🧬 biology

Distinct cortical immune-signaling profiles in autism spectrum disorder and severe mental illness

Deze studie onthult dat hoewel zowel autisme spectrumstoornis als ernstige psychiatrische aandoeningen gepaard gaan met een veranderde corticale neuroimmune signalering, zij verschillende eiwitprofielen vertonen in plaats van een gedeelde inflammatoire staat, waarbij ASD wordt gekenmerkt door verhoogde IL-1-gerelateerde markers en SMI door een toename van eotaxine.

Evan Haley, Erin L. Carlson, Kari L. Hanson, Alicja Omanska, Joseph Schauer, Sabrina Ereshefsky, Dana Tzuahzia Lee, Rebe (…)2026-09-25
🧬 biology

Brain-inspired cascaded EEG speech decoding with conformal calibration and adaptive exit: simulation validation and five-stage real-data assessment

Dit artikel stelt een hersengeïnspireerd gecascadeerd EEG-spraakdecoderingsframework voor en valideert dit, dat conformiteitskalibratie integreert met adaptieve exitmechanismen en Gibbs–Candès adaptieve conformiteitsinferentie om statistisch rigoureuze onzekerheidskwantificering en robuuste realtime prestaties te bereiken, terwijl het systematisch dekkingsfouten diagnosticeert en methodologische baselines vaststelt voor betrouwbare neurale spraaktracking.

daqian chen2026-09-25
🧬 biology

External Transportability and Tissue Context of Parsimonious Breast Tumour-Normal Transcriptomic Score

Deze studie toont aan dat een parsimonieuze borsttumor-normale transcriptomische score, terwijl deze een hoge externe discriminatie behoudt, primair de loss van normale vetweefsel- en lipidenmetabolisme-programma's vastlegt in plaats van uitsluitend een draagbare maligne-cel-signatuur, wat de cruciale rol van weefselcontext in de transporteerbaarheid van classificators benadrukt.

Subhajit Ghosh, Abhirup Saha, Vetrivel Baskar2026-09-25
🧬 biology

A high-quality chromosome-level genome assembly and annotation of the Gansu Red Deer (Cervus elaphus kansuensis)

Deze studie presenteert een hoogwaardige, op chromosoomniveau gebaseerde referentiegenoomassemblage en annotatie van het endemische en nationaal beschermde Gansu-rode hert (Cervus elaphus kansuensis), wat een cruciale genomische bron biedt voor het bevorderen van toekomstig onderzoek naar de genetische diversiteit, evolutiegeschiedenis en instandhouding ervan.

Hai Liu, Yun Fang, Xiaochan Bai, Zuoqing Yan, Qingling Wa, Nan Sun, Guogang Li2026-09-25
🧬 biology

HiDAC: A Hierarchical Dictionary-Aided Compression Framework for Genomic Sequences

Het artikel stelt HiDAC voor, een hiërarchisch woordenboek-ondersteund compressiekader dat concurrerende DNA-compressieratio's bereikt terwijl het tegelijkertijd aanzienlijk snellere downstream-analyses mogelijk maakt, zoals substring-frequentievragen, direct op de gecomprimeerde getokeniseerde representatie zonder volledige decompressie.

Manthan Shah, Rahul Semwal, Imlimaong Aier, Prabhat Tripathi, Pritish Kumar Vardwaj2026-09-25
🧬 biology

Carbon-Convergent Co-utilization of Ethanol and CO2 Enables 3-Hydroxypropionate Biosynthesis in Komagataella phaffii

Deze studie toont aan dat de gemanipuleerde *Komagataella phaffii* recordbrekende de novo productie van 3-hydroxypropionaat bereikt door gebruik te maken van een redox-complementaire "2+1"-strategie die ethanol en CO2 gelijktijdig consumeert, waarmee ongezuiverde chemische CO2-reductiestromen succesvol wordt omgezet in hoogwaardige multicarbonproducten.

Jianming Liu, Tong Liu, Hanbin Lei, Zhiqiang Chen, Yudian Zhu, yongjun mao, Jiacheng Feng, An-ping Zeng2026-09-25
🧬 biology

LucaCell: a sequence-centric foundation model for cross-species single-cell analysis

LucaCell is een sequentie-gecentreerd fundatiemodel dat gebruikmaakt van vooraf getrainde mRNA-sequentie-embeddings in plaats van vaste gen-identificatoren om robuuste cross-species, cross-modale en cross-contextuele single-cell analyse mogelijk te maken, inclusief nauwkeurige celtype-transfer, differentiatie van microbiële soorten en voorspelling van gastheer-virusinteracties.

Yan Sun, Yong He, Minsi Ren, Yanhui Wang, Penghao Xu, Yong Hou, Yu Kang, Tingjun Hou, Jieping Ye, Huanming Yang, Zheng W (…)2026-09-25
🧬 biology

First de novo Transcriptome Assembly of Litylenchus crenatae, the Causal Agent of Beech Leaf Disease

Deze studie presenteert de eerste *de novo* transcriptoomassemblage en annotatie van *Litylenchus crenatae*, de nematode die verantwoordelijk is voor de beukenbladziekte, waarmee een fundamentele genomische bron wordt geboden om toekomstig onderzoek naar de moleculaire mechanismen van deze opkomende bospathogeen te faciliteren.

Andrew Miles, Cecilia Chagas de Freitas, Christopher G. Taylor, Pierluigi Bonello2026-09-25