🧬 Category

q-bio

4413 papers

🧬 biology

Computational Design and In Silico Evaluation of Indole-2-Carboxamide Derivatives as Mycobacterium tuberculosis Membrane Protein (MmpL3) Inhibitors Using 2D-QSAR, Molecular Docking, and Molecular Dynamics Simulation

Deze studie maakte gebruik van een geïntegreerde computationele benadering, inclusief 2D-QSAR, moleculaire docking en MD-simulaties, om indole-2-carboxamide-derivaten te ontwerpen en te evalueren als potentiële MmpL3-remmers, waarbij verbinding 17c werd geïdentificeerd als een veelbelovende kandidaat met een superieure bindingsaffiniteit en gunstige farmacokinetische eigenschappen, ondanks de noodzaak voor toekomstige experimentele validatie.

Thomas Aondofa Nyijime, Gideon Adamu Shallangwa, Adamu Uzairu, Abdullahi Bello Umar, Muhammad Tukur Ibrahim2026-09-12
🧬 biology

Palaeogenetic Insights into Kinship and Social Organization at the Early Bronze Age “Princely” Barrow Cemetery of Łęki Małe, Poland

Deze studie maakt gebruik van genoombrede gegevens van vijf individuen op de begraafplaats Łęki Małe uit de Vroege Bronstijd in Polen om een stamboom van twee generaties te reconstrueren, waarbij wordt onthuld dat elite-grafpraktijken selectief biologische verwantschap naar voren brachten door middel van variabele modi van inclusie, zoals symbolische representatie en volledige lichaaminterment, waardoor sociale identiteit werd gestructureerd rond specifieke biografische relaties in plaats van normatieve verwantschapsstructuren.

Nicolas Antonio da Silva, Janusz Czebreszuk, Marzena Szmyt, Ben Krause-Kyora, Johannes Müller2026-09-11
🧬 biology

Evolution of MAF and OTX families during the emergence and stabilization of rod photoreceptors across Metazoans

Deze studie verheldert hoe gen-duplicatie, positieve selectie en de co-evolutie van de MAF-familie transcriptiefactor NRL met OTX-familie eiwitten en hun cis-regulerende elementen de opkomst en stabilisatie van mammale staafjes-fotoreceptoren aanstuurden, wat hun overleving tijdens het Mesozoïcum mogelijk maakte.

Anand Swaroop, Soumitra Pal, Noor White Carreiro, Zachary Batz, Leo Goubet-McCall, Caroline Judy2026-09-11
🧬 biology

Accessing non-fungal eukaryotic diversity in soil from Svalbard through DNA metabarcoding

Deze studie maakt gebruik van multi-marker DNA-metabarcoding (ITS2 en Cox1) om de niet-fungale eukaryote diversiteit in de gletsjervoorvelden van Spitsbergen te karakteriseren, waarbij wordt onthuld dat de gemeenschapscompositie en diversiteit sterk worden gestructureerd door milieugradiënten zoals temperatuur, pH en organische koolstofgehalte langs de primaire successiechronosequentie.

Dafne Anjos, Rodrigo Goldenberg-Barbosa, Anna Donato, Pedro Sasaki, Letícia Bastos Eller, Luiz Miguel Pontes Abrahão, Fa (…)2026-09-11
🧬 biology

SRPK1 and SEM1 as Key Polyamine Metabolism-Related Genes in Non-Small Cell Lung Cancer: Integrated Bioinformatics Analysis, Mendelian Randomization, and In Vitro Validation

Deze studie integreert bio-informatica, Mendeliaanse randomisatie en in vitro experimenten om SRPK1 en SEM1 te identificeren als sleutelgenen gerelateerd aan polyamine-metabolisme in niet-kleincellige longkanker, waarbij wordt aangetoond dat SRPK1 tumorprogressie bevordert door ODC1 en SAT1 te reguleren en de potentie ervan als diagnostische biomarker en therapeutisch doelwit benadrukt wordt.

Fanlan Zeng2026-09-11
🧬 biology

Resolving the Limitations of Energy- Density-Based Dosimetry in the Laser Therapy Approach by Proposing a New Optical-Thermal Modeling Study with the Aid of the Arrhenius Damage Equation and the Monte Carlo Technique

Deze studie stelt voor om de ontoereikende op energiedichtheid gebaseerde dosimetrie in lasertherapie te vervangen door een fysiologisch gefundeerd, op schade gebaseerd kader door een Monte Carlo-geïntegreerd optisch-thermisch model en de Arrhenius-vergelijking te gebruiken om aan te tonen dat biologische uitkomsten afhangen van het specifieke tijdsverloop van temperatuur en weefselgevoeligheid in plaats van enkel de totale energie.

Mahya Faramarzi Rad, Fatemeh Rezaei, Shaghayegh Fouladvandi2026-09-11
🧬 biology

Mitochondrial diversity and demographic history of Arctica islandica (Bivalvia: Venerida) in the German waters of the Baltic Sea

Deze studie onthult dat de populaties van *Arctica islandica* in de Duitse Oostzee een hoge mitochondriale diversiteit en een geschiedenis van postglaciale expansie vertonen zonder significante regionale genetische structurering, wat erop wijst dat zij wijdverspreide lineages delen met het bredere amfi-Atlantische bereik, ondanks het feit dat zij in afzonderlijke brakke omgevingen leven.

Louisa Alina Schulz, Katharina Kniesz, Heiko Stuckas, Fabian Wolf, Michael Lothar Zettler2026-09-11
🧬 biology

Ancestry-Associated Distribution of IL6, IL1B, and TNF Variants Reveals Differential Genetic Susceptibility to Inflammatory Diseases

Deze studie onthult significante afkomstgeassocieerde verschillen in de distributie van inflammatoire genvarianten (IL6, IL1B en TNF) tussen Mexicaanse Mestizo- en inheemse populaties, waarbij inheemse groepen lagere frequenties van risicoallelen vertonen vergeleken met Mestizo's en Europeanen, wat daarmee de noodzaak onderstreept van afkomst-geïnformeerde benaderingen voor het beoordelen van de vatbaarheid voor inflammatoire ziekten.

Jesús Iván Rodríguez-Rodríguez, Héctor Rangel‑Villalobos, Guadalupe Ávalos-Navarro, Karina González‑Becerra2026-09-11
🧬 biology

Integrating Molecular Diagnostics and Interpretable Machine Learning to Identify Genetic Drivers of Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis

Deze studie toont aan dat het integreren van interpreteerbare machine learning-modellen met routinematige cycle threshold (Ct) moleculaire data van *Mycobacterium tuberculosis*-isolaten in het rurale Oostelijke Kaap nauwkeurig resistentiepatronen van geneesmiddelen kan voorspellen en belangrijke genetische drijfveren kan identificeren, wat een schaalbaar kader biedt om het tuberculosebeheer in gebieden met een hoge ziektelast en beperkte middelen te verbeteren.

Kamvelihle Sabisa, Ncomeka Sineke, Kelvin Tafadzwa Mpofu, Ntandazo Dlatu, Teke Apalata, Lindiwe Modest Faye2026-09-11
🧬 biology

An APOD-EFEMP1-COL5A2 fibroblast programme marks a matrix-remodelling, vascular and myeloid-associated niche linked to adverse gastric cancer outcomes

Deze studie integreert multi-omics data om een APOD-EFEMP1-COL5A2 fibroblastprogramma in maagkanker te identificeren dat een matrix-remodellerende, vasculaire en myeloïde-geassocieerde niche definieert die gekoppeld is aan ongunstige klinische uitkomsten en suggereert toetsbare mechanistische hypothesen voor therapeutische interventie.

Chuan Liu, Tao Wang, Mengmeng Li, Hao Zhang2026-09-11