q-bio papers | Gist.Science

Mechanical plasticity as a unifying axis for the thermodynamics of biological information machines

Dit artikel introduceert een verenigende mechanische parameter gebaseerd op de zachtheid van functionele coördinaten ten opzichte van thermische ruis om biologische informatiemachines te ontleden in collectieve modi, waardoor consistente thermodynamische limieten voor capaciteit en energiekosten worden afgeleid terwijl empirische gedragingen bij ribosomen, ionpompen en synapsen succesvol worden voorspeld.

Pablo Garcia Tello2026-07-24

📄 overig

Genome-wide identification and characterization of the GH3 gene family in Rosa chinensis

Deze studie presenteert de eerste genoombrede identificatie en uitgebreide bioinformatische karakterisering van de acht RcGH3-genen in *Rosa chinensis*, waarbij hun fylogenetische relaties, genomische distributie, geconserveerde motieven en potentiële regulerende mechanismen worden verduidelijkt om een fundament te leggen voor toekomstig functioneel onderzoek.

Tingting Sun, Xinxin Gao, Jingyu Li2026-07-24

📄 overig

Communication-space representation of multicellular tissue organization

Het artikel introduceert CommuSpace, een computationeel raamwerk dat de organisatie van meercellige weefsels herdefinieert door cellen te mappen in een communicatieruimte gebaseerd op ligand–receptorinteracties, waardoor emergente "communicatie-ecosystemen" worden onthuld als een fundamentele hogere laag van de weefselarchitectuur die de traditionele classificaties van celidentiteit en ruimtelijke niche overstijgt.

Hui-Sheng Li, Pai Peng, Yu-Ting Tan, Jia-Juan Tu, Xiao-Fei Zhang, Shou-Feng Shen, Luonan Chen2026-07-24

📄 overig

Plant architecture reveals contrasting developmental strategies in two threatened West African timber species (Khaya senegalensisand Pterocarpus erinaceus): implications for conservation and sustainable forest management

Deze studie biedt de eerste uitgebreide architecturale karakterisering van de bedreigde West-Afrikaanse houtsoorten *Khaya senegalensis* en *Pterocarpus erinaceus*, waarbij hun onderscheidende ontwikkelingsmodellen en plastische reacties op milieugradiënten worden onthuld om een wetenschappelijke basis te leggen voor het optimaliseren van hun behoud, herbebossing en duurzaam beheer.

Beda Innocent ADJI, Doffou Sélastique Akaffou, Kouadio Henri Kouassi, Marc Jaeger, Sylvie Annabel Sabatier, Jérôme Dumin (…)2026-07-24

📄 overig

EEG-to-Report: An Annotation and Feature–Text Framework for Training Language Models on Clinical EEG

Het artikel introduceert EEG-to-Report, een browsergebaseerd framework dat klinische EEG-annotatie stroomlijnt door de integratie van multi-format dataingestie, interactieve visualisatie en geautomatiseerde extractie van kenmerken om gestructureerde feature-tekstparen te genereren voor het trainen van multimodale taalmodellen en het opstellen van geautomatiseerde klinische rapporten.

The Tran2026-07-24

📄 overig

A Consensus Multifeature Deviation Index for Specific Detection of Locomotor Perturbation From Individualized-Baseline Wearable Inertial Signals

Dit artikel introduceert de Gait Perturbation Burden (GPB), een ongesuperviseerde, consensus-multifeature-index die gebruikmaakt van geïndividualiseerde draagbare inertiële baselines om specifiek locomotore perturbaties te detecteren met aanzienlijk minder fout-positieven tijdens normaal lopen vergeleken met single-feature of amplitude-only methoden.

Alex Kubiak, Farzad Haji Boloori, Jared Nichols2026-07-24

📄 overig

Phylogeny-associated codon evolution and conditional boundary dinucleotide structure in Platycerium plastomes

Deze studie toont aan dat synonieme codongebruik in *Platycerium*-plastomen fylogenetische signalen behoudt over geografische lineages heen, terwijl het een geconserveerd, evolutionair significant tekort aan CpG-dinucleotiden bij codongrenzen onthult dat standhoudt ondanks strikte controles voor sequentiecompositie en codonaantallen.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-07-24

📄 overig

Epigenetic Dysregulation and H19 Suppression in Psoriasis: An SEM Approach

Deze studie past Structural Equation Modeling (SEM) toe op transcriptomische psoriasisdata, waarbij een statistisch significante structurele relatie wordt onthuld tussen epigenetische dysregulatie en de pathologie van de ziekte die sterk wordt gekenmerkt door de downregulatie van het lange niet-coderende RNA H19.

Antonio Romeu, Lluís Arola2026-07-24

📄 overig

Human Precursor microRNA Terminal Loop Regions Exhibit Distinct Sequence Characteristics and Motif Enrichment

Deze studie biedt de eerste uitgebreide karakterisering van de terminale lusregio's van menselijk pre-miRNA, waarbij onderscheidende sequentiearchitecturen worden onthuld die worden gedefinieerd door specifieke lengteverdelingen, positionele nucleotidebiases en verrijkte motieven die de miRNA-biogenese en eiwitinteracties kunnen beïnvloeden.

Amit Cohen, Mario Alberto Burgos-Aceves, Yoav Smith2026-07-24✓ Author reviewed ⓘ

📄 overig

Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

Deze empirische studie toont aan dat de voorgetrainde gen-token embeddings van het scGPT-model inherent fysieke eiwit-eiwitinteractiestructuren coderen, zoals bewezen door een significant hogere cosinusgelijkenis tussen interagerende genparen vergeleken met gematchte niet-interagerende controles over meerdere databases heen.

Liu Chen2026-07-24

← Vorige Volgende →