AminoGrapes: Structure-Weighted Evolutionary Scoring for Viral Protein Fitness Prediction
Este artigo avalia o AminoGrapes, um método de pontuação evolutiva livre de parâmetros e ponderado por estrutura para a predição de fitness de proteínas virais, constatando que, embora supere significativamente o modelo de linguagem ESM2-650M em ensaios virais, ele não consegue igualar os principais métodos existentes ou melhorar o desempenho de conjuntos (ensembles), provavelmente devido a escolhas de design influenciadas pelo conhecimento prévio dos resultados do benchmark.