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Anterior-to-posterior rewiring of the fronto-parietal network shapes large-scale reorganisation for motor recovery after a focal M1 lesion in macaques

Após uma lesão focal no M1 em macacos, a recuperação motora é impulsionada por uma reorganização de rede em larga escala caracterizada por uma reconfiguração anterior-posterior do circuito frontoparietal, onde conexões canônicas enfraquecidas entre PMv–AIP são compensadas por vias não canônicas reforçadas entre PMv–pVIP para restaurar a função de preensão.

Tatsuya Yamamoto¹, Yumi Murata, Takayuki Ose, Takuya Hayashi, Noriyuki Higo2026-07-27
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Evolutionary dynamics and selection modeling of climate-driven Vibrio vulnificus expansion into high-latitude environments

Este estudo revela que as estirpes de *Vibrio vulnificus* no Mar Báltico, compreendendo uma mistura de isolados ambientais e clínicos, adaptaram-se ao ambiente frio e salobro através de seleção positiva em genes específicos como *opsX* e *menC*, enquanto sofrem um compromisso genómico caracterizado por uma redução drástica na complexidade dos sistemas de defesa e um aumento da integração de elementos genéticos móveis para facilitar a infeção humana.

Hevar Barznji2026-07-27
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Evaluation Choices in Gene Regulatory Network Inference: An Empirical Analysis on DREAM4

Este estudo demonstra que, em benchmarks de inferência de redes de regulação gênica de baixo sinal, os rankings de desempenho relativo dos métodos são altamente frágeis e significativamente alterados por escolhas nos conjuntos de arestas candidatas e tamanhos de amostra, ressaltando a necessidade crítica de relatar protocolos de avaliação juntamente com as pontuações de benchmark.

Liu Chen2026-07-27
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The Ground-Truth Problem in Regulatory Genomics: An Empirical Analysis of Reference-Dependent Method Rankings

Este estudo demonstra que o ranking de métodos de inferência de redes de regulação gênica é altamente sensível à escolha da rede de referência, revelando que mais da metade das comparações de métodos pode se inverter dependendo da definição biológica e da cobertura da verdade fundamental, argumentando, assim, que a seleção da referência deve ser tratada como uma variável experimental crítica em vez de uma suposição de fundo fixa.

Liu Chen2026-07-27
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How Much Does a Benchmark Weight Move a Leaderboard? An Empirical Analysis of Single-Cell Integration Rankings

Esta análise empírica do benchmark de integração de célula única scIB revela que, embora o ranking publicado seja localmente estável, o método vencedor e a ordenação geral são sensíveis a mudanças defensáveis nas prioridades de peso e na composição das tarefas, sugerindo que os relatórios de benchmarks devem incluir curvas de sensibilidade e estimativas de incerteza em vez de depender apenas de uma única tabela de classificação.

Liu Chen2026-07-27
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Reading Mechanism off Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of Genomic Neighborhood Structure in scGPT Gene Embeddings

Este estudo empírico demonstra que o modelo de fundação biológica scGPT exibe uma associação pequena, porém reproduzível, entre a geometria de seu embedding estático de genes e a vizinhança genômica linear, revelando que genes localizados próximos uns dos outros no mesmo cromossomo são mais semelhantes na representação do modelo do que genes distantes, embora essa informação espacial não tenha sido explicitamente fornecida durante o treinamento.

Liu Chen2026-07-27
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The effect of dietary fiber based on fermentability and viscosity on the gut microbiome composition in chronic kidney disease: a systematic review of experimental and clinical trials

Esta revisão sistemática de 22 ensaios experimentais e clínicos conclui que intervenções isoladas com fibras dietéticas produzem efeitos variáveis e amplamente inconsistentes na composição da microbiota intestinal em pacientes com doença renal crônica, sem que um padrão claro emerja baseando-se apenas na fermentabilidade ou viscosidade das fibras.

Seyedeh Nooshan Mirmohammadali, Claudia Carrillo, Jason B. Reed, Brandon M. Kistler, Hannah E. Wilson, Bruce Hamaker, Sh (…)2026-07-27
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Regional sequence and embedding divergence among five grass OsNAC25-like proteins

Este estudo analisa cinco proteínas do tipo OsNAC25 em gramíneas para demonstrar que, embora a identidade de sequência e a confiança da predição estrutural mostrem consistentemente uma maior conservação no domínio de ligação ao DNA N-terminal em comparação com a região C-terminal, os embeddings de modelos de linguagem de proteínas são significativamente influenciados pela identidade específica do candidato, destacando a sequência do milhete-dedo como uma prioridade para investigação filogenética adicional.

Neil Sumanth2026-07-27
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Natural Language Processing Psychometrics

Este artigo introduz o "NLP Psychometrics", uma estrutura que utiliza personas de Modelos de Linguagem de Grande Escala e técnicas de IA interpretáveis para vincular pontuações de predição psicológica a características linguísticas específicas, demonstrando que, embora os dados sintéticos possam expor eficazmente vieses e prever resultados de saúde mental como depressão e satisfação com a vida, eles não podem substituir a validação humana.

Edoardo Sebastiano De Duro, Emma Franchino, Massimo Stella2026-07-27