🧬 biology

Inverted repeat sequences involved in high-frequency T-DNA truncation in “Princettia” (Euphorbia pulcherrima × Euphorbia cornastra)

Deze studie onderzoekt de hoogfrequente T-DNA-truncatie in "Princettia" poinsettia-transformanten en stelt een nieuw model voor waarbij lange inversie-herhalende sequenties die breukpunten flankeren, truncatie en de toevoeging van extra DNA-sequenties triggeren.

Koya Ito, Reiko Kogishi, Sayaka Shindo, Rina Shimo, Yukiko Shimbo, Maki Ohtsubo, Keisuke Matsui, Kenichi Suzuki, Koichi (…)2026-07-13
🧬 biology

A Construction of Archaean Rest-Like Biology from Genomics

Deze studie presenteert een systematische comparatieve genomische survey van 1.024 archaeale genomen die het coderend potentieel voor stress-overlevings-effectoren en sequentie-specifieke DNA-bindende regulatoren kwantificeert, waarbij een bijna universele stress-toolkit en een lineage-afhankelijke, superlineair schalerende regulatorische architectuur wordt onthuld die dient als een structurele analogie voor de eukaryote REST/NRSF-logica, terwijl expliciet wordt opgemerkt dat deze bevindingen genetisch potentieel vertegenwoordigen in plaats van bevestigd fysiologisch gedrag.

Ajay Vellanki2026-07-13
🧬 biology

RNA folding below the nanopore impairs direct RNA sequencing fidelity and modification calling

Deze studie identificeert dat RNA-secundaire structuren die onder de nanopore vouwen tijdens directe RNA-sequencing systematische ionische stroomverstoringen en fout-positieve modificatie-calls veroorzaken, waardoor een kritieke behoefte wordt vastgesteld aan structuurbewuste modellen om de sequencing-getrouwheid te verbeteren.

Jana Wiedermannová, Marek Schwarz, Josef Pánek, Saran Natarajan, Veronika Kočárková2026-07-13
🧬 biology

Ingestion of Poly-Ethylene Terephthalate Nanofragments Derived from Plastic Bottles Triggers Long-term Gut Inflammation and Microbiome Dysbiosis in Mice

Deze studie toont aan dat de inname van polyethyleentereftalaat (PET) nanoplastics, die veel voorkomen in waterflessen, ernstige langdurige darmontsteking, microbiële dysbiose en genotoxiciteit bij muizen induceert, wat grotere risico's voor de gastro-intestinale gezondheid met zich meebrengt dan polystyreen nanoplastics.

Aswin Kuttykattil, Hannes R. Van Goethem, Raquel Egea, Arnau Rocabert, Adriana Rodríguez-Garraus, Sonja Holme, Aliro Vil (…)2026-07-13
🧬 biology

Developmental Landscape of Gradients in Human Hippocampus

Door drie grootschalige ontwikkelingscohorten te analyseren, onthult deze studie dat de menselijke hippocampus is georganiseerd in drie reproduceerbare gradiënten met afzonderlijke maturatietrajecten die geometrische beperkingen progressief versoepelen om de corticale hiërarchie te orkestreren en de ontwikkeling van episodisch geheugen en executieve functies te ondersteunen.

Debin Zeng, Qiongling Li, Deyu Li, Yirong He, Xiaoxi Dong, Zekun Yang, Yiyu Zhang, Shaoxian Li, Shenghan Bi, Ting Xu, Xu (…)2026-07-13
🧬 biology

What Drives GNN Performance in Tissue Dynamics? Insights from Vertex-Model Simulations

Deze studie benchmarkt vijf Graph Neural Network-architecturen op 1.615 gesimuleerde weefselgrafen die T1-transities ondergaan, waarbij wordt onthuld dat het Provably Powerful Graph Network (PPGN) een hoge nauwkeurigheid bereikt met minimale data door een hybride voorspellingsstrategie toe te passen en weefselstoornis als een sleutelfactor benadrukt die de betrouwbaarheid van het model beïnvloedt.

Matej Krajnc, Troy Comi, Siqi Miao, Adnan Hafeez, Hadar Serviansky, Pan Li, Tomer Stern2026-07-13
🧬 biology

Functional Depth Biomarkers Distinguish Lung Squamous Cell Carcinoma from Lung Adenocarcinoma

Deze studie introduceert een functioneel diepte-analyseframework dat ruimtelijke transcriptomica en netwerkstatistiek integreert om longplaveiselcelcarcinoom te onderscheiden van adenocarcinoom door het identificeren van subtype-specifieke pathway-coördinatiearchitecturen, mutatie-gestuurde herbedrading en micro-omgevingsprogrammeringspatronen die nieuwe mechanistische biomarkers voor precisie-oncologie onthullen.

Sagnik Bhadury, Ashley P. Tsang, Dipankar Ray, Kiran Lagisetty, Arvind Rao2026-07-13
🧬 biology

Functional inertia reveals history-dependent organization of large-scale brain dynamics

Dit artikel introduceert "functionele inertie" als een geschiedenisafhankelijke, multilaterale beperking op hersendynamiek die activiteit structureert in coherente regimes en verklaart hoe hetzelfde onderliggende mechanisme betere cognitieve prestaties kan voorspellen bij gezonde individuen, terwijl het tegelijkertijd leidt tot een grotere symptoomernst bij schizofrenie, waardoor stabiliteit en volatiliteit worden geherformuleerd als contextafhankelijke expressies van één enkel organiserend principe.

Sir-Lord Wiafe, Vince Calhoun2026-07-13
🧬 biology

Genome-wide association analysis of growth traits in Tianzhu white yak

Deze studie maakte gebruik van sequencing met een lage dekking en genoombrede associatieanalyse op 536 Tianzhu White Yak-individuen om 366 significante SNP-loci en 32 kandidaatgenen te identificeren die geassocieerd zijn met belangrijke groeikenmerken, wat waardevolle genetische markers biedt om precisieveredingsprogramma's te bevorderen.

Guowu Yang, Xuedong Qi, Yongfu La, Xiaoming Ma, Yicheng Liu, Zhicheng Wang, Wenxue Luo, Wenwen Ren, Zhenyu Zhang, Min Ch (…)2026-07-13
🧬 biology

Effects of shoe longitudinal bending stiffness and runner level on Achilles tendon loading in experienced and novice male runners: a musculoskeletal modelling study

Deze musculoskeletale modelleringsstudie onthult dat zowel het ervaringsniveau van de hardloper als een verhoogde longitudinale buigstijfheid van de schoen onafhankelijk de belasting van de achillespees verhogen, waarbij beginnende hardlopers zich aan stijvere schoenen aanpassen via proximale compensaties terwijl ervaren hardlopers dat niet doen, wat een geïndividualiseerde benadering van optimale schoenstijfheid ondersteunt.

Shixin Lin, Hao Yuan, Jiaying Shao, Dongwei Liu, Mianfang Ruan, Ye Ma2026-07-13