🧬 biology

A Collaborative Framework for Coordinated Analysis Developed by the Genetics of DNA Methylation Consortium

O Genetics of DNA Methylation Consortium (GoDMC) desenvolveu uma estrutura de software expandida e impulsionada pela comunidade que padroniza o processamento em nível de coorte e permite análises reprodutíveis baseadas em estatísticas de resumo integrando metilação do DNA e variação genética.

Josine Min, Carlos Ruiz-Arenas, Olalekan Monsir Awoniran, Olivia Castellini-Pérez, Thomas Hendrik Jonkman, Natalia Llong (…)2026-07-09
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A Hybrid Machine Learning Approach Integrating Gradient Boosting and Attention Mechanisms to Predict VBNC Bacterial Resuscitation

Este estudo apresenta um novo framework de aprendizado de máquina híbrido combinando LightGBM e mecanismos de Atenção baseados em PyTorch para prever com precisão a ressuscitação de bactérias VBNC, alcançando um desempenho superior em relação aos métodos tradicionais e identificando a concentração de nutrientes e a sinalização de cAMP como determinantes fundamentais para a recuperação.

Zulman Arif2026-07-09
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Predictive single cell foundation model for gene regulation and aging with privacy-preserving tabular learning

O artigo apresenta o Tabula, um modelo de fundação de célula única que preserva a privacidade e utiliza aprendizado federado para capturar explicitamente a estrutura tabular de dados genômicos, permitendo a descoberta de lógica regulatória e a identificação de fatores de rejuvenescimento sem compartilhar dados brutos entre instituições.

Xiaojie Qiu, Jiayuan Ding, Jianhui Lin, Ziyang Miao, Nils Mechtel, Shiyu Jiang, Yixin Wang, Zhaoyu Fang, Jorge Martin-Ru (…)2026-07-09
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A cross-national network for environmental DNA monitoring of nearshore fish biodiversity across the Northeast Pacific

Este artigo apresenta o Pacific eDNA Coastal Observatory, uma rede transnacional abrangendo 16 nós de San Diego a Juneau que utilizou 1.041 amostras de água do mar ao longo de quatro anos para gerar um conjunto de dados abrangente e validado da biodiversidade de peixes de águas costeiras no Pacífico Nordeste, demonstrando a eficácia do monitoramento coordenado de eDNA para inferência comparativa em larga escala.

Jennifer M. Sunday, Kate Sheridan, Margot Hessing-Lewis, Rute B. G. Clemente-Carvalho, Salvador Babinet, Jennifer L. Rue (…)2026-07-09
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Large-Scale Reproduction of Alzheimer Research on aCommon Dataset Reveals an Information Ceiling on theField’s Evidence

Ao aplicar um novo framework mediado por IA (AHA) para reproduzir e auditar milhares de estudos sobre a doença de Alzheimer em um conjunto de dados comum, os autores demonstram que, embora o desempenho preditivo relatado pelo campo possa ser replicado em escala, os dados disponíveis são fundamentalmente insuficientes em termos de informação para distinguir entre hipóteses concorrentes, revelando um teto na evidência que explica as trajetórias de pesquisa divergentes do campo.

M. Antony Ewing2026-07-09
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Behavioral, neurobiological, and physiological effects of music exposure in murine models: A systematic review

Esta revisão sistemática de 65 estudos murinos conclui que a exposição à música melhora significativamente os desfechos comportamentais, neurobiológicos e fisiológicos em ratos, embora a heterogeneidade metodológica torne necessária a realização de pesquisas padronizadas adicionais para esclarecer os mecanismos e confirmar o potencial translacional para humanos.

Nour El Zahraa Mallah, Laura Navarro, Tomás Sobrino, Alberto Ouro, Federico Martinón-Torres, Alberto Gómez-Carballa, Ant (…)2026-07-09
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Structural Insights into Specific Recognition of mononucleosome by the catalytic domain of Human KMT5A

Este estudo apresenta três estruturas de criomicroscopia eletrônica (cryo-EM) de alta resolução do domínio catalítico da proteína SET8 humana ligada a nucleossomos, revelando como o ancoramento específico mediado por arginina ao patch ácido e as transições conformacionais dinâmicas facilitam o reconhecimento e a monometilação da lisina 20 da histona H4.

Jingjun Hong2026-07-09✓ Author reviewed
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The PRIDE Affinity-Proteomics Archive (PRIDE-AP): Making Affinity Proteomics Data FAIR

O artigo apresenta o PRIDE-AP, um novo repositório de dados abertos e em conformidade com os princípios FAIR dentro da infraestrutura PRIDE que aborda a falta de um arquivo dedicado para proteômica de afinidade de alto rendimento, ao permitir a submissão padronizada, a validação e a integração de conjuntos de dados entre diferentes tecnologias para acelerar a descoberta de biomarcadores.

Deepti J. Kundu, Asier Larrea-Sebal, Selvakumar Kamatchinathan, Chakradhar Bandla, Nithu Sara John, Nandana Madhusoodana (…)2026-07-09
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Learning epidemics: a compartmental and network approach to how artificial intelligence literacy spreads inside organizations

Este artigo reformula a disseminação da literacia em inteligência artificial dentro das organizações como um processo de contágio, demonstrando, por meio de epidemiologia de redes e aprendizado de máquina, que a retenção do aprendizado é impulsionada primordialmente pelas propriedades da rede de comunicação estrutural e pela posição de um indivíduo dentro delas, em vez de apenas atributos pessoais.

Onicio Batista Leal Neto, Julia Nicolau, Alexandre Santilli2026-07-09