🧬 biology

Prevotella stercorea links gut microbiome ecology to respiratory infection protection through a host-context-dependent, species-autonomous pathway

Em um estudo longitudinal com crianças gambianas, demonstra-se que a *Prevotella stercorea* protege contra infecções respiratórias agudas por meio de uma via autônoma da espécie e dependente do contexto do hospedeiro, que opera independentemente da riqueza geral do microbioma intestinal, com seus efeitos protetores e interações imunológicas variando significamente com base no estado nutricional da criança (WAZ).

Ogochukwu Ofordile2026-07-20
🧬 biology

Systematic benchmarking of methods to analyze RNA editing in single-cell transcriptomes

Este estudo estabelece um framework sistemático para analisar a edição de RNA A-para-I em transcriptomas de célula única ao comparar diversos métodos através de mais de 1,1 milhão de células, identificando o BCFtools com anotação de fita como o pipeline ideal, e demonstrando como essas ferramentas revelam dinâmicas de edição específicas de tipos celulares remodeladas por contextos de doenças como a síndrome de Down e o câncer.

Meng How Tan, Yan Ting Ng2026-07-20
🧬 biology

The analysis of genetic variants in nine patients with Nemaline Myopathy: Implications for diagnosis and genetic counseling

Este estudo analisou retrospectivamente nove pacientes com Miopatia Nemalínica utilizando sequenciamento do exoma completo e bioinformática para identificar variantes patogênicas nos genes *TPM3*, *NEB* e *ACTA1*, demonstrando como a análise de estabilidade termodinâmica de variantes missense de *NEB* pode aprimorar o diagnóstico, o prognóstico e o aconselhamento genético para este distúrbio geneticamente heterogêneo.

Bingbo Zhou, Chuan Zhang, Xiaojuan Lin, Panpan Ma, Yupei Wang, Lei Zheng, Shengju Hao, Ling Hui, Yunfei Bai2026-07-20
🧬 biology

Z-DNA-induced genomic instability in the human pangenome

Ao alavancar o sequenciamento de leitura longa e o pangenoma humano, este estudo demonstra que as sequências formadoras de Z-DNA são altamente restritas, enriquecidas em regiões repetitivas anteriormente não resolvidas e atuam como impulsionadores significativos da instabilidade genômica por meio de um excesso de pequenas inserções, deleções e variantes estruturais complexas.

Georgios Megalovasilis, Eleftherios Bochalis, Dionysios Chartoumpekis, Karen Vasquez, Ilias Georgakopoulos-Soares2026-07-20
🧬 biology

Nested spatial filters structure the multi-scale distribution of Varroa destructor in overwintering honey bee (Apis mellifera) colonies

Ao utilizar a criofixação para preservar colônias de abelhas melíferas que hibernam em um estado quase nativo, este estudo revela que a distribuição multiescala de *Varroa destructor* é estruturada por filtros espaciais aninhados, que variam desde zonas ao nível da colônia e posições nos quadros até locais específicos de fixação abdominal em abelhas individuais.

Minwoong Son, Heeji Kim, Dong Hee Lee, Sung-Kuk Kim, Su Jin Lee, Kyu-Won Kwak, Su-bae Kim, Kyeong Yong Lee, Bo-Sun Park2026-07-20
🧬 biology

When Simpler Models Win: A Calibration Benchmark of scGPT for Cell-Type Annotation

Este estudo demonstra que modelos de aprendizado de máquina clássicos treinados em conjuntos de genes pareados igualam ou superam consistentemente os pipelines baseados em scGPT tanto em precisão quanto em calibração estatística para anotação de tipos celulares em seis atlas de célula única de larga escala, desafiando a suposta superioridade dos modelos de linguagem de célula única sem bases comparativas rigorosas e pareadas.

Alireza Khosravi, Arshia Khosravi, Kamil Langowski, Michal Sieczczynski, Krzysztof Pastuszak, Anna Supernat, Anna Zaczek2026-07-20
🧬 biology

From Home to Classroom: Gut Microbiome Trajectories and Infection Burden in Kindergarten Beginners

Este estudo longitudinal de crianças que iniciaram o jardim de infância revela que a transição para a escola está associada a um aumento na carga de infecções e a uma reestruturação tardia do microbioma intestinal, caracterizada por uma mudança em direção à dominância de Proteobacteria e pela depleção de *Bacteroides fragilis*, o que se correlaciona com uma maior gravidade dos sintomas.

YunFeng Lu, YuQing Chen, XianTao Kong2026-07-20
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DHCR24 Regulates Endothelial Senescence through the SPHK2/SPNS2-S1P Axis

Este estudo revela que a deficiência de DHCR24 acelera a senescência endotelial ao interromper o eixo SPHK2/SPNS2-S1P, o que reduz os níveis intracelulares de esfingosina-1-fosfato e prejudica a produção de óxido nítrico, estabelecendo assim uma ligação metabólica crítica entre DHCR24 e o envelhecimento vascular.

Wukaiyang Liang, Zhen Yang, Han Li, Hao Nie, Jie Huang, Tianyi Ji, Zixin Wan, Yucong Zhang, Yi Huang, Le Zhang, Lei Ruan (…)2026-07-20