🧬 biology

A Meta-analysis of Host Transcriptomic Responses to Tuberculosis Infection

Esta metanálise de seis conjuntos de dados transcriptômicos sanguíneos identifica uma assinatura de hospedeiro altamente reprodutível para a tuberculose ativa, caracterizada por uma robusta ativação imune inata e supressão translacional, ao mesmo tempo em que não encontra uma assinatura consistente baseada no sangue para distinguir a tuberculose latente de controles saudáveis.

Abdullah Ahmad, El-kalam Busair2026-07-22
🧬 biology

Segment-resolved codon usage and host-adaptation signals in piscine orthoreovirus 1

Este estudo estabelece uma referência reprodutível e resolvida por segmento para o uso de códons do ortorreovírus piscino 1, revelando heterogeneidade significativa através de seus dez segmentos genômicos e padrões distintos de adaptação ou incompatibilidade em relação às preferências de codificação do hospedeiro salmão.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Lu-Te Chuang2026-07-22
🧬 biology

Optimization of two-step asymmetric PCR protocol to prepare single-strand DNA for aptamer screening

Este estudo otimiza um protocolo de PCR assimétrico de duas etapas para triagem de aptâmeros, refinando sistematicamente as condições de PCR simétrico e os principais parâmetros assimétricos, identificando, em última análise, as proporções de primers, o número de ciclos e os componentes da reação como fatores críticos para aumentar o rendimento e a pureza do DNA de fita simples.

Huajie Gu, Jiaming Shen, Zihan Chen, Liling Hao2026-07-22
🧬 biology

Simulation-Based Evaluation of Clustering Performance and Allele Frequency Classification in Spatially Structured Populations

Este estudo avalia o desempenho de vários algoritmos de agrupamento baseados em modelos e em grafos sob diferentes condições espaciais e de pré-processamento para fornecer orientação prática para inferir com precisão a estrutura populacional e as frequências alélicas em conjuntos de dados genômicos.

Mael Guivarch, Emmanuelle Génin, Anthony Herzig, Aude Saint Pierre2026-07-22
🧬 biology

BEAM-1: A Biophysics-Informed Multiscale Mathematical Framework for CNS Pharmaceutical Permeability

Este artigo apresenta o BEAM-1, uma estrutura matemática multiescala informada pela biofísica que integra as leis de Fick e de Einstein-Stokes para prever e classificar a permeabilidade da barreira hematoencefálica de 25 fármacos do SNC, identificando com sucesso a Levodopa e o Temozolomida como os mais permeáveis, ao mesmo tempo em que oferece uma alternativa de baixo custo aos testes tradicionais in vitro.

Nithik Uppara Allabanda2026-07-22
🧬 biology

Integrated Bioinformatics Characterization of the Hypothetical Protein RvY_05612 from Ramazzottius varieornatus

Este estudo emprega uma abordagem de bioinformática integrada para caracterizar a proteína hipotética RvY_05612 de *Ramazzottius varieornatus*, identificando-a como uma proteína da família Sec61β, básica, transmembranar e de 98 aminoácidos, localizada no retículo endoplasmático, que provavelmente facilita o transporte de proteínas intracelulares.

Arifa Jahan Bithi, Mahatab Hasan Rahat2026-07-22
🧬 biology

Coordinated suppression of photosynthesis and nitrogen acquisition underlies Citrus bark cracking viroid stunting in hop

Este estudo revela que o nanismo induzido pelo viroide de rachadura da casca de citros no lúpulo é impulsionado por uma supressão persistente e coordenada da fotossíntese e da aquisição de nitrogênio que começa na primavera e leva à perda irreversível de biomassa, em vez de uma resposta dominante de sinalização imunológica.

Michael Hagemann, Swati Jagani, Ute Born, Jernej Jakše2026-07-22
🧬 biology

A Virtual Doctor for ADHD Based on Fully Automated EEG Reading

Este estudo introduz um "médico virtual" totalmente automatizado que diagnostica o TDAH a partir de registros de EEG padrão de 128 canais sem intervenção de especialistas, ao utilizar um pipeline de aprendizado profundo para identificar padrões neurofisiológicos diagnosticamente significativos — especificamente na janela de 150-300 ms — que os métodos estatísticos tradicionais negligenciam, eliminando, assim, o gargalo do especialista humano na interpretação de EEG.

Zhikai Yu, Zijian Zhou, Yaoyao Li, Changming Wang2026-07-22
🧬 biology

Machine learning-assisted SHG morphometry reveals distinct collagen microarchitectures of trabecular bone and fibrosis in bone marrow biopsies

Este estudo estabelece um fluxo de trabalho reprodutível de microscopia SHG assistida por aprendizado de máquina que revela microarquiteturas de colágeno distintas entre fibrose e osso trabecular em biópsias de medula óssea, demonstrando que estratégias de anotação específicas são críticas para a análise morfométrica quantitativa precisa de remodelamento tecidual.

Zakhar P. Asaulenko, Anton A. Egorchev, Dmitry A. Peshekhonov, Leniz F. Nurullin, Anastasiia melnikova, Alexander A. Ros (…)2026-07-22