antibioticaresistente bacteriën die de gezondheid van de gastheer en de bredere ecosysteemstabiliteit in gevaar kunnen brengen.

Marine Suchet, Pauline Pannetier, Morgane Danion, Thomas Braunbeck, Préscillia Alves Gomes, Jérôme Cachot, Laure Bellec2026-06-30