4988 papers
Deze studie evalueert de prestaties van diverse modelgebaseerde en graafgebaseerde clusteringalgoritmen onder verschillende ruimtelijke en voorverwerkingscondities om praktische begeleiding te bieden voor het nauwkeurig afleiden van populatiestructuur en allelfrequenties in genomische datasets.
Dit artikel introduceert BEAM-1, een biofysisch geïnformeerd multischalig wiskundig kader dat de wetten van Fick en Einstein-Stokes integreert om de doorlaatbaarheid van de bloed-hersenbarrière voor 25 CZS-geneesmiddelen te voorspellen en te rangschikken, waarbij het succesvol Levodopa en Temozolomide identificeert als de meest doorlaatbare terwijl het een kosteneffectief alternatief biedt voor traditionele in vitro testen.
Deze studie maakt gebruik van een geïntegreerde bio-informatische benadering om het hypothetische eiwit RvY_05612 uit *Ramazzottius varieornatus* te karakteriseren, waarbij het wordt geïdentificeerd als een basisch, transmembraan Sec61β-familie-eiwit van 98 aminozuren dat gelokaliseerd is in het endoplasmatisch reticulum en waarschijnlijk de intracellulaire proteïnetransport faciliteert.
Deze studie onthult dat door Citrus bark cracking viroïde veroorzaakte groeivertraging in hop wordt gedreven door een persistente, gecoördineerde onderdrukking van fotosynthese en stikstofopname die in de lente begint en leidt tot onomkeerbaar biomassaverlies, in plaats van door een dominante immuun-signalerende respons.
Deze studie introduceert een volledig geautomatiseerde "virtuele arts" die ADHD diagnosticeert op basis van standaard 128-kanaals EEG-opnames zonder tussenkomst van een expert door gebruik te maken van een deep learning-pipeline om diagnostisch significante neurofysiologische patronen te identificeren — specifiek in het venster van 150-300 ms — die traditionele statistische methoden over het hoofd zien, waardoor de menselijke expert-bottleneck in EEG-interpretatie wordt geëlimineerd.
Deze studie vestigt een reproduceerbare machine learning-ondersteunde SHG-microscopie workflow die onderscheidende collageenmicroarchitecturen tussen fibrose en trabeculair bot in beenmergbiopten onthult, waarmee wordt aangetoond dat specifieke annotatiestrategieën cruciaal zijn voor nauwkeurige kwantitatieve morfometrische analyse van weefselremodellering.
Deze studie toont aan dat de SARS-CoV-2 hoofdprotease (Mpro) sinds het Omicron-tijdperk evolutionair geconstrueerd is gebleven door structurele en functionele vereisten, waardoor de substraatherkenning behouden blijft en de levensvatbaarheid ervan als een robuust, langetermijn antiviraal doelwit wordt ondersteund.
Dit artikel onderzoekt systematisch de manifold-hypothese in proteïnelanguagemodellen (pLMs) met behulp van een uitgebreide batterij aan geometrische en topologische diagnostische instrumenten, waarbij wordt geconcludeerd dat, in tegen tegenstelling tot single-cell foundation models, pLM-representaties overwegend hoogdimensionaal en lineair zijn in plaats van georganiseerd rond lage-dimensionale manifolds.
Deze empirische studie onthult dat hoewel biologische grote taalmodellen (SCFMs) een werkelijke, laagdimensionale en gedeeltelijk lineair gestructureerde geometrie voor biologische kennis coderen, deze structuur bescheiden is, vaak niet lineair verstrengeld is en grotendeels overlapt met wat klassieke expressiegebaseerde methoden zoals PCA al kunnen herstellen, waardoor het tekortschiet ten opzichte van de heldere, regelmatige geometrie die wordt waargenomen in natuurlijke taalmodellen.
Dit artikel presenteert een verenigde benchmark van elf virtuele celmodellen, die onthult dat hoewel deep learning-benaderingen baselines aanzienlijk overtreffen bij representatietaken en de voorspelling van combinatorische perturbaties, ze over het algemeen niet in staat zijn om eenvoudige lineaire modellen te overtreffen bij het voorspellen van ongeziene enkelvoudige gen-perturbaties, wat suggereert dat het veld een "virtuele microscoop" heeft bereikt voor de analyse van celtoestanden in plaats van een ware "virtuele simulator" voor causale perturbatiedynamiek.