💻 Category

bioinformatics

1238 artigos

A bioinformática une biologia e computação para desvendar os mistérios da vida através de dados. Nesta área, pesquisadores transformam sequências genéticas complexas em informações compreensíveis, permitindo descobertas rápidas sobre doenças, evolução e tratamentos personalizados sem depender apenas de laboratórios físicos.

No Gist.Science, processamos diariamente cada novo pré-publicação na categoria de bioinformática enviada pelo bioRxiv. Nosso compromisso é tornar esse conhecimento acessível, oferecendo tanto resumos em linguagem simples para o público geral quanto análises técnicas detalhadas para especialistas, garantindo que ninguém fique de fora das últimas inovações científicas.

Abaixo, você encontrará as últimas pesquisas publicadas nesta área, organizadas para facilitar sua leitura e compreensão dos avanços recentes.

Proteome analyses reveal Endoplasmic Reticulum stress-induced changes in protein abundance associated with Ube2j2 deficiency in human cell culture

Este estudo utiliza análises de proteoma em células U2OS para demonstrar que a deficiência de Ube2j2 altera a abundância de proteínas sob estresse do retículo endoplasmático, revelando não apenas vias conhecidas como UPR e ERAD, mas também novas funções celulares associadas a esse gene, como metabolismo de RNA, transporte ER-Golgi e progressão do ciclo celular.

Dahlberg, C. L., Zinkgraf, M., Laugesen, S. H., Soltoft, C. L., Ginebra, Q., Bennett, E. P., Hartmann-Petersen, R., Ellgaard, L.2026-04-03💻 bioinformatics

LigandForge: A Web Server for Structure-Guided De Novo Drug Design

O artigo apresenta o LigandForge, um servidor web que facilita o design de novo de fármacos guiado por estrutura, integrando validação estrutural, montagem de fragmentos quimicamente conscientes e otimização multiobjetivo para gerar compostos líderes viáveis para síntese sem a necessidade de instalação de software local ou expertise em programação.

Nada, H., Sipos-Szabo, L., Bajusz, D., Keseru, G., Gabr, M.2026-04-03💻 bioinformatics

Importance of taking Single Amino Acid Variant and accessory proteome variability into account in Data Independent Acquisition Proteomics: illustrated with Legionella pneumophila analysis

Este estudo demonstra que a integração da variabilidade de variantes de aminoácidos únicos e do proteoma acessório em fluxos de trabalho de proteômica DIA melhora significativamente a cobertura e a confiança na identificação de proteínas de *Legionella pneumophila*, permitindo uma análise proteotípica mais precisa e abrangente.

Dupas, A., Ibranosyan, M., Ginevra, C., Jarraud, S., Lemoine, J.2026-04-03💻 bioinformatics

muat: portable transformer-based method for tumour classification and representation learning from somatic variants

O artigo apresenta o muat, uma ferramenta baseada em transformadores distribuída via Docker e Bioconda que permite a classificação de tumores e aprendizado de representação a partir de variantes somáticas em ambientes de computação segura e de alto desempenho, demonstrando alta precisão e adaptabilidade em diferentes coortes sem necessidade de retreinamento extensivo.

Sanjaya, P., Pitkänen, E.2026-04-03💻 bioinformatics

Anonymized Somatic Tumor Twins (STTs) enable open genome data sharing and use in research and clinical oncology

O estudo apresenta o "GenomeAnonymizer", um método inovador que gera "Somatic Tumor Twins" (STTs) a partir de pares tumor-normal, permitindo o compartilhamento aberto e seguro de dados genômicos oncológicos ao remover informações germinativas sensíveis enquanto preserva a integridade das variantes somáticas para pesquisa e decisões clínicas.

Gaitan, N., Martin, R., Tello, D., Benetti, E., Riba, M., Licata, L., Arbones, M., Royo, R., Olmos, D., Morelli, M. J., Tonon, G., Castro, E., Torrents, D.2026-04-03💻 bioinformatics

DeepTrio: Variant Calling in Families Using Deep Learning

O DeepTrio é um modelo de aprendizado profundo que melhora a precisão na detecção de variantes genéticas em trios familiares (pai, mãe e filho) ao analisar informações conjuntas de sequenciamento sem depender de priores de herança explícitos, superando o DeepVariant especialmente em coberturas mais baixas e adaptando-se a diferentes plataformas e tipos de dados.

Brambrink, L., Kolesnikov, A., Goel, S., Nattestad, M., Yun, T., Baid, G., Yang, H., McLean, C., Shafin, K., Chang, P.-C., Carroll, A.2026-04-02💻 bioinformatics

SSAlign: Ultrafast and Sensitive Protein Structure Search at Scale

O SSAlign é uma ferramenta de busca de estruturas proteicas ultra-rápida e sensível que, ao combinar modelos de linguagem proteica com uma estratégia de alinhamento em duas etapas, supera o Foldseek em velocidade e cobertura enquanto mantém precisão comparável ao TM-align, oferecendo uma solução escalável para a análise de grandes bancos de dados estruturais.

Wang, L., Zhang, X., Wang, Y., Xue, Z.2026-04-02💻 bioinformatics