🧬 biologia

Foldseek-Interface reveals a protein interface universe far from complete

Os autores introduzem o Foldseek-Interface, um método altamente eficiente para o agrupamento de interfaces de interação proteica em escala de interatoma que revela uma vasta diversidade de modos de ligação anteriormente não caracterizada e fornece um recurso livremente acessível para explorar a evolução de interfaces e o mimetismo de patógenos.

Katja Luck, Joelle Strom, Sooyoung Cha, Rachel Kim, Harshit Sajal, Cameron Gilchrist, Martin Steinegger2026-10-08
🧬 biologia

Genotype-by-environment interaction for calving interval along a postpartum thermal exposure gradient in Maremmana cattle

Este estudo demonstra que o gado Maremmana exibe interações genótipo-ambiente significativas para o intervalo entre partos em resposta à exposição térmica pós-parto, revelando variação genética na robustez reprodutiva e identificando regiões genômicas específicas associadas tanto à fertilidade basal quanto à sensibilidade térmica.

Eugenio Rulli, Enrico Mancin, Angelica Oian, Fiorella Sbarra, Daniele Colombi, Andrea Quaglia, Roberto Mantovani, Cristi (…)2026-10-08
🧬 biologia

Genome size variation in Stemodia species (Gratioleae-Plantaginaceae) and its relationship with morphological and environmental variables

Este estudo utiliza a citometria de fluxo para caracterizar a variação do tamanho do genoma em oito espécies de *Stemodia*, revelando correlações significativas entre o conteúdo de DNA nuclear, níveis de ploidia, características morfológicas e gradientes ambientais, ao mesmo tempo que fornece evidências citogenéticas para apoiar o reestabelecimento de *S. ericifolia* como *Chodaphyton ericifolium*.

Yamil Carlés Bechara, María Betiana Angulo, María de las Mercedes Sosa2026-10-08
🧬 biologia

Integrative Study of Physiological Adaptations and Cellular Stress Responses of Arsenic-Resistant Bacteria Isolated from Mining- Impacted Soil

Este estudo caracteriza dois isolados bacterianos resistentes ao arsênico, *Staphylococcus kloosii* (My2) e *Bacillus albus* (My6), de um local de mineração em Goa, Índia, demonstrando sua adaptabilidade fisiológica, cinética de crescimento específica sob estresse de arsênico e potencial para aplicações de biorremediação.

Manisha Tiwari, Rakshita Kaskar, Jarret Stevan Anthony Fernandes, Kunal Kerkar, Savita Kerkar, Meghanath Prabhu, Dhermen (…)2026-10-08
🧬 biologia

Functional Immunopeptidomics by Characterizing Immunopeptides Against HLAs, TCRs, and Antibodies

Este estudo introduz uma plataforma de imunopeptidômica funcional que isola peptídeos ligados a receptores de espécimes clínicos individuais para distinguir antígenos específicos de tumores de ligantes passivos de HLA, revelando mecanismos regulatórios distintos entre a apresentação de HLA-I e HLA-II e identificando alvos de alta prioridade para imunoterapia em carcinoma de células renais.

Hongyi Liu, Effram Wei, Yingwei Hu, Yuefan Wang, Zhenyu Sun, Hui Zhang2026-10-08
🧬 biologia

Adaptive Spatial Regularization for Aedes-Borne Disease Risk Prediction: A Case Study of Chikungunya

Este artigo apresenta o ASR-XGBoost, um novo framework que integra regularização espacial adaptativa e correção de anomalias ao XGBoost para superar o viés de rótulo e as suposições de independência espacial, alcançando assim uma calibração e continuidade espacial superiores para prever o risco de Chikungunya a partir de dados de vigilância de presença única.

Shuaishuai Ji, Jia Mu, Ling Guo, Renqing Suonan, Zhen Zhao, Qiwen Yuan2026-10-08
🧬 biologia

Leveraging Imputation and Low-Coverage Target Capture Sequencing for Cost-Efficient Genotyping in Cattle

Este estudo demonstra que a combinação de sequenciamento de captura de alvo de baixa cobertura com imputação utilizando um painel de referência de 500 indivíduos e filtragem de profundidade otimizada fornece uma alternativa de custo-benefício, flexível e altamente precisa ao genotipagem tradicional por chips de SNP para o melhoramento bovino.

Yan Ren, Wai Y. Low, Rudi A. McEwin, Tong Chen, Wayne S. Pitchford, Mehar S. Khatkar2026-10-08
🧬 biologia

Early molecular changes and a pivotal transition define triple-negative breast cancer progression in a murine model: a stage-resolved transcriptomic study

Este estudo transcriptômico resolvido por estágio de um modelo de TNBC murino revela que alterações moleculares extensas ocorrem dentro de dias após a inoculação das células tumorais, são impulsionadas por uma transição fundamental entre estágios de crescimento intermediários e refletem amplamente programas do microambiente tumoral ausentes em células cancerosas cultivadas.

Irene Tadeo-Cervera, Cristian Herrera-Olivares, Celeste Moya-Valera, Deborah La Fauci, Raquel Bosch-Romeu, Luis Álvarez (…)2026-10-08
🧬 biologia

Assessing the suitability of a new porcine dry bone scoring method for South African burial taphonomy when applied to two posthumous human skeletal samples

Este estudo demonstra que um método de pontuação de osso seco baseado em suínos é inadequado para a tafonomia de sepultamentos humanos na África do Sul devido a diferenças ambientais e de espécie significativas, necessitando do desenvolvimento de critérios emendados para interpretar com precisão restos esqueléticos humanos.

Nicola Jackson¹, Claudia Landsman¹, Anja Meyer¹2026-10-08
🧬 biologia

Integrative analyses of flowering-associated variation in wild Saccharum spontaneum

Ao integrar avaliação fenotípica, genética de populações, GWAS e perfil de transcriptômica de 147 acessos de *Saccharum spontaneum* selvagem, este estudo elucida a base genética e os processos biológicos coordenados subjacentes à variação do florescimento, fornecendo recursos genômicos valiosos para a pesquisa evolutiva e o melhoramento da cana-de-açúcar.

Sicheng Li, Fengzhen Wu, Lijun Zhang, Zhen Wang, Weixing Duan, Xiping Yang2026-10-08