Copy aware deconvolution of Hi-C interactions in extrachromosomal DNA using CADET
Het artikel introduceert CADET, een computationele methode die direct kopie-specifieke Hi-C interactiematrices voor extrachromosomaal DNA (ecDNA) afleidt met behulp van expectation-maximization, waardoor de ambiguïteit veroorzaakt door gedupliceerde genomische segmenten wordt opgelost zonder dat driedimensionale structurele reconstructie vereist is.