🧬 biology

Choosing among Competing Pockets in Oligomeric Proteins: An OIPS-Assisted, Traceable Multi-Evidence Analysis

Het artikel introduceert OIPS, een traceerbaar, multi-evidence raamwerk dat met succes concurrerende bindingsplaatsen in oligomere eiwitten prioriteert door geometrische, ligandabiliteit en assemblage-specifieke gegevens te integreren, waarbij een hoge nauwkeurigheid wordt bereikt bij het identificeren van referentiezitplaatsen terwijl een balans wordt gevonden tussen retrospectieve recuperatie en het behoud van assemblage-ondersteunde alternatieven.

晓 陈, Yifan Zhu, Shilei Zhao, Xin Zhang, Haopeng Sun, Yao Chen, Xin Xue2026-08-10
🧬 biology

A leakage-aware benchmark for evaluating chemical and cellular generalization in single-cell perturbation-response prediction

Dit artikel introduceert een lekgevoelig benchmark-framework dat expliciet train-test-nabijheden definieert om de generalisatiecapaciteiten van single-cell perturbatie-modellen over chemische en cellulaire contexten heen rigoureus te evalueren, waarbij wordt onthuld dat standaard willekeurige splitsingen de prestaties vaak overschatten door structurele en mechanistische overlappingen te behouden die door gezamenlijke held-out validatie succesvol worden geëlimineerd.

Da Lin¹, Ying Chen², Yue Liu², Yu Zhang¹2026-08-10
🧬 biology

Mirror Symmetry Drug Design (MSDD): A Parity-Inversion Framework for Generative De Novo Design of Proteolytically Stable Dual-Targeting D-Peptides against Bcl-2 and Mcl-1

Het artikel introduceert Mirror Symmetry Drug Design (MSDD), een nieuw computationeel raamwerk dat de chirale beperkingen van de huidige generatieve AI omzeilt door doelwitproteïne-pockets te inverteren om de de novo design van proteolytisch stabiele, hoog-affiene D-peptide duale remmers voor Bcl-2 en Mcl-1 mogelijk te maken zonder hertraining van het model te vereisen.

Sharon Melhi2026-08-10
🧬 biology

Occupancy-Driven Attenuation in Radiation-Sensitive Chromatin Domains: A Statistical-Mechanical Model of the Overkill Effect and RBE Maximum

Dit artikel stelt een statistisch-mechanisch model voor dat aantoont dat het "overkill-effect" en het resulterende maximum in relatieve biologische effectiviteit (RBE) voortkomen uit de progressieve bezetting van eindige stralingsgevoelige chromatine-domeinen, wat de vorming van aanvullende letale gebeurtenissen bij een hoge lineaire energieoverdracht (LET) beperkt.

Ladan Rezaee2026-08-10
🧬 biology

Heterozygous HMGB1 variants and neurodevelopmental disorder: phenotypic and allelic spectrum

Deze internationale studie karakteriseert het fenotypische en allelische spectrum van een neurodevelopmentale stoornis veroorzaakt door heterozygote *HMGB1*-varianten, waarbij het onderscheid maakt met BPTAS door te bevestigen dat hoewel microcefalie veelvoorkomend is, de stoornis diverse coderende en niet-coderende mutaties omvat die niet de arginine-rijke C-terminale staart genereren die geassocieerd wordt met het laatstgenoemde syndroom.

Himanshu Goel, Kayla Treat, Theodore Wilson, Angela Peron, Manuela Morleo, Vincenzo Nigro, Konrad Platzer, Rosanna Krako (…)2026-08-10
🧬 biology

Transcriptomic and Metabolic Basis of Volatile Compound Dynamics in Apricot Fermentation

Deze studie verduidelijkt de temporele dynamiek van aroma-biosynthese in *Wickerhamomyces anomalus* LY13 tijdens de fermentatie van abrikozenresten, waarbij wordt onthuld dat belangrijke vluchtige verbindingen pieken bij 48 uur gedreven door vroege geninductie en waarbij een specifieke kortketenige alcoholdehydrogenase (WICANDRAFT_98376) wordt geïdentificeerd die verantwoordelijk is voor de omzetting van fenylacetaldehyde naar 2-fenylethanol.

Lei Li, Yunfei Chen, Zhifei Chen, Jiaming Zhao, Xueying Cao, Haoyang Chen, Gaolei Xi, Li Han, Xingwang Song2026-08-10
🧬 biology

Invasion status and mycorrhizal responsiveness jointly shape context-dependent plant-soil feedbacks in Northern Great Plains grasslands

Deze studie toont aan dat in de graslanden van de Noordelijke Grote Vlakten de responsiviteit van mycorrhiza alleen niet bepalend is voor positieve plant-bodemfeedback; in plaats daarvan wordt een positieve feedbacklegacy uniek gegenereerd door de invasieve bladspoor door een combinatie van vijandelijke vrijgave en mutualistaccumulatie, terwijl inheemse mycorrhiza-responsieve soorten negatieve feedbacken accumuleren die worden gedreven door bodempathogenen.

Rebeca Crespo-Teixeira, Hanh N. H. Pham, Jonathan A. Bennett2026-08-10
🧬 biology

Scalable regional genomic surveillance reveals previously unrecognized SARS-CoV-2 recombinant diversity and limited onward transmission

Door 3.360 SARS-CoV-2-genomen uit noordoost-Duitsland te analyseren met een nieuw tweestaps detectiekader, onthult deze studie significante onbekende recombinante diversiteit en toont zij aan dat hoewel co-infecties frequent voorkomen, de succesvolle verdere transmissie van recombinanten een belangrijke evolutionaire beperking blijft.

Christian Kohler, Ana Tzvetkova, Anne Pohlmann, Kathrin Lehmann, Tilo Sasse, Veronika Balau, Martin Beer, Lars Kaderali (…)2026-08-10