🧬 Category

q-bio

1504 papers

🧬 biology

Genome-wide identification and comparative analysis of endogenous retroviruses across five breed-representative pig assemblies

Deze studie vestigt een uitgebreid, ras-specifiek pan-genoomkader voor porciene endogene retrovirussen (ERV's) over vijf varkensassemblages, waarbij wordt onthuld dat hoewel de meeste ERV's zijn gedegradeerd, een kernset van ras-gedeelde, weefselspecifieke ERV-geassocieerde genen overlapt met belangrijke agrarische QTL's en kritieke benchmarks biedt voor het verbeteren van de veiligheid van xenotransplantatie.

Xiaotong Zhao, Yongping Hu, Zhidong Zhang, Xun Xiang, Hua Chang2026-06-24
🧬 biology

Structural and functional dissection of ASCT2 interaction with Syncytin-1 mediating cell-cell fusion

Deze studie maakt gebruik van cryo-EM en functionele assays om te onthullen hoe Syncytine-1 selectief bindt aan de ASCT2-transporter in een naar buiten gerichte, asymmetrische staat die cel-cel fusie mogelijk maakt terwijl residuele transportactiviteit behouden blijft, een specificiteit die wordt bepaald door een breed interactie-interface in plaats van door enkelvoudige residuen.

Dirk Slotboom, Anna Borowska, Krystof Stafl, Michal Sýkora, Jan Rheinberger, Martin Travnicek, Lubomira Pecnova, Anna Ja (…)2026-06-24
🧬 biology

Four new species of the porcini mushroom (Boletaceae) from Indian Himalaya based on morphological and molecular phylogenetic evidences

Deze studie beschrijft vier nieuwe eekhoorntjesbilspecies (*Boletus garhwalensis*, *B. temperatus*, *B. asiaticus* en *B. indohimalayanus*) die zijn ontdekt in de Indiase Himalaya, waarbij gedetailleerde morfologische beschrijvingen, illustraties en moleculaire fylogenetische analyses naast een determinatiesleutel voor soortidentificatie worden verstrekt.

Sudeshna Datta, Sweta Rajput, Alfredo Vizzini, Yash Pal Sharma, Varsha S. Nimbalkar, Michal Mikšík, Kanad Das2026-06-24
🧬 biology

Genome-wide analysis of the two-component system (TCS) genes in apple and functional identification of the MdHK17 gene in promoting bud regeneration

Deze studie karakteriseert uitgebreid de 82-leden tellende two-component systeem genfamilie in appel, waarbij de evolutionaire expansie door segmentale duplicatie en cytokinine-responsiviteit wordt onthuld, terwijl MdHK17 functioneel wordt gevalideerd als een belangrijke regulator van knopregeneratie.

Ping Wang, Wenguang Fan, Shuzhen Jiao, Yaping Huang, Shixiong Lu2026-06-24
🧬 biology

Loganin Attenuates Postmenopausal Osteoporosis by Directly Targeting the RANK/RANKL Interface and Coordinating the Nrf2/HO-1 Antioxidant Axis with Energy Metabolism Reprogramming in Osteoclasts

Loganin vermindert effectief postmenopauzale osteoporose door direct de RANK/RANKL-interactie te verstoren en een multi-targetmechanisme te coördineren dat de osteoclastdifferentiatie onderdrukt via de activatie van de Nrf2/HO-1-antioxidant-as, inhibitie van calciumsignalering en herprogrammering van het energiemetabolisme, en modulatie van celmigratiepaden.

Wei Deng, Yongchao Tang, Yihao Zhu, Fanguo Kong, Shuncong Zhang, Jiyao Luan2026-06-24
🧬 biology

Comparative plastome genomics reveals phylogeny, biogeography, and character evolution of Primula (Primulaceae)

Deze studie maakt gebruik van een uitgebreide plastoomgebaseerde fylogenomische analyse van 106 *Primula*-soorten om langdurige taxonomische ambiguïteiten op te lossen, waarbij wordt onthuld dat de diversificatie van het geslacht werd gedreven door geologische en klimatologische gebeurtenissen in het Mioceen–Plioceen op het Tibetaans-Plateau, terwijl de belangrijkste reproductieve eigenschap, homostylie, minstens acht keer onafhankelijk is geëvolueerd als een adaptatie aan het gebrek aan bestuivers op grote hoogte.

Wan Tang, Shu-Bao Wang, Shi-Dong Wang, Rui Li, Kai-Yun Chen, Yuan Huang, Jia-Hui Chen2026-06-24
🧬 biology

A Predictive, Cumulative Framework for Multivalent Transcription Factor Specificity

Deze studie vestigt een voorspellend, biofysisch gefundeerd kader dat aantoont dat de wijze van multivalente transcriptiefactorassemblage — variërend van flexibele fase-scheiding tot rigide oligomerisatie — bepaalt of genomische specificiteit wordt beheerst door cumulatieve zwakke sitedichtheid of strikte geometrische afstand, waardoor de manier waarop endogene repetitieve sequenties genexpressie reguleren, wordt geherdefinieerd.

Bing Li, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Wanli Yang, Yuqian Feng, Xiang Xu, Siang Lv, Mingqian Hu, Qi Zhang, Ningzhe Li, Mengy (…)2026-06-24
🧬 biology

Structure-Guided Design of Therapeutic Antibodies Targeting SARS-CoV-2 Omicron Variants

Deze studie toont aan dat een op structuur gebaseerde computationele ontwerpstrategie het COV2-2196-antilichaam succesvol heeft geoptimaliseerd om de neutralisatiepotentie tegen SARS-CoV-2 Omicron-varianten te herstellen en te verbeteren, wat een praktisch kader biedt voor de snelle ontwikkeling van breed effectieve therapeutica tegen evoluerende virale stammen.

Jesper Pallesen, Jianqiu Du, Yuanhan Wu, Sukanya Ghosh, Kelly Bayruns, Roopak Sadeesh, David Weiner2026-06-24
🧬 biology

A simple mathematical model for the discontinuity in average nucleotide identity distributions in prokaryotes

Dit artikel presenteert een vereenvoudigd gemiddeld-veld wiskundig model dat aantoont hoe de wisselwerking tussen mutatie, homologe recombinatie en het verval van recombinatie-efficiëntie bij sequentiedivergentie de grootte, afstand en positie van de Average Nucleotide Identity (ANI) gap vormgeeft die de grenzen van prokaryotische soorten bepaalt.

Sebastian Silva-Solar, Rudolf Amann, Tomeu Viver, Ramon Rossello-Mora, Javier Santibañez-Molina, Luis Miguel Rodriguez (…)2026-06-24