🧬 biologie

Causal Responsibility Based Explainable AI for Vibrational Spectroscopy Applied to Cancer Diagnostics

Dit artikel introduceert Spec-ReX, een op causale verantwoordelijkheid gebaseerde Explainable AI-methode voor vibrationele spectroscopie in de kankerdiagnostiek, en valideert rigoureus de prestaties ervan ten opzichte van andere XAI-technieken over in silico, in vitro en ex vivo datasets om te voldoen aan de kritieke behoefte aan transparante klinische besluitvorming.

Nathan Blake, David Kelly, Sarah Kapllani-Mucaj, Rong Wang, Geraint Thomas, Hana Chockler2026-06-29
🧬 biologie

Cohesin-mediated replication fork tethering enables fork slowing and reversal

Deze studie onthult dat door cohesine gemedieerde lusextrusie aangrenzende replicatievorken aan elkaar koppelt om hun vertraging en omkering tijdens replicatiestress te bevorderen door PRIMPOL te remmen, waardoor genoomorganisatie wordt geïntegreerd met DNA-schade-tolerantie om genomische stabiliteit te beschermen.

Massimo Lopes, Daniel González Acosta, Daniel Giménez-Llorente, Melani Rodrigues, Moses Aouami, Orhi Barroso-Gomila, Jav (…)2026-06-29
🧬 biologie

The Artemis I mission reshaped seed amino acid composition and post-flight plant growth in a genotype-dependent manner

De Artemis I-missie induceerde genotype-afhankelijke veranderingen in de aminozuurprofielen van zaden en de groei na de vlucht in *Arabidopsis thaliana*, wat onthulde dat het metabolisme van vertakte keten aminozuren een kritieke factor is die de reacties van planten op blootstelling aan de diepe ruimte beïnvloedt.

Joanne E Thomson, Evan Angelos, Ramona Gaza, Dinah Dimapilis, Ye Zhang, Kamber Scott, James O’Keefe, Federica Brandizzi2026-06-29
🧬 biologie

Genetic dissection of dynamic leaf area index variation in maize using UAV-based phenotyping and time-series genome-wide association studies

Deze studie vestigt een robuust kader dat door UAV-gebaseerde multispectrale fenotypering en tijdreeks-genoombrede associatiestudies integreert om dynamische genetische loci en het kandidaatgen *Zm00001d048615* te identificeren die de bladindex van maïs reguleren, wat waardevolle doelwitten biedt voor het verbeteren van de bladerdekarchitectuur en opbrengst.

Xuyang Wang, Jiaojiao Ren, Penghao Wu2026-06-29
🧬 biologie

Sustained transcription and permissive chromatin in murine spermiogenesis

Deze studie daagt de lang gevestigde opvatting uit dat spermiogenese gepaard gaat met globale transcriptionele stillegging door aan te tonen dat het haploïde genoom transcriptioneel actief en dynamisch georganiseerd blijft gedurende deze fase, wat een herdefinitie van de late spermatide-differentiatie als een periode van transcriptionele specialisatie in plaats van shutdown noodzakelijk maakt.

Bing Li, Yimin Lao, Jingdong Xue, Yixuan Pan, Mengyuan Peng, Qi Zhang, Ming Yu, Lijuan He, Meiyang Liu, Mingqian Hu, Yuq (…)2026-06-29
🧬 biologie

Daily symptom reports enable four-phase menstrual cycle tracking without wearables: Implications for equitable digital health

Deze studie toont aan dat een hybride machine learning-model dat gebruikmaakt van dagelijkse zelfgerapporteerde symptoomvariabiliteit nauwkeurig vier menstruatiecycli fasen kan classificeren zonder draagbare sensoren, wat een schaalbare en rechtvaardige oplossing biedt voor wereldwijde reproductieve gezondheidsmonitoring.

Bernhard Specht, Mohammad EL-Khozondar, Samaher Garbaya, Reinhard Schneider, Djamel Khadraoui, Zied Tayeb2026-06-29
🧬 biologie

Efficient exploration of conformational ensembles via protein interaction-informed deep learning

Dit artikel introduceert DynoM, een generatief deep learning-framework getraind op interacties van eiwitcomplexen dat bestaande modellen die enkel op monomeren zijn gebaseerd aanzienlijk overtreft in het voorspellen van nauwkeurige conformationele ensembles en het onderdrukken van structurele hallucinaties door gebruik te maken van de lange-afstands fysieke beperkingen die inherent zijn aan complexe data.

Zilin Ren, Duo Liu, Qianyi Jia, Qiantong Jin, Yubin Liu, Chan Liu, Zhixiang Sui, Luyao Han, Yixiang Zhang, Xin Yang, Pin (…)2026-06-29
🧬 biologie

Delayed downstream detection and persistence of fish eDNA in a low-flow stream: a field observation

Deze studie levert veldbeleg dat in stromen met een lage debiet, vis-eDNA-signalen een vertraagde stroomafwaartse verschijning vertonen en gedurende een bepaalde periode aanhouden nadat het bronorganisme is verwijderd, wat de noodzaak benadrukt om rekening te houden met transportdynamiek en temporele persistentie bij het interpreteren van eDNA-gegevens in lotische ecosystemen.

KeonHee Kim, KyuJin Kim, JongWook Kim, JaeGoo Kim, Ji-Woong Choi, Min-Ho Jang2026-06-29
🧬 biologie

Machine Learning of Tumor Microenvironment Related Genes for Prostate Cancer Biochemical Recurrence Prediction and Immune Analysis

Deze studie heeft een robuust machine learning-gebaseerd prognostisch model geconstrueerd en gevalideerd met behulp van 32 tumor micro-omgeving-gerelateerde genen om biochemische recidief bij prostaatkanker te voorspellen, waarbij onderscheidende immuunlandschappen en potentiële therapeutische sensitiviteiten voor risico-gestratificeerd patiëntenbeheer werden onthuld.

Taize Sun, JunCheng Chen, Fei Wang2026-06-29