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Communication-space representation of multicellular tissue organization

O artigo apresenta o CommuSpace, um arcabouço computacional que redefine a organização de tecidos multicelulares ao mapear células em um espaço de comunicação baseado em interações ligante-receptor, revelando, assim, "ecossistemas de comunicação" emergentes como uma camada fundamental de ordem superior da arquitetura tecidual que transcende as classificações tradicionais de identidade celular e nicho espacial.

Hui-Sheng Li, Pai Peng, Yu-Ting Tan, Jia-Juan Tu, Xiao-Fei Zhang, Shou-Feng Shen, Luonan Chen2026-07-24
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Plant architecture reveals contrasting developmental strategies in two threatened West African timber species (Khaya senegalensisand Pterocarpus erinaceus): implications for conservation and sustainable forest management

Este estudo fornece a primeira caracterização arquitetônica abrangente das espécies de madeira ameaçadas da África Ocidental *Khaya senegalensis* e *Pterocarpus erinaceus*, revelando seus distintos modelos de desenvolvimento e respostas plásticas a gradientes ambientais para estabelecer uma base científica para otimizar sua conservação, reflorestamento e manejo sustentável.

Beda Innocent ADJI, Doffou Sélastique Akaffou, Kouadio Henri Kouassi, Marc Jaeger, Sylvie Annabel Sabatier, Jérôme Dumin (…)2026-07-24
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EEG-to-Report: An Annotation and Feature–Text Framework for Training Language Models on Clinical EEG

O artigo apresenta o EEG-to-Report, uma estrutura baseada em navegador que otimiza a anotação clínica de EEG ao integrar ingestão de dados de múltiplos formatos, visualização interativa e extração automatizada de características para gerar pares de características-texto estruturados para o treinamento de modelos de linguagem multimodais e elaboração de rascunhos de relatórios clínicos automatizados.

The Tran2026-07-24
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A Consensus Multifeature Deviation Index for Specific Detection of Locomotor Perturbation From Individualized-Baseline Wearable Inertial Signals

Este artigo introduz o Fardo de Perturbação da Marcha (GPB), um índice de multifunções de consenso não supervisionado que aproveita linhas de base inerciais vestíveis individualizadas para detectar especificamente perturbações locomotoras com redução significativa de falsos positivos durante a marcha normal em comparação com métodos de característica única ou apenas de amplitude.

Alex Kubiak, Farzad Haji Boloori, Jared Nichols2026-07-24
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Phylogeny-associated codon evolution and conditional boundary dinucleotide structure in Platycerium plastomes

Este estudo demonstra que o uso de códons sinônimos nos plastomas de *Platycerium* retém sinais filogenéticos através de linhagens geográficas, ao mesmo tempo em que revela um déficit conservado e evolutivamente significativo de dinucleotídeos CpG nas fronteiras dos códons que persiste apesar de controles rigorosos para composição de sequência e contagem de códons.

Jun-Wei Yang, Cheng-Hsun Lee, Hsuan-Wei Huang, Wei-Mei Hsieh, Su-Lan Hsu2026-07-24
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Human Precursor microRNA Terminal Loop Regions Exhibit Distinct Sequence Characteristics and Motif Enrichment

Este estudo fornece a primeira caracterização abrangente das regiões de alça terminal de pré-miRNAs humanos, revelando arquiteturas de sequência distintas definidas por distribuições de comprimento específicas, vieses de nucleotídeos posicionais e motivos enriquecidos que podem influenciar a biogênese de miRNAs e interações proteicas.

Amit Cohen, Mario Alberto Burgos-Aceves, Yoav Smith2026-07-24✓ Author reviewed ⓘ
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Do Single-Cell Models Learn Real Biology? An Empirical Analysis of Physical Interaction Signal in Pretrained scGPT Gene Embeddings

Este estudo empírico demonstra que os embeddings de tokens de genes pré-treinados do modelo scGPT codificam inerentemente estruturas físicas de interação proteína-proteína, conforme evidenciado por uma similaridade de cosseno significativamente maior entre pares de genes que interagem em comparação com controles não interagentes correspondentes através de múltiplas bases de dados.

Liu Chen2026-07-24
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Mechanistic Interpretability of Biological Foundation Models: An Empirical Analysis of scGPT Gene-Embedding Geometry

Este artigo demonstra empiricamente que o espaço de incorporação estática de gene-token do modelo de fundação scGPT codifica informações detectáveis, embora moderadas, sobre interações proteína-proteína físicas conhecidas, conforme evidenciado por similaridades de cosseno e métricas de predição de interação significativamente mais altas para pares de genes interagentes em comparação com controles não interagentes.

Liu Chen2026-07-24