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🧬 biologia

KIF3A as a transcriptomic marker of ciliation status in human striatal parvalbumin interneurons: single-cell evidence linking intraflagellar transport to the LRRK2-Rab-ciliogenesis axis

Este estudo identifica o KIF3A como um marcador transcriptômico estatisticamente significativo do status de ciliação em interneurônios parvalbumina de estriado humano, fornecendo evidência de célula única que vincula os mecanismos de transporte intraflagelar ao eixo LRRK2-Rab-ciliogênese-Shh, crítico para a sobrevivência neuronal.

Om Chhaya2026-10-05
🧬 biologia

Characterizing psychological concerns in semi-structured healthcare conversations using conversational NLP and large language models

Este estudo demonstra que técnicas de processamento de linguagem natural, particularmente a extração de preocupações psicológicas baseada em modelos de linguagem de grande escala, podem quantificar efetivamente características conversacionais para prever escores de sofrimento psicológico, embora apresentem sucesso limitado na previsão de características de comunicação social.

Hiroki Tanaka, Yinuo Li, Nozomi Naoi, Kosuke Okazaki2026-10-05
🧬 biologia

Mammalian TRIM21 Exhibits Gene-Wide Episodic Diversifying Selection with Statistically Supported and Structurally Positioned Evolutionary Candidate Residues

Este estudo demonstra que o TRIM21 de mamíferos passa por uma seleção diversificadora episódica em todo o gene e identifica o resíduo R57 como o candidato estatístico mais forte e o resíduo 453 como a hipótese estruturalmente fundamentada mais convincente para mudanças evolutivas recorrentes, fornecendo previsões testáveis para futuros ensaios funcionais.

HARISHKUMAR JEETHALU NEELKANTAN2026-10-05
🧬 biologia

Prospectively frozen external benchmarking reveals benchmark-context dependence in somatic variant calling

Ao congelar prospectivamente as configurações analíticas antes de avaliar a amostra HG008, este estudo demonstra que a dependência do contexto de referência, particularmente em relação a INDELs, influencia significativamente o desempenho do chamador de variantes somáticas e pode ser melhor interpretada por meio de decomposição de suporte e análise de incerteza espacial.

Md Mahmudul Hasan2026-10-05
🧬 biologia

TransPrimer: A Web-Based Tool for Automated Transcript-Specific RT-PCR/qPCR Primer Design Across Multiple Species

O TransPrimer é uma ferramenta baseada na web que automatiza o design de primers para RT-PCR/qPCR específicos de transcritos e pan-transcritos através de múltiplas espécies, analisando estruturas de transcritos para identificar éxons ou junções discriminatórios e aplicando avaliações termodinâmicas avançadas para garantir a especificidade.

Junyeop Ahn, Yun H Lee, Donald J Zack, Ping-Wu Zhang2026-10-05
🧬 biologia

Decoding early-life gut microbiota: discrete and reproducible maturation stages in broiler chickens

Este estudo utiliza amostragem diária de alta resolução temporal e agrupamento por misturas multinomiais de Dirichlet para revelar que a microbiota intestinal de frangos de corte segue uma trajetória de desenvolvimento discreta, reprodutível e conservada, caracterizada por estágios distintos de maturação tanto no íleo quanto nos cecos durante o primeiro mês pós-eclosão.

Niamh Cleiren, Kirsten Leurs, Nathalie Van Rysselberghe, Gunther Antonissen, Filip Van Immerseel, Evy Goossens2026-10-05
🧬 biologia

Global patterns of poaching probability in terrestrial mammals

Este estudo apresenta um modelo preditivo global da probabilidade de caça furtiva para mamíferos terrestres, identificando a riqueza de espécies caçadas e a acessibilidade urbana como fatores determinantes fundamentais para orientar a fiscalização e as políticas de conservação direcionadas sob o Quadro Global de Biodiversidade.

Martina Fernando, Ana Benítez López, Marco Davoli, Martin Philippe-Lesaffre, Michela Pacifici2026-10-05
🧬 biologia

Colonization of Native Dairy Facility Biofilms by Persistent Listeria monocytogenes Strains

Este estudo demonstra que uma cepa persistente de *Listeria monocytogenes* pode se integrar com sucesso em diversos biofilmes multiespécies de uma instalação de laticínios, independentemente do tempo de inoculação, enquanto membros específicos da comunidade como *Serratia liquefaciens* e *Lactococcus lactis* respectivamente promovem ou inibem sua colonização, oferecendo novos alvos para o controle da persistência de patógenos.

Felix Spiegel, Alvaro Cañete Reyes, Rina Bachmann, Ariane Piezka, Benjamin Zwirzitz, Martin Wagner, Lauren Alteio2026-10-05
🧬 biologia

Maternal transmission and limited virulent phage replication shape early infant gut virome maturation

Ao integrar o sequenciamento metagenômico e o perfil metabolômico de díades mãe-filho, este estudo revela que a maturação do viroma intestinal infantil precoce é impulsionada pela transmissão materna de fagos virulentes e sua subsequente replicação limitada, desafiando suposições anteriores sobre a dominância de fagos temperados no início da vida.

Tommi Vatanen, Kim Kreuze, Lilia Björkgren, Christopher Turkington, Neda Nezam-Abadi, Sam Seymour, Andrey Shkoporov, Col (…)2026-10-05