🧬 Category

genomics

509 artigos

A genômica é o estudo que decifra o manual de instruções da vida, revelando como o DNA molda quem somos, desde a cor dos olhos até a suscetibilidade a certas doenças. Este campo avança rapidamente, transformando nossa compreensão da biologia e abrindo caminho para tratamentos personalizados que antes pareciam ficção científica.

No Gist.Science, rastreamos diariamente os novos pré-prints de genômica enviados ao bioRxiv para torná-los acessíveis a todos. Processamos cada trabalho recém-publicado, oferecendo tanto resumos técnicos detalhados quanto explicações em linguagem simples, garantindo que você entenda as descobertas mais recentes sem se perder no jargão complexo.

Abaixo, você encontrará a seleção mais atual de artigos nesta área, organizados para facilitar sua leitura e compreensão das últimas inovações.

Atopic Dermatitis and Psoriasis Differ in Lesional DEG Reference Instability and Non-Lesional Spectrum Displacement: Multi-Cohort Geometric Evidence of Individual Homeostatic Boundary Escape

Este estudo demonstra que a inconsistência transcriptômica na dermatite atópica (DA) decorre de sua dependência estrutural de sinais de menor efeito, revelando que, em comparação com a psoríase, a DA apresenta maior instabilidade nas assinaturas gênicas lesionais e que uma subpopulação significativa de pacientes com pele não lesional já exibe uma "fuga" individual dos limites homeostáticos, caracterizada por padrões distintos de pré-ativação inflamatória ou supressão metabólica.

Shabana, B.2026-03-19🧬 genomics

Modeling cis-regulatory variation in human brain enhancers across a large Parkinson's Disease cohort

Este estudo apresenta um recurso abrangente e novas estratégias de modelagem para interpretar variações não codificantes no cérebro humano, integrando dados multiômicos de 190 doadores (incluindo 75 com Parkinson) para identificar variantes genéticas que modulam a acessibilidade de enhancers específicos de tipo celular e priorizar variantes regulatórias associadas ao risco de Parkinson.

Sigalova, O. M., Pancikova, A., De Man, J., Theunis, K., Hulselmans, G. J., Konstantakos, V., Stuyven, B., De Brabandere, A., Geurts, J., Mikorska, A., Mukherjee, S., Abouelasrar Salama, S., Vandereyk (…)2026-03-19🧬 genomics

OxBreaker: species-agnostic pipeline for the analysis of outbreaks using nanopore sequencing

O artigo apresenta o "OxBreaker", um pipeline automatizado, agnóstico a espécies e de código aberto, otimizado para a análise em tempo real de surtos bacterianos e plasmídicos usando sequenciamento Nanopore, oferecendo uma solução acessível e de alta precisão para vigilância genômica local sem a necessidade de especialistas.

Reding, C., Hopkins, K. M. V., Colpus, M., Sanderson, N. D., Gentry, J., Oakley, S., Campbell, M., Karageorgopoulos, D., Jeffery, K. J. M., Eyre, D. W., Bejon, P., Stoesser, N., Walker, A. S., Young (…)2026-03-19🧬 genomics

Interpretable and predictive models based on high-dimensional data in ecology and evolution

Este estudo compara nove métodos estatísticos e de aprendizado de máquina para dados de alta dimensão em ecologia e evolução, concluindo que, embora a seleção precisa de variáveis seja frequentemente inatingível em cenários de amostragem realistas devido ao sobreajuste, abordagens esparsas podem alcançar boa precisão preditiva ao mitigar e quantificar esse problema.

Jahner, J. P., Buerkle, C. A., Gannon, D. G., Grames, E. M., McFarlane, S. E., Siefert, A., Bell, K. L., DeLeo, V. L., Forister, M. L., Harrison, J. G., Laughlin, D. C., Patterson, A. C., Powers, B. F (…)2026-03-18🧬 genomics

De novo assembly of complete Plasmodium falciparum isolate genomes using PacBio HiFi sequencing technology

Este estudo demonstra que a tecnologia de sequenciamento PacBio HiFi permite a montagem *de novo* precisa e completa de genomas de *Plasmodium falciparum* a partir de infecções naturais, superando as limitações das tecnologias de leitura curta na resolução de famílias complexas de antígenos de superfície (VSA) e fornecendo um recurso valioso para o estudo da evolução e diversidade antigênica do parasita.

Nyarko, P., Quenu, M., Guery, M.-A., Cohen, C., Girgis, S. T., Makunin, A., McCarthy, S. A., Hamilton, W. L., Lawniczak, M., Claessens, A.2026-03-18🧬 genomics

BioWorldModel: A Multi-Kingdom Trajectory Architecture for Genomic Prediction with Evolutionary Curriculum Learning

O artigo apresenta o BioWorldModel, uma arquitetura unificada que utiliza aprendizado de currículo evolutivo para prever distribuições de fenótipos em múltiplas espécies de fungos, plantas e animais com um único conjunto de parâmetros, superando significativamente os métodos tradicionais de predição genômica ao demonstrar princípios compartilhados na mapeamento genótipo-fenótipo entre reinos.

Shaik, K. H. B.2026-03-18🧬 genomics

Exon Targeted Retrieval and Classification Toolbox (ExTRaCT): a gene search pipeline to find APOBEC3 Z-domains in novel bat genomes

O artigo apresenta o ExTRaCT, uma pipeline automatizada eficiente e de fácil uso para identificar e classificar exons gênicos conservados em genomas de novas espécies, demonstrando sua eficácia na busca por membros da família de genes APOBEC3 em 102 genomas de morcegos sem depender de anotações pré-existentes ou de espécies próximas.

Delamonica, B., Bat1K 21-Families Group,, Larijani, M., MacCarthy, T., Davalos, L. M.2026-03-18🧬 genomics

Genome-scale functional mapping of the mammalian whole brain with in vivo Perturb-seq

Os pesquisadores criaram um atlas funcional de expressão gênica no cérebro de camundongos, utilizando uma plataforma aprimorada de in vivo Perturb-seq para analisar a resposta transcriptômica à perda de 1.947 genes associados a doenças em mais de 7,7 milhões de células, revelando essencialidade específica de tipos celulares e programas transcricionais que oferecem novos insights sobre os mecanismos de doenças neurológicas e psiquiátricas.

Shi, T., Korshunova, M., Kim, S., DeTomaso, D., Zheng, X., Vishvanath, L., Nyasulu, T., Huynh, N., Sun, A., Thompson, P. C., Zhang, Y., Wigdor, E. M., Rohani, N., Ali, S., Qiu, H., Geralt, M., Zhao, Z (…)2026-03-18🧬 genomics

A relic at risk: Genomic evidence for an early-diverging domesticated lineage in Norwegian farmhouse yeast

Este estudo apresenta evidências genômicas de que as leveduras kveik da Noruega constituem uma linhagem doméstica antiga e divergente, preservada por séculos na cultura de cervejaria rural e representando um dos primeiros ramos da domesticação de *Saccharomyces cerevisiae*.

Dondrup, M., Martinussen, A. O., Haugland, L. K., Brandenburg, J., Inanli, O., Schroeder, H., Dolan, D., Grellscheid, S. N., Hagen, S. B., Elameen, A., Myking, T., Eiken, H. G.2026-03-18🧬 genomics