🧬 biologia

AminoGrapes: Structure-Weighted Evolutionary Scoring for Viral Protein Fitness Prediction

Este artigo avalia o AminoGrapes, um método de pontuação evolutiva livre de parâmetros e ponderado por estrutura para a predição de fitness de proteínas virais, constatando que, embora supere significativamente o modelo de linguagem ESM2-650M em ensaios virais, ele não consegue igualar os principais métodos existentes ou melhorar o desempenho de conjuntos (ensembles), provavelmente devido a escolhas de design influenciadas pelo conhecimento prévio dos resultados do benchmark.

MUHAMMAD Saad2026-10-05
🧬 biologia

Integrated Bioinformatics Approach Identifies Shared Hub Genes and Pathways Underlying Probiotic Responses in Colorectal Cancer

Este estudo utiliza uma abordagem bioinformática integrada para revelar que distintas cepas probióticas convergem em genes centrais compartilhados (tais como MYC, TNF e NFKBIA) e vias fundamentais envolvendo sinalização inflamatória, a resposta a proteínas mal dobradas e morte celular para exercer efeitos protetores contra o câncer colorretal.

Devanshi Sarode2026-10-05
🧬 biologia

Cross-domain transfer of frozen 3DINO representations for marker-sparing classification of hepatic 3D nuclear morphotypes

Este estudo demonstra que representações auto-supervisionadas 3D congeladas (3DINO), pré-treinadas em dados sem fluorescência, permitem uma classificação precisa e de preservação de marcadores de morfótipos nucleares hepáticos 3D utilizando apenas corantes DAPI, superando características manuais e igualando o desempenho de redes neurais convolucionais 3D treinadas de ponta a ponta, ao mesmo tempo em que preserva canais de fluorescência valiosos para outras leituras biológicas.

Alisson Terán Ballagán, Jean Taylor, Dilan Martínez-Torres, Fabián Segovia-Miranda, Hernán Morales-Navarrete2026-10-05
🧬 biologia

Helminth infection confers transient antibacterial immunity via IL-4–trained tissue macrophages

Este estudo revela que uma infecção transitória por helmintos induz o reprogramamento epigenético de macrófagos peritoneais residentes mediado por IL-4, conferindo imunidade antibacteriana sistêmica de curto prazo contra *Staphylococcus aureus* e desafiando a visão convencional de que os helmintos apenas suprimem a defesa do hospedeiro.

Shih-chin Cheng, Jia Zhang, Junqiao Liu, Qingxiang Gao, Xinnan Liu, Buyun Dang, Stanley Huang2026-10-05
🧬 biologia

A Novel ΔNp63α Variant in Fetus with Split Hand/Foot Malformation Disrupts Transcriptional Function and Promotes Apoptosis

Este estudo identifica uma nova variante ΔNp63α provavelmente patogênica (K94E) em um feto com malformação de mão/pé fendida que prejudica a regulação transcricional de DLX5 e promove a apoptose, elucidando assim um novo mecanismo molecular subjacente ao distúrbio.

peisen liu, chunyu li, yingdi liu, yaning liu, jing liu, runyu lv, qimin zhou, qin xing, huimin zhu, juan wen, desheng l (…)2026-10-04
🧬 biologia

Spatial epithelial and stromal remodeling in isolated human pancreatic intraepithelial neoplasia before invasion

Ao integrar transcriptômica espacial, validação histológica e organoides derivados de pacientes, este estudo revela que a neoplasia intraepitelial pancreática de alto grau constitui um ecossistema pré-invasivo biologicamente ativo, caracterizado por uma expansão estromal periductal significativa, enriquecimento de miofibroblastos e sinalização epitélio-estroma recíproca que precede a invasão.

Atsuhiro Masuda, Masahiro Tsujimae, Tetsuhisa Ko, Mika Miki, Kohei Okamoto, Kento Ogawa, Tatsuya Kageyama, Takafumi Toku (…)2026-10-04