🧬 Category

q-bio

4345 papers

🧬 biology

MicroRNA Profiling of Human Primary Trabecular Meshwork Cell, Trabecular Meshwork Progenitor Cell Spheres and Their Differentiated Cells

Deze studie identificeert een specifieke microRNA-signatuur die de identiteit en differentiatie van menselijke trabeculaire meshwork-progenitorcellen reguleert, waarbij wordt onthuld hoe TGF-β-signalering dit programma tegengaat en wat mogelijke miRNA-mRNA-doelwitten zijn voor de ontwikkeling van glaucoomtherapieën gericht op het behoud van deze cellen.

Xiaochen Fan, Chelsey Doyle, Brian Lane, Emine Bilir, Olivia Kingston, Victoria Kearns, Colin Willoughby, Carl Sheridan2026-09-23
🧬 biology

Oral chitosan-delivered recombinant CtxB–Intimin–Tir (CIT) fusion antigen elicits functional mucosal immunity against enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7

Deze studie toont aan dat een oraal vaccin dat chitosan-nanodeeltjes gebruikt om een recombinant CtxB–Intimin–Tir (CIT) fusieantigeen toe te dienen, effectief een robuuste mucosale en systemische immuniteit opwekt bij muizen, wat resulteert in significante bacteriële afdoding, verminderde epitheliale adhesie en bescherming tegen enterohemorragische *E. coli* O157:H7 infectie.

Saeedeh Saeediᵃ, Shiva Bayatᵃ, Seyed Latif Mousavi Gargari2026-09-23
🧬 biology

Transcriptomics of C 3 +CAM Peperomia species reveals potential initial steps toward a CAM pathway

Deze studie identificeert C3+CAM-soorten binnen de Hawaïaanse Peperomia en maakt gebruik van transcriptomica om aan te tonen dat de opregulatie van het fosfoenolpyruvaatcarboxylasekinase (PPCK)-gen, potentieel gereguleerd door circadiane ritmes, een cruciale eerste stap vormt in de evolutie van CAM vanuit ancestrale C3-fotosynthese.

G Young Kim, David Wickell, Cassidy Downs, Chase Kane, Karolina Heyduk2026-09-23
🧬 biology

Reconstructing sequence-grammar trajectories enables interpretable and tunable cis-regulatory element design

Het artikel presenteert GO-CRE, een interpreteerbaar deep learning-framework dat een hybride Transformer-Mamba2-model combineert met reinforcement learning en sequentie-grammatica trajectreconstructie om diverse, celtype-specifieke cis-regulerende elementen te ontwerpen en experimenteel te valideren met verbeterde activiteit en specificiteit.

Mingqian Ma, Wanjuan Bu, Guoqing Liu, Yuxuan Liu, Sizhen Liu, Zhen Zhao, Shijie Yao, Qingru Hua, Yujie Zhang, Cuiting Zh (…)2026-09-23
🧬 biology

Comparative Genomics Reveals Divergent Adaptive Strategies in Classical Pathogenic and Environmental/Opportunistic Brucella Lineages

Deze studie vergelijkt de genomen van klassieke pathogene en omgevings-/opportunistische Brucella-lijnen, waarbij wordt onthuld dat de eerste compacte, geconserveerde genomen bezit die geschikt zijn voor gastheerspecialisatie, terwijl de laatste grotere, meer diverse genomen vertonen met bredere accessoire genenrepertoires die zijn aangepast aan heterogene milieuniches.

Zhao Caihong, Dang Xinyu, Ahmad Ali, Rakhshanda Rani, Xingmei Deng, Zhang Hui, Jia Guo, Yong Wei, Sun Zhihua2026-09-23
🧬 biology

CRISPR/Cas9-mediated multicopy δ-site integration in Saccharomyces cerevisiae via Cas9 expression

Deze studie presenteert een geoptimaliseerde CRISPR/Cas9-strategie die gebruikmaakt van induceerbare Cas9-expressie en een gereduceerd aantal plasmidekopieën om DNA-schade en toxiciteit te beperken, waardoor efficiënte multicopy-integratie van heterologe genen in de δ-sites van het *Saccharomyces cerevisiae*-genoom mogelijk wordt.

Oleksandra Pidkurhanna, Olena Tigunova, Sergiy Shulga2026-09-23
🧬 biology

Transient Gut Microbiota Modulation and Baseline Bacteroides Abundance Predict Constipation Recurrence in Children With Cerebral Palsy: A 4‑Year Longitudinal Cohort Study

Deze vierjarige longitudinale studie naar kinderen met cerebrale parese onthult dat hoewel door synbiotica geïnduceerde verbeteringen in de darmmicrobiota tijdelijk zijn na het staken van de behandeling, een hogere baseline *Bacteroides*-abundantie significant een lagere constipatie-recidive voorspelt, wat wijst op de potentiële bruikbaarheid ervan voor gepersonaliseerde risicostratificatie.

Xiaoli Li, Weikeng Yang, Peiqin Wang, Dongming Meng, Congfu Huang2026-09-23
🧬 biology

Haplotype diversity and variant switching associated with long-term transmission and outbreak dynamics of Dengue virus 3 genotype III lineages

Deze studie analyseert hoogresolutie genomische gegevens van het denguevirus 3 in Singapore van 2015 tot 2025 om aan te tonen dat variantwisseling en haplotypediversiteit belangrijke evolutionaire drijfveren zijn van langdurige transmissie en uitbraakdynamiek, waarbij een sterke positieve correlatie wordt aangetoond tussen de genetische diversiteit van het virus, de ziektelast en de vectorabundantie.

Rou Xuan Lee, Gladys Yeo, Carmen Koo, Vanessa Goh, Yee Ling Lai, Judith Chui Ching Wong, Lee Ching Ng, Hapuarachchige Ch (…)2026-09-23
🧬 biology

Spatial divergence of virus-bacteria interaction networks in upstream and downstream sediments of the Three Gorges Dam and their association with sediment ecological multifunctionality

Deze studie onthult dat de Driekloofdam ruimtelijke divergentie induceert in de interactienetwerken tussen sedimentvirussen en -bacteriën, waarbij het preferentiële verlies van dynamische netwerkcomponenten stroomafarts — in plaats van enkel diversiteit — fungeert als een primaire bemiddelaar die omgevingsveranderingen verbindt met de afname van de ecologische multifunctionaliteit van het sediment.

Zhuo Zhang, Ruilin Huang, Tiancheng Liu, Kaikai Zheng, Xian Xiao, Yuan Zhao2026-09-23