🧬 Category

q-bio

1432 papers

🧬 biology

Evolutionary dynamics and genomic diversification of the mcr-9.1 region in Cronobacter sakazakii across four decades

Deze studie reconstrueert de 43-jarige evolutionaire geschiedenis van de mcr-9.1-regio in *Cronobacter sakazakii*, waarbij een geconserveerde kernstructuur wordt onthuld die is geëvolueerd tot een complex, semi-mobiel genomisch module dat voornamelijk geassocieerd was met het chromosoom in vroege isolaten, maar in recente jaren steeds vaker gekoppeld is aan plasmiden door clonale expansie en horizontale genoverdracht.

Shafaa Shawqi Ali2026-07-07✓ Author reviewed ⓘ
🧬 biology

Source- and Release-Aware Calibration Recovers EGFR Potency Prediction Under Cross-Source and Future-Release Domain Shift

Dit artikel toont aan dat hoewel standaard EGFR-potentiemodellen lijden onder ernstige prestatiedegradatie bij cross-source en future-release domeinverschuivingen, hun voorspellende nauwkeurigheid effectief kan worden hersteld door middel van een lichtgewicht, bron- en release-bewuste residuele kalibratiestrategie met behulp van een kleine set scaffold-disjuncte ondersteunende labels.

Nhat Trinh Ngoc Minh, Kien Pham Xuan, Vinh Truong Hoang, Hien Nguyen Thanh, Linh Nguyen Thi My2026-07-07
🧬 biology

Immune Cell Heterogeneity in Multiple Sclerosis Reveals Myeloid-Specific Dysfunction and Distinct Regulatory Programs Across CD14+, CD4+, and CD8+ Immune Cells

Deze studie maakt gebruik van geïntegreerde systeembiologische analyse van bulk RNA-seq data om aan te tonen dat hoewel Multiple Sclerose gepaard gaat met immuunheterogeniteit over CD14+, CD4+ en CD8+ cellen, CD14+ myeloïde cellen de meest diepgaande transcriptionele en regulatoire dysfunctie vertonen, gekenmerkt door pro-inflammatoire, metabole, Wnt- en calciumsignaleringsafwijkingen, wat hen benadrukt als een centrale drijfveer van de MS-immunopathologie.

Ali Salari, Mahdi Yazdani, Marzieh Sharifi Pasandi, Masih Akbari, Parsa Saadati, Abolfazl Sahabjo, Mohammad Hosein Shahs (…)2026-07-07
🧬 biology

Peripheral PDCD4 Expression Links to T-Cell Immune Dysregulation in Major Depressive Disorder: Integrated Multi- Cohort Transcriptomic Analysis

Deze geïntegreerde multi-cohort transcriptomische analyse onthult dat hoewel de expressieniveaus van perifeer PDCD4 stabiel blijven bij een depressieve stoornis, deze nauw gecorreleerd zijn met T-cel immuunhandtekeningen en ontstekingsroutes, wat suggereert dat PDCD4 dient als een belangrijke perifere immuuncorrelaat in de pathofysiologie van depressie, ondanks het ontbreken van een directe causale link met het ziekterisico.

Jing Ke, Pan Liu, Kun Hao, Luyuan Yao, Yang Liu2026-07-07
🧬 biology

Automated Classification and Quantification of Fungal Spores in Aerobiological Sampling Using Deep Learning

Deze studie presenteert een op deep learning gebaseerde aanpak met behulp van het YOLO26l-model die de detectie en kwantificering van acht schimmelgenera in aerobiologische monsters aanzienlijk versnelt en standaardiseert, waarbij een hoge nauwkeurigheid en een sterke correlatie met handmatige tellingen wordt bereikt terwijl de verwerkingstijd wordt teruggebracht van uren naar minder dan twee minuten.

Dámaris A. Jiménez-Uribe, Deyson Gómez Sánchez, Jeison D. Jimenez, Rosa Acevedo-Barrios, Carolina Rubiano-Labrador, Hern (…)2026-07-07
🧬 biology

Species Composition, Feeding Behaviour and Plasmodium falciparum infectivity of Malaria Vectors along an altitudinal gradient in parts of Plateau State, Nigeria

Deze studie uit 2023 in de staat Plateau, Nigeria, karakteriseerde de soortensamenstelling, het voedingsgedrag en de *Plasmodium falciparum*-infectiviteit van malariavectoren, waarbij *Anopheles gambiae* sensu lato als de dominante soort werd onthuld met hoge mensbeetpercentages en een significante sporozoïetprevalentie, waardoor de noodzaak voor continue surveillance en de overweging van gedragsplasticiteit in vectorbestrijdingsstrategieën werd onderstreept.

Hayward Babale Mafuyai, Ishaya Tanko, Georgina Samuel Mwansat, Nentawe Gurumdimma, David Enekai Oguche, Eche Onah Otakpa (…)2026-07-06
🧬 biology

In Silico Screening and Molecular Dynamics Validation of Bryophyllum Pinnatum Flavonoids as Pi3kγ Inhibitors For Rheumatoid Arthritis

Deze studie maakt gebruik van een uitgebreide in silico workflow, inclusief moleculaire docking, ADMET-profilering, MM-GBSA-berekeningen en 100 ns moleculaire dynamica-simulaties, om luteoline, quercetine en kaempferol uit *Bryophyllum pinnatum* te identificeren als krachtige en stabiele PI3Kγ-remmers met veelbelovend therapeutisch potentieel voor de behandeling van reumatoïde artritis.

Success O. Olubode, Olamide V. Awelewa, Samuel O. Olubode, Lateef Bello, Olufemi A. Akinola, Oluwafemi S. Bakare, Samuel (…)2026-07-06
🧬 biology

Phosphorus Availability Modulates Rhizospheric Bacterial Communities in Elite and Landrace Wheat Genotypes

Deze studie toont aan dat fosforarmoede in tarwe, met name in landras-genotypes, de zeldzame rhizosferische bacteriële biosfeer uitbreidt en het functionele potentieel verandert zonder de kernstructuur van het microbioom significant te verstoren, wat inzichten biedt voor microbioom-geïnformeerde veredeling en nutriëntenbeheersingsstrategieën.

Seema Garcha, Puja Srivastava2026-07-06
🧬 biology

Microbial successional dynamics during Thalassia testudinum polycyclic aromatic hydrocarbons rhizoremediation

Deze studie toont aan dat de zeegrassoort *Thalassia testudinum* de rhizoremediatie van recalcitrante polycyclische aromatische koolwaterstoffen in kustsedimenten significant verbetert door zuurstof af te geven en diverse microbiële gemeenschappen te stimuleren, waarbij nutriëntentoevoeging de degradatie verder versnelt en aerobe hydrocarbonoclastische taxa verrijkt.

Alonso de la Garza Varela, Ma. Leopoldina Aguirre-Macedo, Brigitta I. van Tussenbroek, José Q. García-Maldonado2026-07-06
🧬 biology

From Semiotic Fitting to Semiotic Collapse: A Multi-Level Process Model of Extinction

Dit artikel stelt een meerlagig procesmodel van uitsterven voor en valideert dit empirisch als de geleidelijke ineenstorting van semiotische systemen, waarbij wordt aangetoond dat een meetbare index van semiotische overlap (SO) over zes biologische rijken dient als een superieure voorspellende indicator van populatiedaling vergeleken met klassieke demografische of variantiegebaseerde vroegtijdige waarschuwingssignalen.

Amir Mohammad Falak Aflaki2026-07-06