🧬 biology

XG-PUL: A Network-Based Framework for Disease Gene Prioritization Using Graph Representation Learning and Positive-Unlabeled Learning

Het artikel stelt XG-PUL voor, een robuust machine learning-framework dat Node2Vec-gebaseerde grafiekrepresentatieleer combineert met een bagging-gebaseerde positive-unlabeled classifier om effectief ziektegeassocieerde genen te prioriteren door de uitdaging van labelonzekerheid in biologische netwerken aan te pakken.

Mahdiyeh Ayouman, Zahra Narimani2026-08-12
🧬 biology

Characterization of corneal epithelium and endothelium with scanning electron microscopy in three avian species

Deze studie maakt gebruik van scanning elektronenmicroscopie om de ultrastructurele morfologie, celdensiteiten en oppervlaktekenmerken van corneaal epitheliale en endotheliale cellen bij drie vogelsoorten (blauw-witte zwaluw, stokduif en roodbuiklijster) te karakteriseren, waarmee de eerste dergelijke beschrijving voor de orden Columbiformes en Passeriformes wordt gegeven.

Clarissa Machado Carvalho, Rosélia LS Araújo, Paula Diniz Galera2026-08-12
🧬 biology

Multiple species of native mosquitoes may be involved in Usutu virus circulation and maintenance in temperate zones

Deze studie toont aan dat meerdere inheemse muggensoorten in gematigd Engeland, met name *Culex pipiens* s.l., een significante rol spelen in de circulatie en het onderhoud van het Usutu-virus, waarbij fylogenetische analyse de co-circulatie van verschillende virale lineages bevestigt en suggereert dat warmer weer de transmissie kan faciliteren.

Robert Calam Bruce, Anthony J. Abbott, Bathsheba L. Gardner, Amy C. Edwards, Harrison Hardy, Mirjam Schilling, Andra-Mar (…)2026-08-12
🧬 biology

Peripheral blood transcriptomic reanalysis prioritizes a neutrophil– matrix metalloproteinase axis and doxycycline in adult tuberculous meningitis

Deze studie reanalyseert transcriptomische gegevens uit perifeer bloed van volwassen patiënten met tuberculose-meningitis om een neutrofiel–matrixmetalloproteïnase-as te identificeren als een cruciaal pathogeen kenmerk, waardoor doxycycline wordt geprioriteerd als een veelbelovende gastheergerichte therapie voor experimentele validatie.

Shuaijia Zeng, Xiaodong Zhang, Xing Cao, Quansheng Liu, Xue Chen, Aili Jia, Xing Chen, Jinhu Wen, Junhao Chu2026-08-12
🧬 biology

Comparative benchmarking of AI research agents for omics data interpretation

Deze studie presenteert een uitgebreide kwantitatieve benchmark van drie gespecialiseerde AI-researchagents (K-Dense, Finch en Biomni) tegenover ChatGPT voor de interpretatie van omics-data, waarbij wordt onthuld dat geen enkele agent alle modaliteiten domineert en dat de agentarchitectuur, in plaats van de capaciteit van het basismodel, de primaire determinant is voor de kwaliteit van de output en de geschiktheid voor specifieke bioinformatische workflows.

Nikita V. Basov, Yosef K. Tirta, Zihan Li, Huan Zhou, Kiryl D. Piatkevich2026-08-12
🧬 biology

MSI-stratified analysis of TREM2 and HAVCR2 expression in mucinous colorectal adenocarcinoma: a structured analytical workflow with signature de-circularization

Deze studie toont aan dat de sterke correlatie op bulkniveau tussen de transcriptie van TREM2 en HAVCR2 in colorectaal carcinoom primair wordt gedreven door de microsatellietinstabiliteit-hoog (MSI-H) status in plaats van door mucineuze histologie, wat het belang onderstreept van MSI-gestratificeerde analyses en signature de-circularisatie om misleidende associaties in immuuntranscriptoomonderzoek te voorkomen.

Qiwen Duan2026-08-12
🧬 biology

Whole-Genome Characterization of Carbapenem Resistance Determinants in Multidrug- Resistant Acinetobacter baumannii from Clinical and Patient-Environmental Isolates

Deze studie karakteriseert de fenotypische en genomische profielen van 110 multiresistente *Acinetobacter baumannii*-isolaten uit klinische en omgevingsbronnen in Mysuru, India, waarbij de universele aanwezigheid van het carbapenemase-gen *blaOXA-23* naast hoge frequenties van *blaOXA-66* en *blaNDM-1* wordt onthuld, wat de kritieke behoefte aan verbeterde genomische surveillance en infectiebeheersingsmaatregelen onderstreept om de verspreiding van carbapenemresistentie in zorginstellingen in te dammen.

Monisha B, Rashmi P. Mahale, Morubagal Raghavendra Rao, Suchitra Shenoy M2026-08-12
🧬 biology

TDP-43 loss drives premature aging and regenerative failure in skeletal muscle stem cells

Deze studie toont aan dat hoewel ALS-geassocieerde TDP-43 gain-of-function mutaties de homeostase van de spieren niet verstoren, een volledig verlies van TDP-43 in skeletspierstamcellen voortijdige veroudering, uitputting van stamcellen en ernstig regeneratief falen triggert.

Sonia Alonso-Martin, Oihane Pikatza-Menoio, Haser Sutcu, María Rodríguez-Hidalgo, Amaia Elicegui, Ainhoa Vidal-Gil, Mari (…)2026-08-12
🧬 biology

MicroRNA-155-5p modulates apoptosis via targeting sirtuin-1 in eosinophilic meningoencephalitis induced by Angiostrongylus cantonensis

Deze studie toont aan dat in door *Angiostrongylus cantonensis*-geïnduceerde eosinofiele meningo-encefalitis, opgereguleerd miR-155-5p Sirtuin-1 target en onderdrukt, waardoor het NF-κB-pad wordt geactiveerd om apoptose in microgliacellen te induceren.

Chung-Fu Hsu, Ke-Min Chen, An-Chih Chen, Kuang-Ping Lan, Cheng-You Lu, Yen-Yun Lin, Shih-Chan Lai2026-08-12
🧬 biology

Food choice and food reward during 60 days of head-down bed rest with exercise and artificial gravity countermeasures in healthy men: The BRACE study

In een 60-daagse bedruststudie met het hoofd naar beneden, die de ruimtevaart simuleerde, ervoeren gezonde mannen een spontane afname in de energie-inname en specifieke verschuivingen in voedingsvoorkeuren en beloning, maar noch lichaamsbeweging, noch kunstmatige zwaartekracht-tegenmaatregelen veranderden deze dieetresponsies significant.

Philippe St-Martin, Anestis Dougkas, Elisa Le Roux, Ritsch Nina, Pierre Bourdier, Matthew Breit, Isabelle Chery, Alexand (…)2026-08-12