🧬 biologia

A multi-layer computational framework for structural prioritization of transcriptome-derived proteins

Este artigo apresenta uma estrutura computacional de múltiplas camadas que integra modelagem comparativa, refinamento via AlphaFold 3, docking e simulações de dinâmica molecular para priorizar e validar efetivamente candidatos proteicos estruturalmente robustos a partir de conjuntos de dados transcriptômicos de larga escala.

Ângela Benevides, João A. Teodoro, Tales A. Costa-Silva, Danilo T. Amaral2026-08-31
🧬 biologia

Human T cell communication shapes naïve CD8 T cell fate through Enolase-1

Este estudo revela que células T CD4 de memória ativadas reprogramam diretamente células T CD8 naives autorreativas em direção a um estado ativado via mudanças transcricionais dependentes de Enolase-1, um mecanismo que pode ser terapeuticamente visado para reduzir a progressão do diabetes autoimune em camundongos NOD.

Yamoah G. Agyei, Ishita Tandon, Jiang Zhou, Mohamed Al-Moussawy, Alaa M. Khalifa, Nandeeni Suryawanshi, Anuj Sharma, Sri (…)2026-08-31
🧬 biologia

Transcriptomic and Metabolomic Responses of Botrytis cinerea Under L-Carvone Fumigation

Este estudo elucida o mecanismo antifúngico multialvo do L-carvona contra *Botrytis cinerea* ao demonstrar que ele interrompe a biossíntese da membrana celular, inibe a produção de toxinas e a reprodução, e induz danos oxidativos irreversíveis através da supressão de sistemas antioxidantes de longo prazo, conforme revelado por análises integradas de transcriptômica e metabolômica.

Zhaoyu Ren, Qisen Lu, Chunling Yang, Weichen You, Chen Wang, Yanan Zhi, Lijun Chen2026-08-31
🧬 biologia

Molecular simulation and experimental analysis of platelet receptor interaction with type I collagen in different assembly states

Este estudo combina simulações moleculares e análises experimentais para demonstrar que a montagem ordenada de período D do colágeno Tipo I aumenta significativamente o reconhecimento de receptores plaquetários e a estabilidade da adesão em comparação com estruturas de colágeno menos ordenadas.

Ying Huang, Zhijie Zhang, Feizhi Li, Kun Wu, Guoying Li2026-08-31
🧬 biologia

Clonal OmpK35 truncation and incomplete genotype-phenotype correlation underlie cefiderocol resistance in carbapenem-resistant, hypervirulent Klebsiella pneumoniae from Romania

Este estudo caracteriza uma linhagem de *Klebsiella pneumoniae* hipervirulenta, convergente, resistente a cefiderocol e resistente a carbapenêmicos (principalmente ST383) circulando em ambientes ambulatoriais e hospitalares na Romênia, revelando que a truncagem clonal de OmpK35 e a correlação incompleta entre genótipo e fenótipo fundamentam os mecanismos de resistência observados.

Anurag Kumar Bari, Mihai Octavian Dan, Dominique Snel, Alexandra Cireșă, Alexandru Rafila, Daniela Tălăpan, Bhanu Sinha (…)2026-08-31
🧬 biologia

Targeted MS-based salivary profiling enables reliable monitoring of physiological strain and mapping of circadian rhythmicity

Este estudo valida o perfil salivar baseado em espectrometria de massa direcionada como um método escalável e confiável para monitorar a tensão fisiológica e os ritmos circadianos, demonstrando sua capacidade de detectar com precisão mudanças moleculares induzidas pelo exercício em ambientes controlados e rastrear a carga interna em atletas de elite ao longo de 16 meses.

Charlotte Wenzel, Bürkan Kalaycik, Annika Billig, Lorenzo De Gregorio, Sina Trebing, Niklas Joisten, Mathias Kolodziej (…)2026-08-31
🧬 biologia

Bidirectional Semantic Proximity for Protein-GO Association on Heterogeneous Biological Networks

O artigo propõe o BSP (Bidirectional Semantic Proximity), um novo método de predição de função de proteínas que constrói uma rede heterogênea direcionada integrando arestas de PPI bidirecionais, relações hierárquicas de GO e links de anotação para alcançar precisão e generalização superiores através de múltiplas espécies ao alavancar a propagação semântica bidirecional.

peng wang2026-08-31
🧬 biologia

FUSION: a multimodal graph-based structural AI framework for interpretable somatic cancer driver mutation prediction

O artigo apresenta o FUSION, um framework de IA multimodal baseado em grafos que integra embeddings de modelos de linguagem de proteínas, topologia estrutural derivada do AlphaFold2 e ensembles conformacionais para prever e interpretar com precisão mutações condutoras somáticas de câncer, particularmente para variantes de sentido trocado raras que carecem de evidência clínica prévia.

Lucas Moraes dos Santos, Tatiane Senna Bialves, Luana Luiza Bastos, José Gutembergue de Mendonça Silva, Sheila Cruz Arau (…)2026-08-31
🧬 biologia

PRS-CARV: A summary statistics framework for integrating annotation-informed rare variants to improve polygenic risk prediction

O artigo apresenta o PRS-CARV, uma estrutura de estatísticas de resumo que integra escores de carga de variantes raras informados por anotações com escores de risco poligênico de variantes comuns para melhorar significativamente a predição de traços lipídicos e avançar a medicina de precisão.

Yu Zhang, Geyu Zhou, Ming Li, Kelli K. Ryckman, Mitali Ray, Christina Scifres, Nathan R Blue, Alexa Freedman, Jasmina Va (…)2026-08-31
🧬 biologia

Biophysically relevant network model of the piriform cortex predicts odor frequency encoding using network mechanisms

Este estudo utiliza um modelo de rede biofisicamente relevante para demonstrar que o córtex piriforme codifica informações de frequência de odor (2Hz vs. 20Hz) por meio de um mecanismo de população altamente distribuído, onde a atividade média por tentativa permite uma discriminação de alta precisão que é bidirecionalmente modulada por motivos de circuito específicos envolvendo conexões de feedback, feedforward e recorrentes.

Ankit Kumar, Om Chaudhari, Manan Jindal, Ashutosh Modi, Debanjan Dasgupta2026-08-31