q-bio papers | Gist.Science

ALS as a Multivariable Feedback Instability System: Three‑Variable Dynamical Model, Phase‑Space Analysis, and Optimal Control

Dit artikel stelt een driedimensionaal dynamisch model van ALS voor als een multivariabel feedback-instabiel systeem, waarbij door middel van fase-ruimteanalyse en optimale controletheorie wordt aangetoond dat het verschuiven van de therapeutische strategie van enkelvoudige doelwitremming naar getimede, gesloten-lus, multimodale interventies effectief het ziekteverloop terug kan sturen naar een gezonde homeostatische staat, terwijl de balans tussen werkzaamheid en toxiciteit wordt gewaarborgd.

Zhuofan Shen2026-09-22✓ Author reviewed ⓘ

🧬 biology

Polymorph-Dependent Success of Generative Protein Design Against Amyloid Fibrils: A Cross-Method Benchmark Including AL Amyloidosis

Deze studie vergelijkt generatieve eiwitontwerptools met amyloïde fibrillen van AL-amyloïdose, Parkinson en Alzheimer, waarbij wordt onthuld dat het succes van het ontwerp wordt bepaald door specifieke amyloïde polymorfen in plaats van het type ziekte, waarbij diffusiegebaseerde methoden hallucinatiegebaseerde benaderingen overtreffen en een sterke correlatie laten zien tussen de bèta-sheet-neigingsgraad en bindingsvertrouwen.

Siddhardha Nanda2026-09-22

🧬 biology

Integrated transcriptomic and proteomic analysis reveals molecular targets of vasopressin in GT1-7 GnRH neurons

Deze studie presenteert het eerste uitgebreide multi-omics profiel van GT1-7 GnRH-neuronen, waarbij wordt onthuld dat arginine vasopressine hun secretieactiviteit moduleert via gecoördineerde transcriptionele, post-transcriptionele en metabole regulatie door het identificeren van 73 consistent gereguleerde moleculen en belangrijke signaalroutes.

Ran Tao, Xiaofen zhang, Zhu Zhu, Wei Wang, Feng Huang2026-09-22

🧬 biology

Polymorph-Independent Resistance to Generative Protein Design Across Five Tau Fibril Folds: A Cross-Tauopathy Benchmark

Deze studie toont aan dat, in tegenstelling tot andere amyloïde systemen waarbij het succes van design varieert per structureel polymorf, alle vijf de verschillende tau-fibril vouwen over verschillende tauopathieën heen uniform resistent zijn tegen generatief eiwitbinder-design, wat suggereert dat resistentie een familiespecifieke eigenschap is in plaats van een universeel kenmerk van amyloïde geometrie.

Siddhardha Nanda2026-09-22

🧬 biology

Beyond Accuracy: Benchmarking the Reproducibility and Robustness of Single-Cell Embeddings

Dit artikel introduceert BioBench, een framework dat de aanname uitdaagt dat reproduceerbaarheid correleert met de modelklasse door via de Biological Stability Score aan te tonen dat algoritmische solvers, in plaats van de vraag of een methode lineair of diep is, de primaire determinanten zijn van de stabiliteit van single-cell embeddings.

Advika Jain2026-09-22

🧬 biology

Cell-free DNA profiling for cancer detection and monitoring in dogs: a cross-study benchmark

Deze studie vestigt een verenigd benchmarkingskader met behulp van 896 plasma-sequencingruns van 341 honden om aan te tonen dat een nieuwe, op fragmentlengte gebaseerde kenmerkenset (FlowTail), wanneer deze wordt geïntegreerd met bestaande schatters van tumorlast, robuuste, overdraagbare en nauwkeurige detectie van kanker, type-discriminatie en longitudinale monitoring mogelijk maakt over onafhankelijke caniele studies heen.

Bin Li, Ming-shan Tsai, Floryne O. Buishand2026-09-22

🧬 biology

Multi-omics analyses reveal hypoxia-induced CHD2 as a key driver of malignant progression and microenvironment remodeling in HCC via the TGF-β/SMAD axis

Deze studie identificeert door hypoxie geïnduceerd CHD2 als een cruciale oncogene driver in hepatocellulair carcinoom die maligne progressie en immuunontwijking bevordert door het TGF-β/SMAD-pad te activeren, waardoor het wordt gevestigd als een potentiële biomarker en therapeutisch doelwit.

YICHEN YANG, Ren Bingyi, Sheng Kai, Bai Zhiyuan, Ren Yang, Yi Lv, Liu Kang2026-09-22

🧬 biology

In Vivo Evaluation of the Efficacy, Biosafety, and Bioavailability of Potential NBC Probiotic Strains

Deze studie toont aan dat vijf specifieke melkzuurbacteriestammen (NBC99, YEA81, SA74, NBC5527 en NBC2255) effectief oxidatieve stress verminderen, de integriteit van de darm- en bloed-hersenbarrière versterken en systemische inflammatie bij muizen mitigeren zonder toxiciteit te veroorzaken, waardoor hun potentieel als veilige probiotica voor het moduleren van de darm-hersenas wordt ondersteund.

Elvan Anadol, Ateş Kara, Hasan Tezer, Şaban Cem Sezer, Zeynep Yığman, Deniz Billur, Beyza Aydoğan Kara, Sibel Söylemez (…)2026-09-22

🧬 biology

A Visual Metric for Biological Membrane Instability: Geometric Coupling of Lateral Expansion and Acyl Chain Splay as a Geometric Precursor Signature of Packing Defects in Glutamate Transporter Splice Variant Self-assemblies

Deze studie introduceert de Packing Defect Geometry Plot (PDGP), een op Python gebaseerde tool die het lokale Voronoi-oppervlak correleert met acylketen-splay om hydrofobe verpakkingsdefecten te identificeren, waarbij wordt onthuld dat afgeplatte glutamaattransporteur-homodimeren meer membraan wanorde en defectbezetting induceren dan grotere assemblages, in tegenstelling tot de initiële verwachtingen.

Alper Karagöl, Taner Karagöl2026-09-22

🧬 biology

A Reproducible Meta-Analytic Pipeline for Quantifying Ecological Bottlenecks, Alpha Diversity Decay, and Core Biomarker Fluctuations in Ex Vivo Human Gut Microbiota Fermentations

Dit artikel presenteert een reproduceerbare op R gebaseerde statistische pijplijn die de onmiddellijke ecologische drift in ex vivo menselijke darmmicrobiota-fermentaties kwantificeert, waarbij een acute instorting van 87,9% in taxonomische rijkdom en significante gemeenschapsherstructurering wordt onthuld bij overdracht van in vivo naar kunstmatige bioreactormilieus.

Ismael Akala2026-09-22

← Vorige Volgende →