🧬 Category

q-bio

1432 papers

🧬 biology

Single-cell and spatial transcriptomic profiling of primary versus recurrent glioblastoma identifies PLOD2 as a core orchestrator of hypoxic niche remodeling and mesenchymal transition

Deze studie integreert multi-omics profilering om PLOD2 te identificeren als een kritieke drijfveer van glioblastoomrecidief die de remodellering van de hypoxische niche en de mesenchymale transitie orkestreert via een PLOD2/LAMA4-as, waardoor behandellereactie wordt bevorderd en een potentieel therapeutisch doelwit wordt geboden.

Zhong Wang, Fei Wang, Wenqian Cao, yuhan Bai, Yining Zhang, Chen Yang, Run Huang, Haohao Qiu, Yanbo Yang, Juyi Zhang, Yo (…)2026-07-07
🧬 biology

Genome-wide characterization of Plasmodium vivax infections in local travelers and non-travelers from the Peruvian Amazon

Deze studie maakt gebruik van whole-genome sequencing om aan te tonen dat hoewel *Plasmodium vivax*-infecties bij reizigers in de Peruaanse Amazone een hogere genetische diversiteit en heterogeniteit vertonen, zij grotendeels genetisch verbonden blijven met lokale niet-reizende populaties, wat daarmee de integratie van genomische en epidemiologische gegevens ondersteunt om geïmporteerde van lokaal verworven malaria-overdracht te onderscheiden.

Mahdi Safarpour, Luis Cabrera-Sosa, Johanna H. Kattenberg, Ramses Deyaert, Anna Rosanas-Urgell, Joseph M. Vinetz, Jean-P (…)2026-07-07
🧬 biology

The chromosome-level genome of Elsholtzia splendens provides insights into genome evolution and environmental adaptation

Deze studie presenteert een chromosoomniveau-genoomassemblage van de koper-hyperaccumulerende plant *Elsholtzia splendens*, die onthult hoe transposon-explosies, genfamilie-expansies en specifieke Heavy Metal ATPase-netwerken gezamenlijk de extreme koper tolerantie aansturen en waardevolle genetische doelwitten bieden voor bodemfytoremediatie.

Licao Cui, Yiting Su, Han Lin, Xiaofeng Yang, Yu Lu, Yuzhe Song, Yihan Li, Qinglin Ke, Ruimin Li2026-07-07
🧬 biology

Concentration-Dependent Membrane Interactions and Pore Stability of Aurein 1.2 and LLAA Revealed by Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulations

Grofkorrelige moleculaire dynamica-simulaties onthullen dat het aurein 1.2-analoog LLAA een sterkere membraaninsertie en een diepere interactie met bacteriële membranen vertoont vergeleken met het natuurlijke peptide, maar minder stabiele poriën vormt die snel uiteenvallen, terwijl aurein 1.2 de stabiliteit van langdurige poriën behoudt, wat benadrukt hoe subtiele sequentie- en ladingverschillen de mechanismen van membraaninteractie en poriedynamiek dicteren.

Roshanak Ansarihaghi2026-07-07
🧬 biology

Metabolic profiling of retinal organoids reveals conserved core metabolites and alterations in glycolytic, and amino acid pathways

Deze studie maakt gebruik van ongerichte GC-MS metabolomische profilering om aan te tonen dat hoewel muisretinale organoïden een geconserveerde kern van de metabole signatuur van het natieve retina behouden, ze specifieke veranderingen vertonen in glycolytische, aminozuur- en TCA-cycluspaden die wijzen op een onvolledige metabole rijping.

Pragati Gupta, Claudia Wiesner, Focke Zimmsen, Jeroen Klevering, Purva Kulkarini, Zohreh Hosseinzadeh2026-07-07
🧬 biology

Complete Genome Sequence of SalmonellaPhage vB_SenS_Horemheb

Deze studie rapporteert de isolatie en volledige genoomkarakterisering van de nieuwe *Jerseyvirus*-fage vB_SenS_Horemheb uit Egyptisch afvalwater, waarmee het potentieel als een veilig therapeutisch middel tegen voedseloverdraagbare salmonellose wordt bevestigd vanwege de afwezigheid van virulentie- en resistentiegenen.

Bishoy Maher Zaki, Hadeer Ghonim, Mark G. Emil, Sohaila A. Al-Abraq, Suha A. Farraj, Ramy Karam Aziz2026-07-07
🧬 biology

Mold Fungi Syncephalastrum contaminatum STG-160 and Cladosporium sphaerospermum STG-161 from 16 th century icon—Risks of Tempera Pigments Degradation

Deze studie karakteriseert de zware metaaltolerantie en de siderofoor-producerende vermogens van twee schimmelsoorten geïsoleerd van een 16e-eeuwse Russische icoon om specifieke temperapigmentgebieden te identificeren die kwetsbaar zijn voor degradatie, waardoor gerichte biocidische behandelingen voor de conservering van het kunstwerk kunnen worden gestuurd.

Daria Avdanina, Anna Ermolyuk, Egor Troyan2026-07-07
🧬 biology

A fibroblast–myeloid niche supports stress adapted residual oesophageal adenocarcinoma after neoadjuvant chemotherapy

Deze studie maakt gebruik van geïntegreerde single-cell en ruimtelijke transcriptomica om te onthullen dat resterende oesofageale adenocarcnoomcellen die neoadjuvante chemotherapie overleven, worden ondersteund door een specifieke fibroblast-myeloïde niche, wat benadrukt dat behandelresistentie voortkomt uit zowel maligne celplasticiteit als micro-omgevingsbescherming.

Samuel Hill, Ian Reddin, Christina Putnam, Rushda Rajak, Sonya James, Jeanette Norman, Robert Walker, Jack Harrington, M (…)2026-07-07
🧬 biology

Babesia capensis sp. nov. – Description of a Babesia species causing disease in domestic cats from South Africa

Deze studie beschrijft en benoemt formeel *Babesia capensis* sp. nov., een nieuwe grofvormige piroplasma die ziekte veroorzaakt bij huiskatten in Zuid-Afrika, gebaseerd op de kenmerkende morfologische, genetische en fylogenetische eigenschappen, terwijl tevens de associatie met caracals en de responsiviteit op diminazeneaceturaatbehandeling wordt opgemerkt.

Gad Baneth, Marinda C. Oosthuizen, Aletta Mulder, Yaarit Nachum-Biala, S. Marcus Makgabo, Ilse Vorster, Jacqueline Bisho (…)2026-07-07