🧬 Category

q-bio

4656 papers

🧬 biology

HLA-B*57 as a Dominant Genetic Determinant of HIV-1 Elite Control: Comparative Reanalysis of MHC Variant Associations in European and African-American Cohort A reanalysis of published genomic association data

Deze reanalyse bevestigt HLA-B*57 als een dominante, dosisafhankelijke genetische determinant van HIV-1 elitecontrole in Europese populaties, terwijl het ondersteunend bewijs voor verrijking levert voor de tegenhanger met Afrikaanse afkomst, HLA-B*57:03, en acht aanvullende onafhankelijke MHC-varianten identificeert die nader onderzoek in diverse cohorten rechtvaardigen.

Emmanuel Owusu Frimpong2026-08-27
🧬 biology

Computational Prioritization of BARD1 Missense Variants of Uncertain Significance Using Integrated REVEL, CADD, and AlphaMissense Predictions with gnomAD Population Frequency Stratification

Deze studie integreert REVEL, CADD en AlphaMissense-voorspellingen met gnomAD-frequentiegegevens om 170 hoog-prioritaire BARD1 missense varianten van onzekere betekenis te identificeren, die voornamelijk gelokaliseerd zijn in de ANK- en BRCT-domeinen, als primaire kandidaten voor functionele validatie en klinische herclassificatie.

Dripto Roy2026-08-27✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biology

Environmental Predominance and Antimicrobial Resistance Profile of Pseudomonas spp. Isolated from Female Public Washroom Toilet Seats in Dehradun, India

Deze studie onthult dat *Pseudomonas* spp. de dominante bacteriën zijn die worden aangetroffen op de toiletten van vrouwen in Dehradun, India, met een hoge prevalentie van 75% en een gevoeligheidsprofiel dat resistentie vertoont tegen verschillende antibiotica terwijl ze gevoelig blijven voor amikacine, gentamicine en ciprofloxacine.

Anuj Gaur2026-08-27
🧬 biology

Tissue Microstructural Heterogeneity Revealed by MR Microscopy

Deze studie toont aan dat MR-microscopie op micronschaalresolutie intrinsieke microstructurele heterogeniteit van weefsel onthult door de variantie van relaxatietijden, een kenmerk dat bij lagere resoluties wordt verborgen en wijst op een afwijking van conventionele snelle-uitwisselingsaannames als gevolg van incomplete diffusieafhankelijke menging.

Bibek Dhakal, Benjamin M. Hardy, Xiaoyu Jiang, Adam W. Anderson, Mark D. Does, Junzhong Xu, John C. Gore2026-08-27
🧬 biology

Development of a Functional Diversity Index Using GPP, Rao's Quadratic Entropy, and Pianka's Index

Deze studie stelt een nieuwe Functionele Diversiteitsindex (FDI) voor en valideert deze wiskundig, waarbij zuurstofconsumptie en de samenstelling van de dieetniche worden geïntegreerd met behulp van Rao's Kwadratische Entropie en de Index van Pianka, waarmee de interne consistentie en de responsiviteit op consumptieverdelingen worden aangetoond via NetLogo-simulaties en statistische analyses.

Aryan Ayyanger, Henil Parmar, Ahdav Vijay2026-08-27
🧬 biology

An IMU dataset of athletic hammer throwing with phase-segmented kinematic events

Dit artikel presenteert een publieke dataset bestaande uit opnames van traagheidsmetingsunits (IMU) van 11 Spaanse kogelstoters, met gegevens van vier sensoren op 120 Hz en handmatig geverifieerde tijdstempels voor negen belangrijke biomechanische gebeurtenissen om onderzoek in sportbiomechanica en menselijke bewegingsanalyse te ondersteunen.

José Sánchez-Moreno, David Moreno-Salinas, Carlos Revuelta-Parra2026-08-27
🧬 biology

Claim-aware prioritization of microbiome-associated metabolite-target hypotheses using bifidobacterial genome context

Deze studie presenteert een claim-bewuste workflow die genomische mijnbouw, structurele modellering en gerichte experimentele validatie integreert om microbiome-geassocieerde metaboliet-doelwit hypothesen te prioriteren en transparant in kaart te brengen, waarbij specifiek de butyraat-HDAC en indole-IDO1 assen als sterke kandidaten worden geïdentificeerd, terwijl wordt verduidelijkt dat de geobserveerde antitumorale effecten van rumeenzuur exogene verschijnselen zijn die verder onderzoek vereisen in plaats van bevestigde bifidobacteriële productie of PTGS2-gemedieerde mechanismen.

Yilin Chen, Yiming Chen, Yan Zou2026-08-27
🧬 biology

Network Pharmacology and Molecular Mechanisms of Astragalus membranaceus (Huangqi) Targeting Kinase Pathways in Oncological, Cardiovascular, and Metabolic Diseases

Deze studie maakt gebruik van netwerkfarmacologie om aan te tonen dat *Astragalus membranaceus* (Huangqi) gecoördineerde, multi-target therapeutische effecten uitoefent op oncologische, cardiovasculaire en metabole ziekten door gedeelde kinase-gecentreerde signaleringsroutes te moduleren, in het bijzonder de MAPK-, PI3K/AKT/mTOR- en JAK-STAT-cascades.

Aldiyar Abdullayev2026-08-27
🧬 biology

Active-Voxel Selection for Small-Sample fMRI Decoding: Dataset-Dependent Preprocessing and the Cost of Cross-Validation Leakage

Dit artikel toont aan dat bij fMRI-decodering met kleine steekproeven een rigoureuze lekvrije methodologie—specifiek volledig geneste kruisvalidatie en dataset-afhankelijke preprocessingskeuzes—betrouwbare prestatiewinsten oplevert en ernstige accuratierisico's door veelvoorkomende validatiefouten blootlegt, terwijl actieve voxelselectie geen aanvullend voordeel biedt ten opzichte van standaard anatomische maskering binnen de ventrale temporale cortex.

Tanay Chowdhury2026-08-27