💻 Category

bioinformatics

1235 artigos

A bioinformática une biologia e computação para desvendar os mistérios da vida através de dados. Nesta área, pesquisadores transformam sequências genéticas complexas em informações compreensíveis, permitindo descobertas rápidas sobre doenças, evolução e tratamentos personalizados sem depender apenas de laboratórios físicos.

No Gist.Science, processamos diariamente cada novo pré-publicação na categoria de bioinformática enviada pelo bioRxiv. Nosso compromisso é tornar esse conhecimento acessível, oferecendo tanto resumos em linguagem simples para o público geral quanto análises técnicas detalhadas para especialistas, garantindo que ninguém fique de fora das últimas inovações científicas.

Abaixo, você encontrará as últimas pesquisas publicadas nesta área, organizadas para facilitar sua leitura e compreensão dos avanços recentes.

OpenAc4C: A gateway to decode the landscape, regulation and pathogenesis of N4-acetylcytidine (ac4C) epitranscriptome

O OpenAc4C é a primeira base de conhecimento abrangente e de acesso livre que integra dados de sequenciamento de nova geração e nanoporos para mapear o epitranscriptoma de N4-acetilcitosina (ac4C) em 33 espécies, identificando sítios de modificação, variantes genéticas e SNPs patogênicos para facilitar a investigação dos mecanismos regulatórios e patológicos associados a essa marca epigenética.

Tu, G., Zhang, Y., Wang, X., Zhang, J., Zhu, A., Chen, K., Wu, Z., Wu, Z., Wang, Y., Zhou, J., Wei, Z., Jia, G., Meng, J., Rigden, D. J., Song, B.2026-04-05💻 bioinformatics

Comprehensive characterization of V(D)J recombination from long-read transcriptomic data with VDJcraft

O artigo apresenta o VDJcraft, um pipeline integrado pioneiro que utiliza dados de transcriptoma de leitura longa para caracterizar com precisão a recombinação V(D)J, superando métodos existentes na detecção de genes e na descoberta de novos subtipos, além de permitir a identificação de assinaturas imunológicas associadas a doenças como a COVID-19.

Hu, K., Rosenberg, A. F., Song, Y., Fan, C.-H., Peng, Z., Gao, M., Chong, Z.2026-04-05💻 bioinformatics

Spatially Varying Graphical Models for Cell-Cell Interaction Networks in Multiplexed Tissue Imaging

Este artigo apresenta o GP-GHS, um modelo bayesiano escalável que utiliza regressão nodewise com processos gaussianos e priores de ferradura em grupo para inferir redes de interação célula-célula espacialmente variáveis em imagens de tecidos multiplexados, demonstrando superioridade em simulações e revelando redes imunossupressoras centradas em Tregs em câncer colorretal.

Bhadury, S., Gaskins, J. T., Rao, A.2026-04-05💻 bioinformatics

INAEME: Integral Neoantigen Analysis with Entirety of Mutational Events

Este artigo apresenta o INAEME, um novo fluxo de trabalho bioinformático integral para a descoberta de neoantígenos que processa dados genômicos e transcriptômicos tumorais e normais, considerando uma ampla gama de eventos mutacionais anteriormente negligenciados para gerar candidatos precisos e priorizados para imunoterapia contra o câncer.

Kovacevic, V., Milicevic, O., Ilic Raicevic, N., Kojicic, M., Skundric, N., Mijalkovic Lazic, A., DiGiovanna, J.2026-04-04💻 bioinformatics

Fine scale structural information substantially improves multivariate regression model for mRNA in-vial degradation prediction

O estudo demonstra que a incorporação de informações estruturais de escala fina, especificamente as probabilidades logarítmicas de emparelhamento de bases, em um modelo de regressão multivariada compacto chamado STRAND, permite prever com maior precisão a degradação de mRNA em solução, superando as abordagens existentes de aprendizado de máquina e aprendizado profundo.

Yi, S., Ali, S., Jadeja, Y., Davis, J. W., Metkar, M.2026-04-04💻 bioinformatics

Benchmarking long-read RNA-seq across modalities, methods, and sequencing depth in iNeurons

Este estudo apresenta uma análise abrangente que compara tecnologias de sequenciamento de RNA de leitura longa (ONT e PacBio Kinnex), ferramentas de quantificação e profundidade de sequenciamento em modelos de neurônios induzidos (iNeurons) de bulk e célula única, fornecendo diretrizes práticas para o desenho experimental e validando o uso dessas plataformas para investigar a biologia do FMR1.

Schubert, R.2026-04-04💻 bioinformatics

PanTEon: a cross-kingdom framework to guide the design of transposable element classifiers

O artigo apresenta o PanTEon, um framework de aprendizado profundo de reino cruzado que combina um banco de dados harmonizado e uma plataforma de benchmarking modular para padronizar e melhorar a classificação reprodutível de elementos transponíveis em animais, plantas e fungos.

Orozco-Arias, S., Ferrer-Pomer, I., Rodrigues de Goes, F., Gaviria-Orrego, S., Gomiz-Fernandez, J., Llatser-Torres, J., Paschoal, A. R., Guyot, r., Gabaldon, T.2026-04-04💻 bioinformatics